Protein–RNA interactions for Protein: Q06546

GABPA, GA-binding protein alpha chain, humanhuman

Predictions only

Length 454 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABPAQ06546 C16orf54-201ENST00000329410 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
GABPAQ06546 SAP130-203ENST00000357702 4173 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
GABPAQ06546 INTS11-204ENST00000421495 1868 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
GABPAQ06546 ADD2-208ENST00000430656 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
GABPAQ06546 SF3A2-201ENST00000221494 1963 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
GABPAQ06546 AGAP7P-201ENST00000582299 2062 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
GABPAQ06546 AGAP14-201ENST00000624701 2060 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
GABPAQ06546 CRHR2-202ENST00000348438 1600 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
GABPAQ06546 FUK-207ENST00000571514 3054 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
GABPAQ06546 TMEM115-201ENST00000266025 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
GABPAQ06546 MBD1-209ENST00000398495 2178 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
GABPAQ06546 CICP23-201ENST00000605013 2741 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
GABPAQ06546 POLD4-201ENST00000312419 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
GABPAQ06546 AL157392.3-216ENST00000437446 462 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
GABPAQ06546 TNNT1-203ENST00000536926 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
GABPAQ06546 AL132994.2-201ENST00000603120 687 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
GABPAQ06546 AC106872.11-201ENST00000605838 421 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
GABPAQ06546 ZNFX1-AS1_1.1-201ENST00000615787 198 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
GABPAQ06546 LINC01669-205ENST00000624561 713 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
GABPAQ06546 MAPK3-212ENST00000484663 2567 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
GABPAQ06546 NOP2-222ENST00000617555 2017 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
GABPAQ06546 LDLRAD4-205ENST00000585931 2118 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
GABPAQ06546 CIAPIN1-213ENST00000569370 1559 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
GABPAQ06546 ACSL3-201ENST00000357430 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
GABPAQ06546 ASB10-204ENST00000420175 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
GABPAQ06546 DCAF5-201ENST00000341516 5953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
GABPAQ06546 ZFP36-203ENST00000597629 1786 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
GABPAQ06546 ADPRHL1-201ENST00000356501 1877 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
GABPAQ06546 HMGXB3-202ENST00000503427 5275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
GABPAQ06546 LBX1-201ENST00000370193 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
GABPAQ06546 ANXA6-202ENST00000377751 1430 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
GABPAQ06546 RABL6-211ENST00000629216 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
GABPAQ06546 ENAH-203ENST00000366843 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
GABPAQ06546 PLTP-201ENST00000354050 1731 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
GABPAQ06546 SURF4-202ENST00000371989 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
GABPAQ06546 MAEL-202ENST00000367872 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
GABPAQ06546 ULK4-203ENST00000420927 1904 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
GABPAQ06546 NBPF15-202ENST00000488031 4535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
GABPAQ06546 NR4A1-213ENST00000550082 2029 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
GABPAQ06546 MAGEA2-208ENST00000623438 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
GABPAQ06546 TCOF1-206ENST00000445265 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
GABPAQ06546 PIP5K1A-202ENST00000368888 2134 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
GABPAQ06546 LYPD5-202ENST00000414615 2137 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
GABPAQ06546 RBCK1-201ENST00000353660 2511 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
GABPAQ06546 JKAMP-202ENST00000356057 2524 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
GABPAQ06546 TLE3-223ENST00000560939 3021 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
GABPAQ06546 DGKZ-202ENST00000343674 3816 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
GABPAQ06546 RPL35-201ENST00000348462 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
GABPAQ06546 TMEM254-204ENST00000372277 366 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
GABPAQ06546 ETV2-201ENST00000379023 926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
GABPAQ06546 AL662890.1-201ENST00000396818 632 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
GABPAQ06546 THAP4-202ENST00000402136 785 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
GABPAQ06546 ACTG1P2-201ENST00000415776 1125 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
GABPAQ06546 ACTG1P11-201ENST00000425411 1125 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
GABPAQ06546 AL358393.1-201ENST00000456771 532 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
GABPAQ06546 AC125604.1-201ENST00000496255 707 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
GABPAQ06546 SCARNA21-201ENST00000517026 139 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
GABPAQ06546 AC239802.2-201ENST00000532137 554 ntTSL 4 BASIC17.47■□□□□ 0.39
GABPAQ06546 AP000911.1-202ENST00000532706 543 ntTSL 4 BASIC17.47■□□□□ 0.39
GABPAQ06546 C14orf132-204ENST00000556728 774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
GABPAQ06546 ARL16-210ENST00000574938 751 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
GABPAQ06546 KLK3-207ENST00000595952 969 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
GABPAQ06546 C17orf50-202ENST00000604830 477 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
GABPAQ06546 AC084346.2-201ENST00000607097 949 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
GABPAQ06546 AC100757.4-201ENST00000626934 759 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
GABPAQ06546 RPL35-206ENST00000629845 340 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
GABPAQ06546 UCN2-201ENST00000273610 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
GABPAQ06546 ZDHHC24-201ENST00000310442 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
GABPAQ06546 TRMT11-201ENST00000334379 1565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
GABPAQ06546 CCDC51-201ENST00000395694 1560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
GABPAQ06546 ZNF79-201ENST00000342483 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
GABPAQ06546 TM9SF1-202ENST00000396854 2055 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
GABPAQ06546 AC092384.3-202ENST00000564646 2873 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
GABPAQ06546 TMED7-TICAM2-202ENST00000333314 3453 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
GABPAQ06546 BTBD3-201ENST00000254977 4686 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
GABPAQ06546 TCP11L1-201ENST00000334274 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
GABPAQ06546 AHCY-201ENST00000217426 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
GABPAQ06546 CDPF1-203ENST00000404583 1439 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
GABPAQ06546 NPHP3-AS1-201ENST00000489343 2957 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
GABPAQ06546 PLPPR4-203ENST00000457765 4846 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
GABPAQ06546 ANKRD26-201ENST00000376087 6591 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
GABPAQ06546 NXN-210ENST00000575801 2681 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
GABPAQ06546 MIER1-208ENST00000401041 2552 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
GABPAQ06546 DUSP18-201ENST00000334679 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
GABPAQ06546 AL589740.1-203ENST00000433637 1984 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
GABPAQ06546 STAC-201ENST00000273183 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
GABPAQ06546 ANXA6-211ENST00000521512 1793 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
GABPAQ06546 AL590440.2-201ENST00000641973 1595 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
GABPAQ06546 NDUFA11-202ENST00000418389 2406 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
GABPAQ06546 MAX-201ENST00000246163 897 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
GABPAQ06546 IFITM5-201ENST00000382614 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
GABPAQ06546 CRIP1-202ENST00000392531 485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
GABPAQ06546 SLC16A6P1-201ENST00000413214 1059 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
GABPAQ06546 CPLX2-209ENST00000515094 576 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.46■□□□□ 0.39
GABPAQ06546 RNA5SP423-201ENST00000517127 109 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
GABPAQ06546 RERG-205ENST00000537647 935 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
GABPAQ06546 AC009779.1-201ENST00000551138 283 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
GABPAQ06546 AC105129.2-201ENST00000559536 390 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
GABPAQ06546 GFER-204ENST00000567719 483 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
GABPAQ06546 AC023824.4-202ENST00000569557 849 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.2 ms