Protein–RNA interactions for Protein: Q06323

PSME1, Proteasome activator complex subunit 1, humanhuman

Predictions only

Length 249 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSME1Q06323 DHX33-201ENST00000225296 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PSME1Q06323 AC007292.2-201ENST00000593524 1812 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
PSME1Q06323 HORMAD1-201ENST00000322343 1771 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PSME1Q06323 TMEM144-209ENST00000509278 1633 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PSME1Q06323 TOMM20L-201ENST00000360945 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PSME1Q06323 KRT18P36-201ENST00000411618 1276 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
PSME1Q06323 HNRNPA1P27-201ENST00000412087 955 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
PSME1Q06323 AL157788.1-201ENST00000437838 229 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PSME1Q06323 SNHG14-206ENST00000450809 677 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PSME1Q06323 LINC01598-205ENST00000508763 719 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PSME1Q06323 ALG1L6P-201ENST00000515248 758 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
PSME1Q06323 SDHAF2-206ENST00000542074 835 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PSME1Q06323 JMJD8-203ENST00000562824 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PSME1Q06323 AC084781.1-201ENST00000613737 656 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
PSME1Q06323 AC005618.3-201ENST00000624928 458 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
PSME1Q06323 MAPK8IP1-202ENST00000395629 3180 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PSME1Q06323 CDK11B-201ENST00000340677 2534 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PSME1Q06323 GORAB-202ENST00000367763 2189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PSME1Q06323 MDGA2-202ENST00000399232 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PSME1Q06323 JAG1-201ENST00000254958 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PSME1Q06323 MAPT-205ENST00000351559 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PSME1Q06323 SLC2A9-201ENST00000264784 1850 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PSME1Q06323 PTPN5-201ENST00000358540 3135 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PSME1Q06323 WASF1-206ENST00000392588 3122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PSME1Q06323 KIAA0513-207ENST00000567328 1873 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PSME1Q06323 VARS-215ENST00000375663 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PSME1Q06323 SPO11-203ENST00000371263 1834 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PSME1Q06323 ZNF672-201ENST00000306562 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PSME1Q06323 EIF4G3-212ENST00000602326 6196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PSME1Q06323 CEP128-201ENST00000216517 1606 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PSME1Q06323 CD24-204ENST00000619133 2513 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PSME1Q06323 CDH24-204ENST00000487137 3438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PSME1Q06323 DCLK2-201ENST00000296550 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PSME1Q06323 PCNA-202ENST00000379160 1359 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PSME1Q06323 AHCYP4-201ENST00000419201 1315 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
PSME1Q06323 TADA1-201ENST00000367874 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PSME1Q06323 PLAC8L1-201ENST00000311450 638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PSME1Q06323 BAK1P1-201ENST00000317045 636 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
PSME1Q06323 PCBP3-201ENST00000400304 1086 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PSME1Q06323 AC092265.1-201ENST00000422638 498 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PSME1Q06323 LINC00278-201ENST00000425031 528 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PSME1Q06323 AC092638.2-201ENST00000441105 947 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
PSME1Q06323 PCBP3-208ENST00000449640 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PSME1Q06323 MRPL22P1-201ENST00000505398 616 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
PSME1Q06323 PCMTD1-207ENST00000522514 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PSME1Q06323 RPS25-202ENST00000527673 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PSME1Q06323 JKAMP-207ENST00000554271 2137 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PSME1Q06323 PPCDC-205ENST00000563393 1149 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PSME1Q06323 PPCDC-208ENST00000567336 892 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PSME1Q06323 INCA1-203ENST00000575780 1221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PSME1Q06323 MLF1-216ENST00000618075 2116 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PSME1Q06323 AC079325.2-202ENST00000641031 462 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PSME1Q06323 EHD3-201ENST00000322054 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PSME1Q06323 AP001781.3-201ENST00000622211 2939 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PSME1Q06323 HACE1-201ENST00000262903 4576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PSME1Q06323 STC2-201ENST00000265087 5353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PSME1Q06323 TMA16-201ENST00000358572 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PSME1Q06323 ANKRD44-203ENST00000409153 2724 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PSME1Q06323 BAIAP2-201ENST00000321280 1939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PSME1Q06323 MAP2K7-201ENST00000397979 3361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PSME1Q06323 ATG9B-212ENST00000639579 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PSME1Q06323 PDE2A-226ENST00000544570 3119 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PSME1Q06323 BRD3-201ENST00000303407 5652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PSME1Q06323 SLC2A6-201ENST00000371897 2301 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PSME1Q06323 CDKN1A-203ENST00000405375 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PSME1Q06323 SPATS2L-218ENST00000451764 2250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PSME1Q06323 RAB5B-202ENST00000448789 1530 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PSME1Q06323 LINC00094-205ENST00000603928 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PSME1Q06323 TJP1-201ENST00000346128 7950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PSME1Q06323 SGK2-206ENST00000423407 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PSME1Q06323 RANBP1-208ENST00000430524 1389 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PSME1Q06323 AC090502.4-201ENST00000551714 1386 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
PSME1Q06323 C21orf58-201ENST00000291691 2975 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PSME1Q06323 AC004834.1-201ENST00000640784 2412 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PSME1Q06323 CLN5-208ENST00000636183 6664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PSME1Q06323 KRTAP19-5-201ENST00000334151 461 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PSME1Q06323 AZGP1P1-202ENST00000425474 1181 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PSME1Q06323 MIR503HG-202ENST00000440570 760 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PSME1Q06323 ZNF529-AS1-201ENST00000448373 1004 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PSME1Q06323 AL139420.2-201ENST00000449439 410 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PSME1Q06323 AC010234.1-201ENST00000494599 870 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
PSME1Q06323 ORAOV1P1-201ENST00000503108 395 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
PSME1Q06323 REEP5-205ENST00000504247 480 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PSME1Q06323 REEP5-207ENST00000513339 1139 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PSME1Q06323 POLD4-208ENST00000532830 904 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PSME1Q06323 DCTPP1-202ENST00000565758 749 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PSME1Q06323 MIR3180-2-201ENST00000581748 88 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
PSME1Q06323 AC104333.4-201ENST00000632866 554 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PSME1Q06323 HHIP-202ENST00000434550 1770 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PSME1Q06323 ZC2HC1C-201ENST00000238686 2249 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PSME1Q06323 DYNC1I1-212ENST00000630942 2249 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PSME1Q06323 GRAMD2B-217ENST00000515200 3109 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PSME1Q06323 SCLT1-209ENST00000511426 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PSME1Q06323 SERTAD1-201ENST00000357949 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PSME1Q06323 CAMK2B-206ENST00000353625 1624 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PSME1Q06323 DCP1B-201ENST00000280665 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PSME1Q06323 TOMM22-201ENST00000216034 2040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PSME1Q06323 AL513523.2-202ENST00000427283 2040 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
PSME1Q06323 EXD3-201ENST00000340951 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PSME1Q06323 RALGAPA1-219ENST00000637992 8512 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.6 ms