Protein–RNA interactions for Protein: Q06124

PTPN11, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 11, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 597 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN11Q06124 SIGLEC10-201ENST00000339313 2256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PTPN11Q06124 TFB2M-201ENST00000366514 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PTPN11Q06124 MPZL2-202ENST00000438295 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PTPN11Q06124 AHCY-201ENST00000217426 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PTPN11Q06124 USP42-201ENST00000306177 5155 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PTPN11Q06124 CENPK-202ENST00000396679 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PTPN11Q06124 AL008718.2-201ENST00000609206 1313 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
PTPN11Q06124 MYL12B-201ENST00000237500 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PTPN11Q06124 NUDT1-203ENST00000356714 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PTPN11Q06124 CD1E-202ENST00000368155 696 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PTPN11Q06124 CD1E-204ENST00000368157 399 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PTPN11Q06124 DPCD-202ENST00000370151 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PTPN11Q06124 EDF1-202ENST00000371648 809 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PTPN11Q06124 C6orf136-202ENST00000376471 614 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PTPN11Q06124 UFM1-202ENST00000379649 846 ntTSL 4 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PTPN11Q06124 NUDT1-204ENST00000397046 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PTPN11Q06124 HNRNPA1P41-201ENST00000397777 928 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
PTPN11Q06124 PDIA3P2-201ENST00000428073 158 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
PTPN11Q06124 RCC2P8-201ENST00000502779 1035 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
PTPN11Q06124 CPLX2-209ENST00000515094 576 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PTPN11Q06124 CCNC-217ENST00000523985 958 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PTPN11Q06124 GATD1-205ENST00000524550 995 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PTPN11Q06124 AC124301.1-201ENST00000524885 602 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PTPN11Q06124 EEF1D-218ENST00000526838 926 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PTPN11Q06124 AC090857.1-201ENST00000527400 390 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
PTPN11Q06124 AP001547.1-201ENST00000527440 374 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PTPN11Q06124 AC117500.3-201ENST00000537032 666 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PTPN11Q06124 ERICH5-202ENST00000545282 596 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PTPN11Q06124 AC103988.2-201ENST00000561804 725 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
PTPN11Q06124 PAM16-211ENST00000575848 518 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PTPN11Q06124 PAM16-214ENST00000576217 493 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PTPN11Q06124 GCLM-201ENST00000370238 4857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PTPN11Q06124 UNC13A-204ENST00000550896 5200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PTPN11Q06124 ILF3-210ENST00000588657 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PTPN11Q06124 DGAT2L6-201ENST00000333026 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PTPN11Q06124 ARHGEF1-204ENST00000378152 2986 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PTPN11Q06124 TANGO2-205ENST00000401886 1559 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PTPN11Q06124 ANKMY2-201ENST00000306999 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PTPN11Q06124 RBFOX1-205ENST00000436368 1530 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PTPN11Q06124 HSP90B1-201ENST00000299767 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PTPN11Q06124 PES1-204ENST00000402284 2144 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PTPN11Q06124 ADCYAP1R1-204ENST00000409489 1761 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PTPN11Q06124 DLX4-202ENST00000411890 1404 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PTPN11Q06124 MYL6-219ENST00000551589 1438 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PTPN11Q06124 PTOV1-214ENST00000600603 1443 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PTPN11Q06124 HAUS2-208ENST00000568876 1702 ntTSL 4 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PTPN11Q06124 ALG9-201ENST00000398006 2345 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PTPN11Q06124 ATP6V0E2-207ENST00000479613 1666 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PTPN11Q06124 AC006058.4-201ENST00000624016 1670 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
PTPN11Q06124 WDR45B-201ENST00000392325 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PTPN11Q06124 CACFD1-206ENST00000540581 2880 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PTPN11Q06124 LAP3-201ENST00000226299 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PTPN11Q06124 ULK4-203ENST00000420927 1904 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PTPN11Q06124 AC104667.2-202ENST00000452801 1301 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PTPN11Q06124 KLK11-207ENST00000594768 1347 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PTPN11Q06124 C11orf52-201ENST00000278601 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PTPN11Q06124 TCEAL6-201ENST00000372773 983 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PTPN11Q06124 NCR3-204ENST00000376073 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PTPN11Q06124 APRT-201ENST00000378364 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PTPN11Q06124 TLE1P1-201ENST00000422965 589 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
PTPN11Q06124 MIR663AHG-201ENST00000427348 1213 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PTPN11Q06124 AC009403.1-204ENST00000469539 597 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PTPN11Q06124 PIGH-209ENST00000559581 1049 ntTSL 4 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PTPN11Q06124 AC015660.1-201ENST00000560103 395 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PTPN11Q06124 AC011825.3-201ENST00000583184 565 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PTPN11Q06124 AC090386.1-202ENST00000586610 469 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PTPN11Q06124 AC009884.2-201ENST00000603110 324 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
PTPN11Q06124 AC091100.1-201ENST00000558424 2354 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PTPN11Q06124 CTCFL-210ENST00000481655 1512 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PTPN11Q06124 STT3B-201ENST00000295770 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PTPN11Q06124 SGK3-211ENST00000522398 3106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PTPN11Q06124 ANKRD17-201ENST00000330838 7734 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PTPN11Q06124 UVSSA-206ENST00000507531 2597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PTPN11Q06124 SLC41A3-211ENST00000508835 1480 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PTPN11Q06124 OXA1L-201ENST00000285848 1719 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PTPN11Q06124 AC126177.1-201ENST00000547829 2218 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
PTPN11Q06124 ASAH1-249ENST00000637528 2215 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PTPN11Q06124 ORAOV1-201ENST00000279147 2478 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PTPN11Q06124 RGPD8-201ENST00000302558 5576 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PTPN11Q06124 FLJ42969-201ENST00000514926 1948 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PTPN11Q06124 GPRIN1-201ENST00000303991 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PTPN11Q06124 PRMT6-201ENST00000370078 2616 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
PTPN11Q06124 LYRM1-203ENST00000412082 1399 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PTPN11Q06124 LIPE-AS1-205ENST00000594688 2383 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
PTPN11Q06124 CANX-201ENST00000247461 4260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PTPN11Q06124 ATG9A-205ENST00000409618 4025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
PTPN11Q06124 PPHLN1-201ENST00000256678 1820 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
PTPN11Q06124 MGRN1-206ENST00000586183 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
PTPN11Q06124 SH3BP4-203ENST00000409212 5231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
PTPN11Q06124 SMARCE1-205ENST00000431889 1569 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
PTPN11Q06124 UBE2V2-205ENST00000521346 1322 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
PTPN11Q06124 AC006480.2-201ENST00000609770 1337 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
PTPN11Q06124 PNPLA5-202ENST00000381198 2000 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
PTPN11Q06124 CHRNA7-217ENST00000636603 2012 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
PTPN11Q06124 PPM1F-202ENST00000397495 1778 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
PTPN11Q06124 SPERT-204ENST00000610924 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
PTPN11Q06124 TGOLN2-205ENST00000409232 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PTPN11Q06124 NDUFB8-201ENST00000299166 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PTPN11Q06124 IGF1-201ENST00000307046 1097 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PTPN11Q06124 NCR3-201ENST00000340027 1042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.2 ms