Protein–RNA interactions for Protein: Q03989

ARID5A, AT-rich interactive domain-containing protein 5A, humanhuman

Predictions only

Length 594 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARID5AQ03989 COPE-202ENST00000349893 948 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ARID5AQ03989 OSM-203ENST00000403463 464 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ARID5AQ03989 LINC00659-201ENST00000412500 540 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ARID5AQ03989 SPTLC1P1-201ENST00000447199 261 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
ARID5AQ03989 AL451067.1-201ENST00000453111 394 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ARID5AQ03989 MRNIP-220ENST00000523084 1096 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ARID5AQ03989 CDK4-206ENST00000549606 558 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ARID5AQ03989 AC005225.4-201ENST00000557330 545 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
ARID5AQ03989 AC099482.1-201ENST00000563471 481 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ARID5AQ03989 RNA5-8SN1-201ENST00000610460 153 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
ARID5AQ03989 RNA5-8SN5-202ENST00000612463 153 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
ARID5AQ03989 RNA5-8SN4-201ENST00000613359 153 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
ARID5AQ03989 AL662799.1-202ENST00000614205 422 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
ARID5AQ03989 RNA5-8SN5-201ENST00000619471 153 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
ARID5AQ03989 AC004840.1-201ENST00000636359 365 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
ARID5AQ03989 LINC00592-202ENST00000640420 768 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ARID5AQ03989 AC004834.1-204ENST00000640670 1055 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ARID5AQ03989 PPFIA3-203ENST00000602351 4341 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ARID5AQ03989 GOLGA8M-201ENST00000563027 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ARID5AQ03989 HIST1H2AG-201ENST00000359193 2250 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ARID5AQ03989 AIFM1-209ENST00000535724 2468 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ARID5AQ03989 RAB37-206ENST00000392615 2655 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ARID5AQ03989 MAGIX-208ENST00000616266 3295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ARID5AQ03989 CCNDBP1-201ENST00000300213 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ARID5AQ03989 RIMS1-214ENST00000518273 4116 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ARID5AQ03989 TMEM209-202ENST00000462753 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ARID5AQ03989 PITX2-205ENST00000394598 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ARID5AQ03989 LTA-214ENST00000454783 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ARID5AQ03989 SNRPN-201ENST00000346403 1304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ARID5AQ03989 HNRNPLL-205ENST00000409636 3980 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ARID5AQ03989 LINC01301-205ENST00000531654 1347 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ARID5AQ03989 ASAP1-202ENST00000518721 5507 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ARID5AQ03989 TJP3-207ENST00000589378 3068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ARID5AQ03989 MPPED2-202ENST00000448418 5591 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ARID5AQ03989 SIGLEC5-201ENST00000534261 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ARID5AQ03989 TRIM67-201ENST00000366653 3936 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ARID5AQ03989 PRSS8-201ENST00000317508 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ARID5AQ03989 ATXN10-202ENST00000381061 3135 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ARID5AQ03989 TDRD10-201ENST00000368480 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ARID5AQ03989 ANKEF1-201ENST00000378380 5303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ARID5AQ03989 PML-201ENST00000268058 4508 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ARID5AQ03989 GPSM3-207ENST00000375043 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ARID5AQ03989 PSD-209ENST00000611678 3382 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ARID5AQ03989 TAF5-201ENST00000369839 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ARID5AQ03989 TEX13C-201ENST00000632600 5095 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ARID5AQ03989 SLC4A7-212ENST00000446700 4000 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ARID5AQ03989 DDX17-202ENST00000396821 4791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ARID5AQ03989 NME3-201ENST00000219302 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ARID5AQ03989 PABPN1L-202ENST00000419291 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ARID5AQ03989 LEPROTL1-202ENST00000442880 908 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ARID5AQ03989 PSEN2-206ENST00000472139 1163 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ARID5AQ03989 PDP1-203ENST00000517764 2140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ARID5AQ03989 AL132655.2-201ENST00000596276 594 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
ARID5AQ03989 IFI27-206ENST00000612813 725 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ARID5AQ03989 IFI27-213ENST00000620066 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ARID5AQ03989 UBE3A-207ENST00000614096 8741 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ARID5AQ03989 ZNF785-202ENST00000470110 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ARID5AQ03989 CATSPER4-202ENST00000456354 1912 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ARID5AQ03989 HIPK4-201ENST00000291823 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ARID5AQ03989 TPO-201ENST00000329066 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ARID5AQ03989 CLN3-201ENST00000333496 1608 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ARID5AQ03989 TRIM13-201ENST00000356017 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ARID5AQ03989 AFDN-205ENST00000392108 6812 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ARID5AQ03989 AC060234.2-201ENST00000428825 1610 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ARID5AQ03989 AC090099.1-203ENST00000527059 2945 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ARID5AQ03989 ELP1-201ENST00000374647 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ARID5AQ03989 IGHA1-202ENST00000641837 1310 ntAPPRIS P5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ARID5AQ03989 RPS6KL1-210ENST00000555647 3309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ARID5AQ03989 LRP8-201ENST00000306052 7648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ARID5AQ03989 NCOR2-203ENST00000404621 8520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ARID5AQ03989 NOP2-222ENST00000617555 2017 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ARID5AQ03989 MAGEA2-209ENST00000623806 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ARID5AQ03989 LARP4-219ENST00000614335 1949 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ARID5AQ03989 KRT9-202ENST00000588431 1493 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ARID5AQ03989 AKNA-206ENST00000374088 5464 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ARID5AQ03989 PHF3-209ENST00000509330 2969 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ARID5AQ03989 SLC4A7-210ENST00000440156 4120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ARID5AQ03989 PSMB6-201ENST00000270586 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ARID5AQ03989 TSPAN4-201ENST00000346501 882 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ARID5AQ03989 MAP9-202ENST00000379248 1165 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ARID5AQ03989 FAM166B-201ENST00000399742 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ARID5AQ03989 LINC00351-201ENST00000424926 911 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ARID5AQ03989 TMPRSS11CP-201ENST00000453277 683 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
ARID5AQ03989 AC004066.1-201ENST00000502488 802 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
ARID5AQ03989 CFL1-212ENST00000531413 636 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ARID5AQ03989 AC104794.3-201ENST00000566840 1248 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
ARID5AQ03989 INO80C-210ENST00000590757 595 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ARID5AQ03989 SRD5A3P1-201ENST00000603021 949 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
ARID5AQ03989 PSMB6-205ENST00000614486 871 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ARID5AQ03989 PAX6-202ENST00000379107 2579 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ARID5AQ03989 CNNM2-203ENST00000433628 3857 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ARID5AQ03989 PDHX-201ENST00000227868 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ARID5AQ03989 WHRN-202ENST00000362057 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ARID5AQ03989 FXN-201ENST00000377270 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ARID5AQ03989 GEMIN7-201ENST00000270257 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ARID5AQ03989 SPDYE6-201ENST00000563237 1691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ARID5AQ03989 TNFAIP8L3-201ENST00000327536 2262 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ARID5AQ03989 SLC29A1-204ENST00000371731 2258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ARID5AQ03989 RNF182-208ENST00000544682 3495 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ARID5AQ03989 STIP1-207ENST00000538945 1900 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60 ms