Protein–RNA interactions for Protein: Q02809

PLOD1, Procollagen-lysine,2-oxoglutarate 5-dioxygenase 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 727 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLOD1Q02809 ACTL6A-203ENST00000450518 1750 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PLOD1Q02809 AC148477.4-201ENST00000613430 1793 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
PLOD1Q02809 GAK-201ENST00000314167 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PLOD1Q02809 CCNL1-202ENST00000295926 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PLOD1Q02809 MRPL11-201ENST00000310999 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PLOD1Q02809 SLC20A2-208ENST00000520262 2992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PLOD1Q02809 CCDC40-202ENST00000374876 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PLOD1Q02809 AZGP1-202ENST00000411734 2027 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PLOD1Q02809 AMIGO2-201ENST00000266581 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PLOD1Q02809 ALDH3B2-201ENST00000349015 2649 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PLOD1Q02809 WASH2P-202ENST00000538033 2800 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PLOD1Q02809 INPP5B-204ENST00000373026 3230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PLOD1Q02809 LCE3A-201ENST00000335674 270 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PLOD1Q02809 FAM104B-202ENST00000358460 1179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PLOD1Q02809 HOPX-203ENST00000381255 1164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PLOD1Q02809 TEN1-201ENST00000397640 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PLOD1Q02809 MAGEC1-202ENST00000406005 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PLOD1Q02809 AC073283.1-201ENST00000421759 860 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PLOD1Q02809 EEF1D-207ENST00000524624 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PLOD1Q02809 HOPX-210ENST00000553379 1001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PLOD1Q02809 HOPX-212ENST00000555760 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PLOD1Q02809 HOPX-213ENST00000556376 1064 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PLOD1Q02809 SAMD11P1-201ENST00000571429 661 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
PLOD1Q02809 AC129507.3-201ENST00000571512 913 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PLOD1Q02809 RPL36-203ENST00000577222 874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PLOD1Q02809 AC005262.2-201ENST00000587701 452 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PLOD1Q02809 AC008770.3-202ENST00000591944 567 ntTSL 4 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PLOD1Q02809 AC015819.2-201ENST00000618730 555 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PLOD1Q02809 TCOF1-201ENST00000323668 4832 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PLOD1Q02809 LRRC6-213ENST00000620350 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PLOD1Q02809 AGAP7P-201ENST00000582299 2062 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
PLOD1Q02809 AGAP14-201ENST00000624701 2060 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
PLOD1Q02809 EID1-201ENST00000530028 2298 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PLOD1Q02809 PTPN5-204ENST00000396170 3871 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PLOD1Q02809 FLII-201ENST00000327031 4338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PLOD1Q02809 RAF1-201ENST00000251849 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PLOD1Q02809 AP1M1-211ENST00000590756 1705 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PLOD1Q02809 SGCE-205ENST00000437425 1508 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PLOD1Q02809 KLRG1-201ENST00000266551 1335 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PLOD1Q02809 IL25-201ENST00000329715 1315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PLOD1Q02809 RGR-201ENST00000358110 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PLOD1Q02809 ADPRHL1-202ENST00000375418 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PLOD1Q02809 DEPTOR-201ENST00000286234 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PLOD1Q02809 GPI-205ENST00000586425 1799 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PLOD1Q02809 CEACAM16-201ENST00000405314 1583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PLOD1Q02809 FBXO3-203ENST00000526785 5798 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PLOD1Q02809 PTK7-210ENST00000471863 2412 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PLOD1Q02809 LIMK2-204ENST00000406516 2657 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PLOD1Q02809 RNF183-201ENST00000297894 1830 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PLOD1Q02809 PIK3IP1-201ENST00000215912 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PLOD1Q02809 DNAJB1-201ENST00000254322 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PLOD1Q02809 HNRNPUL1-205ENST00000593587 2725 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PLOD1Q02809 SERP1-201ENST00000239944 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PLOD1Q02809 OSBPL8-203ENST00000393250 3157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PLOD1Q02809 KRT8P22-201ENST00000562317 1415 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
PLOD1Q02809 DARS-AS1-209ENST00000594219 1420 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PLOD1Q02809 USP28-214ENST00000545540 3431 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PLOD1Q02809 PRKY-203ENST00000528056 7218 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PLOD1Q02809 GGA1-206ENST00000406772 3205 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PLOD1Q02809 AAAS-217ENST00000550286 1652 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PLOD1Q02809 TJAP1-207ENST00000436109 2572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PLOD1Q02809 AC012508.2-201ENST00000567613 1472 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
PLOD1Q02809 PTENP1-202ENST00000532280 3996 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
PLOD1Q02809 KLHDC7A-201ENST00000400664 5145 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PLOD1Q02809 TRPC6-203ENST00000360497 2631 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PLOD1Q02809 ST3GAL3-209ENST00000361400 2195 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PLOD1Q02809 WRAP53-210ENST00000534050 1736 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PLOD1Q02809 YTHDF3-216ENST00000623280 5193 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PLOD1Q02809 HIC2-202ENST00000407598 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PLOD1Q02809 AC005912.2-201ENST00000619492 2400 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
PLOD1Q02809 SCAND1-201ENST00000305978 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PLOD1Q02809 PGGT1B-202ENST00000379615 903 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PLOD1Q02809 AP006294.1-201ENST00000415407 339 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
PLOD1Q02809 AC098850.1-201ENST00000419919 790 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
PLOD1Q02809 THPO-202ENST00000421442 1132 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PLOD1Q02809 FYCO1-203ENST00000438446 1072 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PLOD1Q02809 AC011495.1-201ENST00000498085 584 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
PLOD1Q02809 AC139713.2-206ENST00000499587 566 ntTSL 4 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PLOD1Q02809 AC026774.1-201ENST00000503652 691 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PLOD1Q02809 NEU3-203ENST00000529024 581 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PLOD1Q02809 AL391261.2-201ENST00000554907 773 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PLOD1Q02809 LINC01220-201ENST00000558575 715 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PLOD1Q02809 AC124283.3-201ENST00000570869 594 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
PLOD1Q02809 ANAPC11-216ENST00000579133 563 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PLOD1Q02809 SMIM22-202ENST00000586440 549 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PLOD1Q02809 SMCO4-206ENST00000596676 180 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PLOD1Q02809 LINC01515-215ENST00000608678 854 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PLOD1Q02809 GRB7-203ENST00000394209 1955 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PLOD1Q02809 SEC16A-202ENST00000290037 8982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PLOD1Q02809 TEKT2-201ENST00000207457 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PLOD1Q02809 SHOX2-202ENST00000425436 1513 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PLOD1Q02809 NOX5-203ENST00000448182 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PLOD1Q02809 GTF2IRD1-201ENST00000265755 3430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PLOD1Q02809 CTSD-207ENST00000636571 1790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PLOD1Q02809 SHMT2-202ENST00000414700 2006 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PLOD1Q02809 AC117489.1-201ENST00000625169 3217 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
PLOD1Q02809 APBB1IP-202ENST00000376236 2771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PLOD1Q02809 ZNF324-201ENST00000196482 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PLOD1Q02809 ZNF485-201ENST00000361807 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PLOD1Q02809 RSPH9-202ENST00000372165 2586 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.7 ms