Protein–RNA interactions for Protein: Q02742

GCNT1, Beta-1,3-galactosyl-O-glycosyl-glycoprotein beta-1,6-N-acetylglucosaminyltransferase, humanhuman

Predictions only

Length 428 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCNT1Q02742 VWA7-201ENST00000375688 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
GCNT1Q02742 SLC7A4-202ENST00000403586 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GCNT1Q02742 FGD1-201ENST00000375135 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GCNT1Q02742 CLIC5-208ENST00000544153 2051 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
GCNT1Q02742 TANGO2-205ENST00000401886 1559 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
GCNT1Q02742 AGTPBP1-208ENST00000628899 4222 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
GCNT1Q02742 XPNPEP1-218ENST00000502935 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GCNT1Q02742 RASSF5-201ENST00000577571 3496 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GCNT1Q02742 RPA3-201ENST00000223129 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GCNT1Q02742 TUBA8-202ENST00000330423 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GCNT1Q02742 TNXB-208ENST00000611016 6083 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
GCNT1Q02742 EIF4G1-209ENST00000414031 5569 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GCNT1Q02742 FKBP6-201ENST00000252037 1500 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GCNT1Q02742 ST3GAL3-208ENST00000361392 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GCNT1Q02742 DYNLRB2-201ENST00000305904 497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GCNT1Q02742 IGLV4-69-201ENST00000390282 419 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
GCNT1Q02742 PEX13-202ENST00000401576 1108 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GCNT1Q02742 CD8B2-202ENST00000417670 633 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
GCNT1Q02742 UFL1-AS1-201ENST00000430796 548 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
GCNT1Q02742 DNAJC19-208ENST00000486355 828 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
GCNT1Q02742 ALG3P1-201ENST00000508806 1114 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
GCNT1Q02742 AC022447.6-201ENST00000515522 438 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
GCNT1Q02742 AC138123.2-203ENST00000552451 653 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
GCNT1Q02742 AC005225.4-201ENST00000557330 545 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
GCNT1Q02742 RPL28-206ENST00000558752 671 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
GCNT1Q02742 AC004637.1-201ENST00000586675 482 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
GCNT1Q02742 FLT3LG-205ENST00000596435 1034 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
GCNT1Q02742 FP565260.6-205ENST00000624120 898 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GCNT1Q02742 PDP1-201ENST00000297598 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GCNT1Q02742 CYP4F11-202ENST00000326742 2877 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GCNT1Q02742 ZNF79-202ENST00000543471 2194 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
GCNT1Q02742 ZNF79-203ENST00000612342 2192 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
GCNT1Q02742 DMAC2-204ENST00000438807 1454 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GCNT1Q02742 CATSPER4-202ENST00000456354 1912 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GCNT1Q02742 TSFM-207ENST00000540550 1935 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
GCNT1Q02742 RUBCNL-212ENST00000631139 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
GCNT1Q02742 SLC38A5-212ENST00000619100 2100 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
GCNT1Q02742 SLC38A5-214ENST00000622196 2100 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
GCNT1Q02742 SMPDL3A-201ENST00000368440 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GCNT1Q02742 THRA-203ENST00000450525 4895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GCNT1Q02742 RNPS1-216ENST00000565678 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GCNT1Q02742 SPON1-201ENST00000576479 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GCNT1Q02742 DHPS-201ENST00000210060 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GCNT1Q02742 CD1B-201ENST00000368168 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GCNT1Q02742 CALCOCO2-211ENST00000508679 1396 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
GCNT1Q02742 B4GALT3-213ENST00000622395 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GCNT1Q02742 ALDH8A1-204ENST00000367847 1587 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
GCNT1Q02742 FXN-201ENST00000377270 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GCNT1Q02742 PGBD5-202ENST00000525115 1569 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
GCNT1Q02742 TMCO5B-204ENST00000529696 1568 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
GCNT1Q02742 MVK-214ENST00000629016 1591 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
GCNT1Q02742 MUM1-201ENST00000415183 2837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GCNT1Q02742 TRMT1-201ENST00000221504 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GCNT1Q02742 AC097359.2-201ENST00000604992 2389 ntBASIC16■□□□□ 0.15
GCNT1Q02742 MAOB-201ENST00000378069 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GCNT1Q02742 PRR23C-201ENST00000413199 2791 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
GCNT1Q02742 PPP1R26-204ENST00000604351 4640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
GCNT1Q02742 ERN2-202ENST00000457008 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GCNT1Q02742 FKBP4P6-201ENST00000457486 1332 ntBASIC16■□□□□ 0.15
GCNT1Q02742 MRPL37P1-201ENST00000592451 1337 ntBASIC16■□□□□ 0.15
GCNT1Q02742 BTNL8-206ENST00000508408 1717 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GCNT1Q02742 PCDHA6-203ENST00000529310 5374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GCNT1Q02742 ZNF576-203ENST00000525771 2327 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
GCNT1Q02742 VAT1-201ENST00000355653 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GCNT1Q02742 AC027601.1-201ENST00000575922 4506 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
GCNT1Q02742 PPP1R16B-202ENST00000373331 6106 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
GCNT1Q02742 XKR5-201ENST00000618742 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GCNT1Q02742 ZNF385A-205ENST00000546970 2494 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GCNT1Q02742 INE2-201ENST00000630399 1874 ntBASIC16■□□□□ 0.15
GCNT1Q02742 FIS1-201ENST00000223136 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GCNT1Q02742 VHLL-201ENST00000339922 676 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
GCNT1Q02742 CNN2P8-201ENST00000421872 913 ntBASIC16■□□□□ 0.15
GCNT1Q02742 AL356805.1-201ENST00000556383 341 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
GCNT1Q02742 MRPL52-216ENST00000557221 922 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
GCNT1Q02742 LINC02084-201ENST00000606069 1096 ntBASIC16■□□□□ 0.15
GCNT1Q02742 SCYL1-201ENST00000270176 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GCNT1Q02742 BIRC5-203ENST00000374948 2446 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GCNT1Q02742 AC005089.1-201ENST00000619486 2241 ntBASIC16■□□□□ 0.15
GCNT1Q02742 SIN3B-202ENST00000379803 5129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GCNT1Q02742 FCHSD2-204ENST00000409418 3154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
GCNT1Q02742 SELENOS-201ENST00000398226 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GCNT1Q02742 SIGLEC5-201ENST00000534261 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
GCNT1Q02742 KANK2-201ENST00000586659 5162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GCNT1Q02742 PES1-201ENST00000335214 1988 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GCNT1Q02742 OXTR-201ENST00000316793 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GCNT1Q02742 FARP1-214ENST00000595437 4926 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GCNT1Q02742 NUP54-217ENST00000514987 1563 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
GCNT1Q02742 ZFPM2-206ENST00000520492 3960 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
GCNT1Q02742 MFN2-203ENST00000444836 4531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
GCNT1Q02742 ZHX1-201ENST00000297857 5200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
GCNT1Q02742 STIP1-207ENST00000538945 1900 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
GCNT1Q02742 LARP4-219ENST00000614335 1949 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
GCNT1Q02742 SFTA3-204ENST00000518529 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GCNT1Q02742 LINC00665-203ENST00000438368 1863 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GCNT1Q02742 SLC17A5-201ENST00000355773 3455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GCNT1Q02742 MSTO1-202ENST00000368341 2245 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GCNT1Q02742 PCDHGB1-202ENST00000611598 2592 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GCNT1Q02742 LDHAL6B-201ENST00000307144 1693 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GCNT1Q02742 ASB10-204ENST00000420175 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GCNT1Q02742 SPRY4-202ENST00000434127 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 79.6 ms