Protein–RNA interactions for Protein: Q02224

CENPE, Centromere-associated protein E, humanhuman

Predictions only

Length 2,701 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPEQ02224 MT1H-202ENST00000569155 697 ntTSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
CENPEQ02224 NPIPB11-202ENST00000614927 1216 ntTSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
CENPEQ02224 AC015912.3-201ENST00000619432 348 ntBASIC12.54□□□□□ -0.4
CENPEQ02224 LFNG-204ENST00000402045 2058 ntTSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
CENPEQ02224 NDRG2-202ENST00000298687 2122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
CENPEQ02224 NDRG2-203ENST00000350792 2127 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
CENPEQ02224 UCK1-203ENST00000372211 2114 ntTSL 3 BASIC12.54□□□□□ -0.4
CENPEQ02224 BRAT1-201ENST00000340611 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
CENPEQ02224 FBN1-205ENST00000560355 4109 ntTSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
CENPEQ02224 LAPTM4A-201ENST00000175091 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
CENPEQ02224 C21orf58-201ENST00000291691 2975 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.54□□□□□ -0.4
CENPEQ02224 KCNQ2-236ENST00000637193 2983 ntTSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
CENPEQ02224 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
CENPEQ02224 MEG9-201ENST00000429368 2638 ntTSL 2 BASIC12.54□□□□□ -0.4
CENPEQ02224 CCNG2-202ENST00000395640 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
CENPEQ02224 FP565260.6-203ENST00000620015 1435 ntTSL 3 BASIC12.54□□□□□ -0.4
CENPEQ02224 CTCFL-210ENST00000481655 1512 ntTSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
CENPEQ02224 CLMAT3-201ENST00000510576 1973 ntTSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
CENPEQ02224 ASTN2-205ENST00000361209 4622 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
CENPEQ02224 RSPO1-203ENST00000612451 2463 ntTSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
CENPEQ02224 ZNF384-202ENST00000355772 2514 ntTSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
CENPEQ02224 COX14-201ENST00000317943 708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.54□□□□□ -0.4
CENPEQ02224 DEFB123-201ENST00000376309 467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
CENPEQ02224 MIR648-201ENST00000385046 94 ntBASIC12.54□□□□□ -0.4
CENPEQ02224 AL121987.1-201ENST00000435580 645 ntTSL 3 BASIC12.54□□□□□ -0.4
CENPEQ02224 NME6-208ENST00000435684 599 ntTSL 2 BASIC12.54□□□□□ -0.4
CENPEQ02224 AL355537.2-201ENST00000453367 375 ntTSL 2 BASIC12.54□□□□□ -0.4
CENPEQ02224 LAMA4-209ENST00000453937 645 ntTSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
CENPEQ02224 HFE-209ENST00000461397 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
CENPEQ02224 RN7SL582P-201ENST00000491078 279 ntBASIC12.54□□□□□ -0.4
CENPEQ02224 TIMMDC1-207ENST00000493694 710 ntTSL 2 BASIC12.54□□□□□ -0.4
CENPEQ02224 RAMP3-203ENST00000496212 543 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC12.54□□□□□ -0.4
CENPEQ02224 LINC02417-201ENST00000542449 515 ntTSL 2 BASIC12.54□□□□□ -0.4
CENPEQ02224 FBXO36P1-201ENST00000579006 471 ntBASIC12.54□□□□□ -0.4
CENPEQ02224 AP001043.1-206ENST00000613045 730 ntTSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
CENPEQ02224 AL450487.2-201ENST00000615934 407 ntBASIC12.54□□□□□ -0.4
CENPEQ02224 PIGQ-201ENST00000026218 2846 ntTSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
CENPEQ02224 RTN1-201ENST00000267484 3435 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
CENPEQ02224 EYA2-208ENST00000497062 2384 ntTSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
CENPEQ02224 TMEM229B-201ENST00000357461 4068 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.54□□□□□ -0.4
CENPEQ02224 UGT3A2-204ENST00000513300 1924 ntTSL 2 BASIC12.54□□□□□ -0.4
CENPEQ02224 FBLIM1-202ENST00000375766 3695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.54□□□□□ -0.4
CENPEQ02224 MVB12B-206ENST00000489637 2666 ntTSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
CENPEQ02224 SAFB2-201ENST00000252542 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
CENPEQ02224 CARNMT1-202ENST00000376834 4130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
CENPEQ02224 DIABLO-206ENST00000443649 2250 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.54□□□□□ -0.4
CENPEQ02224 HSD17B6-207ENST00000555805 1722 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
CENPEQ02224 AC005906.2-217ENST00000639573 1711 ntTSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
CENPEQ02224 EPS8L2-218ENST00000530636 2469 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
CENPEQ02224 ZNF131-214ENST00000509634 3340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
CENPEQ02224 TMEM92-201ENST00000300433 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
CENPEQ02224 NSFL1C-201ENST00000216879 3568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
CENPEQ02224 NEUROD1-201ENST00000295108 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
CENPEQ02224 RUNDC1-201ENST00000361677 3828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
CENPEQ02224 TCEAL5-201ENST00000372680 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
CENPEQ02224 AC092580.1-201ENST00000433998 658 ntBASIC12.53□□□□□ -0.4
CENPEQ02224 AADACL2-AS1-202ENST00000483843 628 ntTSL 5 BASIC12.53□□□□□ -0.4
CENPEQ02224 AC011383.1-201ENST00000517474 617 ntTSL 3 BASIC12.53□□□□□ -0.4
CENPEQ02224 AC013553.1-201ENST00000560906 267 ntBASIC12.53□□□□□ -0.4
CENPEQ02224 MT2A-202ENST00000561491 581 ntTSL 2 BASIC12.53□□□□□ -0.4
CENPEQ02224 AC135782.2-201ENST00000562040 472 ntTSL 3 BASIC12.53□□□□□ -0.4
CENPEQ02224 CBR3-AS1-206ENST00000608632 659 ntTSL 5 BASIC12.53□□□□□ -0.4
CENPEQ02224 KLK4-201ENST00000324041 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
CENPEQ02224 SLITRK4-201ENST00000338017 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
CENPEQ02224 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
CENPEQ02224 SLC44A1-203ENST00000374724 3088 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.53□□□□□ -0.4
CENPEQ02224 AC074117.1-201ENST00000447070 3060 ntTSL 2 BASIC12.53□□□□□ -0.4
CENPEQ02224 CTSD-201ENST00000236671 2123 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
CENPEQ02224 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
CENPEQ02224 API5-203ENST00000455725 2257 ntTSL 2 BASIC12.53□□□□□ -0.4
CENPEQ02224 AC092850.2-201ENST00000623821 2697 ntBASIC12.53□□□□□ -0.4
CENPEQ02224 NCOA5-201ENST00000290231 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
CENPEQ02224 TMEM60-201ENST00000257663 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
CENPEQ02224 PPIA-201ENST00000355968 818 ntTSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
CENPEQ02224 PLA2G2A-201ENST00000375111 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
CENPEQ02224 ADARB2-AS1-201ENST00000381301 625 ntTSL 2 BASIC12.53□□□□□ -0.4
CENPEQ02224 NRSN2-201ENST00000382285 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.53□□□□□ -0.4
CENPEQ02224 ACTG2-204ENST00000409918 927 ntTSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
CENPEQ02224 AL157935.1-209ENST00000415141 1105 ntTSL 2 BASIC12.53□□□□□ -0.4
CENPEQ02224 AL354893.2-201ENST00000423075 529 ntTSL 5 BASIC12.53□□□□□ -0.4
CENPEQ02224 ANKRD2-204ENST00000455090 1072 ntTSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
CENPEQ02224 TAGLN3-203ENST00000455401 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
CENPEQ02224 PPIA-208ENST00000489459 907 ntTSL 2 BASIC12.53□□□□□ -0.4
CENPEQ02224 PRR7-AS1-204ENST00000514846 543 ntTSL 2 BASIC12.53□□□□□ -0.4
CENPEQ02224 PAX5-210ENST00000520281 969 ntTSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
CENPEQ02224 ANO3-205ENST00000531646 1264 ntTSL 4 BASIC12.53□□□□□ -0.4
CENPEQ02224 DUXAP9-201ENST00000547220 665 ntTSL 3 BASIC12.53□□□□□ -0.4
CENPEQ02224 TMEM202-AS1-201ENST00000562573 723 ntTSL 3 BASIC12.53□□□□□ -0.4
CENPEQ02224 APTX-211ENST00000463596 1345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
CENPEQ02224 MINDY4B-201ENST00000465419 1383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.53□□□□□ -0.4
CENPEQ02224 UBOX5-AS1-201ENST00000446537 1792 ntTSL 2 BASIC12.53□□□□□ -0.4
CENPEQ02224 FDFT1-214ENST00000528812 2013 ntTSL 2 BASIC12.53□□□□□ -0.4
CENPEQ02224 GHDC-207ENST00000587427 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
CENPEQ02224 SLCO5A1-206ENST00000530307 2630 ntTSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
CENPEQ02224 VPS26A-201ENST00000263559 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
CENPEQ02224 KCNG3-202ENST00000394973 3656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
CENPEQ02224 ARFGAP1-201ENST00000353546 2776 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
CENPEQ02224 KLC1-207ENST00000445352 2416 ntTSL 5 BASIC12.53□□□□□ -0.4
CENPEQ02224 AAMP-201ENST00000248450 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
CENPEQ02224 ACTG1P17-202ENST00000560958 1662 ntTSL 2 BASIC12.53□□□□□ -0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.1 ms