Protein–RNA interactions for Protein: P84022

SMAD3, Mothers against decapentaplegic homolog 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 425 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMAD3P84022 SLC3A2-204ENST00000377891 2222 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SMAD3P84022 DMTN-223ENST00000523782 2235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SMAD3P84022 SH3BP4-203ENST00000409212 5231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SMAD3P84022 PGRMC2-207ENST00000520121 3785 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SMAD3P84022 KLHL24-201ENST00000242810 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SMAD3P84022 RABL2B-204ENST00000395593 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SMAD3P84022 ZNF18-204ENST00000580306 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SMAD3P84022 ABCB7-201ENST00000253577 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SMAD3P84022 PCDHA1-201ENST00000378133 2726 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
SMAD3P84022 SUN2-203ENST00000406622 2725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SMAD3P84022 CICP13-201ENST00000422015 2789 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
SMAD3P84022 GFRA2-208ENST00000524240 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SMAD3P84022 OBSCN-AS1-201ENST00000295012 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SMAD3P84022 VAMP1-202ENST00000396308 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SMAD3P84022 HDDC2-202ENST00000398153 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SMAD3P84022 C17orf58-202ENST00000449250 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SMAD3P84022 PPFIBP1-204ENST00000535047 875 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SMAD3P84022 SDHAF2-206ENST00000542074 835 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SMAD3P84022 ATP6V0A2-207ENST00000544833 1013 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SMAD3P84022 CCDC86-203ENST00000545580 697 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SMAD3P84022 ANAPC15-217ENST00000545944 704 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SMAD3P84022 SLC25A21-203ENST00000555449 1023 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SMAD3P84022 AC027237.1-201ENST00000560942 655 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
SMAD3P84022 RN7SL470P-201ENST00000583069 259 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
SMAD3P84022 RPS15-202ENST00000585665 467 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SMAD3P84022 BCL2L12-204ENST00000594157 620 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SMAD3P84022 PRKAB1-210ENST00000630317 258 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SMAD3P84022 PROZ-202ENST00000375547 1488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SMAD3P84022 SLC3A2-208ENST00000536981 1486 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SMAD3P84022 WDR6-222ENST00000615452 1949 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SMAD3P84022 AC026691.1-201ENST00000602502 2017 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
SMAD3P84022 OSBPL6-203ENST00000357080 2217 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SMAD3P84022 LUC7L3-202ENST00000393227 2284 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SMAD3P84022 DOC2GP-204ENST00000639052 2548 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
SMAD3P84022 AEBP1-206ENST00000450684 2571 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SMAD3P84022 PPP1R21-206ENST00000449090 3049 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SMAD3P84022 KCNT1-214ENST00000631073 3948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SMAD3P84022 SLC2A10-201ENST00000359271 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SMAD3P84022 EGLN1-201ENST00000366641 7097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SMAD3P84022 KIF13B-206ENST00000524189 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SMAD3P84022 PELP1-208ENST00000572293 5272 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SMAD3P84022 NSUN2-201ENST00000264670 3303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SMAD3P84022 EXT2-210ENST00000533608 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SMAD3P84022 MSR1-201ENST00000262101 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SMAD3P84022 SMAD3-201ENST00000327367 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SMAD3P84022 P2RX3-201ENST00000263314 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SMAD3P84022 TPCN1-201ENST00000335509 5274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SMAD3P84022 IL3RA-201ENST00000331035 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SMAD3P84022 AC005906.2-217ENST00000639573 1711 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SMAD3P84022 ETV3-201ENST00000326786 1539 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SMAD3P84022 SPIB-201ENST00000270632 1443 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SMAD3P84022 GIGYF1-201ENST00000275732 6530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SMAD3P84022 STK40-202ENST00000373129 3846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SMAD3P84022 UBE4B-203ENST00000377153 1273 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SMAD3P84022 KLK11-203ENST00000391804 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SMAD3P84022 AL391119.1-201ENST00000416563 271 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SMAD3P84022 ACTBP7-201ENST00000418351 1124 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
SMAD3P84022 MIR4435-2HG-204ENST00000419736 777 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SMAD3P84022 AL807761.2-201ENST00000422849 729 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
SMAD3P84022 FAM27E5-201ENST00000426869 682 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SMAD3P84022 AL354861.1-201ENST00000445213 355 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
SMAD3P84022 KLHDC8A-203ENST00000460687 1022 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SMAD3P84022 AC026434.2-201ENST00000506094 1078 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
SMAD3P84022 TMEM126A-203ENST00000528105 656 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SMAD3P84022 AC040162.4-201ENST00000574912 1185 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SMAD3P84022 AC100778.2-201ENST00000580150 483 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SMAD3P84022 AC138696.2-201ENST00000607376 223 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
SMAD3P84022 AC002472.4-201ENST00000641915 272 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
SMAD3P84022 RASAL3-201ENST00000343625 3293 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SMAD3P84022 CBFB-201ENST00000290858 3136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SMAD3P84022 NDRG1-202ENST00000414097 3755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SMAD3P84022 ILDR1-202ENST00000344209 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SMAD3P84022 FBLIM1-202ENST00000375766 3695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SMAD3P84022 AC136759.1-203ENST00000527477 2196 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SMAD3P84022 AC136759.1-202ENST00000530858 2194 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
SMAD3P84022 METTL25-201ENST00000248306 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SMAD3P84022 SLC12A5-201ENST00000243964 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SMAD3P84022 ATG13-216ENST00000530500 2030 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SMAD3P84022 SHISA6-202ENST00000409168 7262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SMAD3P84022 SLC25A35-202ENST00000577745 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SMAD3P84022 AL139384.1-201ENST00000612143 3047 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
SMAD3P84022 CASP2-201ENST00000310447 4225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SMAD3P84022 SLC12A8-207ENST00000469902 2989 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SMAD3P84022 AC012507.2-203ENST00000415628 1765 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SMAD3P84022 GALNT6-201ENST00000356317 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SMAD3P84022 PRRG1-203ENST00000463135 1663 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SMAD3P84022 PRMT1-217ENST00000532489 1686 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SMAD3P84022 VPS26A-201ENST00000263559 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SMAD3P84022 TK2-207ENST00000544898 3441 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SMAD3P84022 RFPL2-203ENST00000400237 2407 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SMAD3P84022 PSME2-201ENST00000216802 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SMAD3P84022 AMBP-201ENST00000265132 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SMAD3P84022 SLC43A1-204ENST00000528450 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SMAD3P84022 INA-201ENST00000369849 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SMAD3P84022 NOX5-204ENST00000455873 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SMAD3P84022 ARL8B-201ENST00000256496 3005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SMAD3P84022 MBP-201ENST00000354542 575 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SMAD3P84022 S100A3-202ENST00000368713 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SMAD3P84022 PDCD5-202ENST00000379316 154 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SMAD3P84022 FKBP1B-201ENST00000380986 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.4 ms