Protein–RNA interactions for Protein: P83916

CBX1, Chromobox protein homolog 1, humanhuman

Predictions only

Length 185 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBX1P83916 DDX12P-201ENST00000432996 2947 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
CBX1P83916 HK3-201ENST00000292432 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CBX1P83916 CADM1-206ENST00000537058 3550 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CBX1P83916 MED15-204ENST00000406969 3210 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CBX1P83916 CSF3R-201ENST00000331941 2375 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CBX1P83916 DOK4-210ENST00000566936 2851 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CBX1P83916 MTMR11-201ENST00000369140 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CBX1P83916 TSPAN32-201ENST00000182290 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CBX1P83916 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CBX1P83916 TSPAN32-217ENST00000612299 1301 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CBX1P83916 ZDHHC11-201ENST00000283441 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CBX1P83916 ESYT3-202ENST00000389567 4407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CBX1P83916 AC135782.3-201ENST00000562782 2105 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
CBX1P83916 SELPLG-203ENST00000550948 2256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CBX1P83916 ENG-201ENST00000344849 3059 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CBX1P83916 TCN2-202ENST00000405742 1936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CBX1P83916 KIAA0513-202ENST00000538274 7381 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CBX1P83916 TNFRSF8-201ENST00000263932 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CBX1P83916 AGGF1P1-201ENST00000509500 2073 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
CBX1P83916 DTX2P1-UPK3BP1-PMS2P11-203ENST00000636308 4646 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CBX1P83916 KRTAP19-7-201ENST00000334849 440 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CBX1P83916 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CBX1P83916 HCG4-201ENST00000418983 998 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
CBX1P83916 GHSR-202ENST00000427970 912 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
CBX1P83916 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CBX1P83916 PKD2-202ENST00000502363 1222 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CBX1P83916 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CBX1P83916 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
CBX1P83916 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CBX1P83916 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CBX1P83916 DPY19L2P2-205ENST00000439473 3994 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CBX1P83916 DLGAP2-201ENST00000421627 3165 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CBX1P83916 TMEM87A-201ENST00000307216 1598 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CBX1P83916 ARHGAP45-203ENST00000543365 3750 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CBX1P83916 ADAMTS5-201ENST00000284987 9056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CBX1P83916 NEK2-201ENST00000366998 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CBX1P83916 NAP1L1-202ENST00000393263 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CBX1P83916 CCT3-211ENST00000472765 1858 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CBX1P83916 SLC1A2-208ENST00000606205 1890 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CBX1P83916 CNN2-202ENST00000348419 2033 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CBX1P83916 NACC2-202ENST00000371753 6802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CBX1P83916 LINC01993-201ENST00000374945 2934 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CBX1P83916 FKBP6-201ENST00000252037 1500 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CBX1P83916 PYCR2-201ENST00000343818 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CBX1P83916 C2-205ENST00000418949 1658 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CBX1P83916 DDC-213ENST00000617822 1809 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CBX1P83916 TRPC7-202ENST00000378459 2406 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CBX1P83916 CCT4-201ENST00000394440 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CBX1P83916 NEK4-201ENST00000233027 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CBX1P83916 BPGM-201ENST00000344924 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CBX1P83916 UCN2-201ENST00000273610 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CBX1P83916 MCU-204ENST00000536019 3224 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CBX1P83916 ENAH-203ENST00000366843 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CBX1P83916 KNDC1-202ENST00000368571 3925 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CBX1P83916 ATL2-210ENST00000452935 2199 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CBX1P83916 NOP58-201ENST00000264279 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CBX1P83916 MSI2-202ENST00000322684 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CBX1P83916 HSPB7-201ENST00000311890 2892 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CBX1P83916 GNPNAT1-201ENST00000216410 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CBX1P83916 IFT122-204ENST00000349441 3569 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CBX1P83916 AC092117.1-201ENST00000621230 3250 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
CBX1P83916 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CBX1P83916 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CBX1P83916 HCCS-202ENST00000380762 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CBX1P83916 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CBX1P83916 IGF2-206ENST00000418738 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CBX1P83916 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CBX1P83916 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CBX1P83916 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CBX1P83916 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CBX1P83916 BLOC1S6-202ENST00000562384 494 ntTSL 4 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CBX1P83916 TMEM97-205ENST00000583381 578 ntTSL 4 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CBX1P83916 METTL23-202ENST00000586200 465 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CBX1P83916 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CBX1P83916 METTL23-212ENST00000590964 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CBX1P83916 BSG-214ENST00000614867 960 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CBX1P83916 AC244517.11-201ENST00000624192 573 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CBX1P83916 CR381653.1-203ENST00000625153 577 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CBX1P83916 DDX54-201ENST00000306014 4377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CBX1P83916 KIAA0895-207ENST00000436884 1952 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CBX1P83916 ARMCX2-202ENST00000330154 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CBX1P83916 MGRN1-206ENST00000586183 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CBX1P83916 PTPRK-204ENST00000368210 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CBX1P83916 PARVB-201ENST00000338758 5429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CBX1P83916 AC126755.2-202ENST00000427999 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CBX1P83916 SERPINB1-201ENST00000380739 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CBX1P83916 ABL2-207ENST00000507173 3177 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CBX1P83916 CACNB1-202ENST00000394303 3742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CBX1P83916 KIAA0895-203ENST00000338533 4132 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CBX1P83916 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CBX1P83916 FAM86JP-201ENST00000467239 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CBX1P83916 ASNA1-204ENST00000591090 1368 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CBX1P83916 ZNF862-201ENST00000223210 6950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CBX1P83916 GP1BA-202ENST00000611961 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CBX1P83916 FAM122B-203ENST00000370790 4246 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CBX1P83916 SCNN1B-202ENST00000343070 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CBX1P83916 ANGPTL2-201ENST00000373417 2575 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CBX1P83916 SLC4A7-203ENST00000425128 7970 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CBX1P83916 FAM224A-201ENST00000419557 2031 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CBX1P83916 MSMO1-201ENST00000261507 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.9 ms