Protein–RNA interactions for Protein: P83436

COG7, Conserved oligomeric Golgi complex subunit 7, humanhuman

Predictions only

Length 770 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COG7P83436 GCHFR-203ENST00000558670 412 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
COG7P83436 AC244669.2-201ENST00000612320 853 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
COG7P83436 RHOXF1P1-202ENST00000635473 501 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
COG7P83436 AL603764.1-201ENST00000636452 321 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
COG7P83436 RLF-201ENST00000372771 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
COG7P83436 UBR2-201ENST00000372899 7857 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
COG7P83436 UBR2-202ENST00000372901 7857 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
COG7P83436 PARD6G-201ENST00000353265 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
COG7P83436 LINC00900-201ENST00000499809 3322 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
COG7P83436 LAP3-201ENST00000226299 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
COG7P83436 SFRP4-201ENST00000436072 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
COG7P83436 AL138709.1-201ENST00000614840 1693 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
COG7P83436 TYSND1-202ENST00000335494 3397 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
COG7P83436 LIMS1-202ENST00000338045 1876 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
COG7P83436 DUS2-202ENST00000432752 1864 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
COG7P83436 TAF4B-203ENST00000578121 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
COG7P83436 SNX19-201ENST00000265909 6535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
COG7P83436 ZNF800-201ENST00000265827 4203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
COG7P83436 ATP2B3-204ENST00000370186 6742 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
COG7P83436 TNRC18P2-201ENST00000417666 2714 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
COG7P83436 SGK3-211ENST00000522398 3106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
COG7P83436 GNAO1-201ENST00000262493 3337 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
COG7P83436 ZNF74-209ENST00000611540 3714 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
COG7P83436 TEAD4-203ENST00000397122 1396 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
COG7P83436 KCNJ5-203ENST00000533599 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
COG7P83436 TCEAL4-209ENST00000472745 1571 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
COG7P83436 PGBD5-202ENST00000525115 1569 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
COG7P83436 KRTAP10-7-201ENST00000609664 1578 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
COG7P83436 MEGF11-204ENST00000422354 5914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
COG7P83436 LAT2-202ENST00000344995 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
COG7P83436 AC073264.3-201ENST00000636941 2577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
COG7P83436 PODN-201ENST00000312553 3010 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
COG7P83436 CICP11-201ENST00000434745 2827 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
COG7P83436 LHFPL4-201ENST00000287585 4880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
COG7P83436 SLC43A2-201ENST00000301335 8136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
COG7P83436 TRIM62-204ENST00000543586 1638 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
COG7P83436 SULT2B1-202ENST00000323090 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
COG7P83436 FOS-202ENST00000535987 1402 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
COG7P83436 HGNC:24955-201ENST00000303177 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
COG7P83436 OTOF-202ENST00000338581 4954 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
COG7P83436 AC118344.1-201ENST00000378432 1462 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
COG7P83436 BRF1-211ENST00000547530 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
COG7P83436 CMA1-202ENST00000250378 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
COG7P83436 PDE6D-201ENST00000287600 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
COG7P83436 ZFAND2B-203ENST00000409206 1159 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
COG7P83436 LSM5-207ENST00000410044 687 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
COG7P83436 AC007405.2-202ENST00000418106 540 ntTSL 4 BASIC15.87■□□□□ 0.13
COG7P83436 SIRPB2-203ENST00000444444 884 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
COG7P83436 MPZL1-209ENST00000474859 630 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
COG7P83436 ASF1B-202ENST00000474890 765 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
COG7P83436 AC090502.1-201ENST00000549905 748 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
COG7P83436 AC090502.1-204ENST00000551210 469 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
COG7P83436 AP000439.4-201ENST00000567742 664 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
COG7P83436 AC024619.2-201ENST00000581964 517 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
COG7P83436 ARL8B-208ENST00000611208 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
COG7P83436 SCUBE1-202ENST00000360835 9808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
COG7P83436 SGCE-205ENST00000437425 1508 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
COG7P83436 TRAK1-203ENST00000396175 5033 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
COG7P83436 ELAC1-201ENST00000269466 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
COG7P83436 MIIP-201ENST00000235332 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
COG7P83436 MROH4P-201ENST00000431302 1578 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
COG7P83436 RNF183-201ENST00000297894 1830 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
COG7P83436 MAEL-201ENST00000367870 1831 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
COG7P83436 PMP22-209ENST00000612492 1822 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
COG7P83436 GPN1-212ENST00000616939 1832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
COG7P83436 SCAP-215ENST00000545718 2950 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
COG7P83436 MLKL-202ENST00000308807 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
COG7P83436 GHDC-203ENST00000428494 2518 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
COG7P83436 KDM6B-201ENST00000254846 6713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
COG7P83436 MCFD2-201ENST00000319466 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
COG7P83436 TRMO-203ENST00000375119 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
COG7P83436 MALSU1-202ENST00000466681 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
COG7P83436 MAGEA8-204ENST00000535454 2112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
COG7P83436 CHI3L2-212ENST00000524472 1435 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
COG7P83436 ATP6AP2-211ENST00000636196 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
COG7P83436 TRPC6-203ENST00000360497 2631 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
COG7P83436 PPFIA3-203ENST00000602351 4341 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
COG7P83436 RUFY2-204ENST00000399200 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
COG7P83436 CLEC18C-210ENST00000569347 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
COG7P83436 EGLN3-201ENST00000250457 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
COG7P83436 HNRNPU-204ENST00000440865 3207 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
COG7P83436 DNAJC27-201ENST00000264711 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
COG7P83436 PRMT9-201ENST00000322396 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
COG7P83436 AC112484.1-201ENST00000508239 2291 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
COG7P83436 RCOR3-203ENST00000419091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
COG7P83436 HSD17B6-201ENST00000322165 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
COG7P83436 C1orf43-205ENST00000368519 1163 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
COG7P83436 AGTRAP-202ENST00000376627 1055 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
COG7P83436 IGHV3-35-201ENST00000390617 366 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
COG7P83436 CYB5R3-203ENST00000402438 1050 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
COG7P83436 C17orf51-202ENST00000412778 877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
COG7P83436 AL645941.1-201ENST00000415875 338 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
COG7P83436 MDM2-215ENST00000428863 1037 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
COG7P83436 TMEM107-204ENST00000437139 747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
COG7P83436 CR769775.1-201ENST00000443347 931 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
COG7P83436 AC022616.1-201ENST00000518688 554 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
COG7P83436 AP003385.5-201ENST00000533876 555 ntTSL 4 BASIC15.86■□□□□ 0.13
COG7P83436 PAFAH1B3-202ENST00000538771 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
COG7P83436 AP001453.3-201ENST00000545800 853 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
COG7P83436 RN7SL48P-201ENST00000579283 293 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 89.3 ms