Protein–RNA interactions for Protein: P63121

HERVK_113, Endogenous retrovirus group K member 113 Pro protein, humanhuman

Predictions only

Length 156 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERVK_113P63121 SLED1-202ENST00000512051 380 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
HERVK_113P63121 AP000442.1-201ENST00000533552 769 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
HERVK_113P63121 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.48□□□□□ -0.73
HERVK_113P63121 NDRG4-247ENST00000568640 1281 ntTSL 2 BASIC10.48□□□□□ -0.73
HERVK_113P63121 CDC42EP4-206ENST00000581014 737 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
HERVK_113P63121 ALKBH7-203ENST00000599849 556 ntTSL 3 BASIC10.48□□□□□ -0.73
HERVK_113P63121 AC011247.3-202ENST00000605062 570 ntTSL 4 BASIC10.48□□□□□ -0.73
HERVK_113P63121 DUSP13-212ENST00000605915 1015 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
HERVK_113P63121 PSMB6-205ENST00000614486 871 ntTSL 2 BASIC10.48□□□□□ -0.73
HERVK_113P63121 HMGN3-203ENST00000620514 1010 ntTSL 3 BASIC10.48□□□□□ -0.73
HERVK_113P63121 KIAA1683-201ENST00000392413 4402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
HERVK_113P63121 TMEM237-213ENST00000621467 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
HERVK_113P63121 BTN1A1-201ENST00000244513 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
HERVK_113P63121 ELP5-201ENST00000354429 1304 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
HERVK_113P63121 PDIA4-201ENST00000286091 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
HERVK_113P63121 PPP5D1-201ENST00000414155 1882 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC10.48□□□□□ -0.73
HERVK_113P63121 GOLGA8H-201ENST00000566740 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
HERVK_113P63121 GOLGA8J-201ENST00000567927 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
HERVK_113P63121 HBP1-212ENST00000485846 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.48□□□□□ -0.73
HERVK_113P63121 TRPA1-201ENST00000262209 5223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
HERVK_113P63121 CFAP52-202ENST00000396219 1912 ntTSL 2 BASIC10.48□□□□□ -0.73
HERVK_113P63121 SLC35C2-203ENST00000372227 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
HERVK_113P63121 ASXL1-201ENST00000306058 6591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
HERVK_113P63121 FUT3-201ENST00000303225 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
HERVK_113P63121 TOX3-201ENST00000219746 3233 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC10.48□□□□□ -0.73
HERVK_113P63121 PTPN9-201ENST00000306726 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
HERVK_113P63121 NOC2L-201ENST00000327044 2790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
HERVK_113P63121 POLG2-201ENST00000539111 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
HERVK_113P63121 ALDOA-209ENST00000563060 1550 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
HERVK_113P63121 SGK2-204ENST00000373100 2225 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
HERVK_113P63121 ORMDL3-202ENST00000394169 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.48□□□□□ -0.73
HERVK_113P63121 NAA15-202ENST00000398947 6072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
HERVK_113P63121 TPD52L2-206ENST00000358548 2275 ntTSL 2 BASIC10.47□□□□□ -0.73
HERVK_113P63121 YTHDF2-201ENST00000373812 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
HERVK_113P63121 SEZ6L-203ENST00000360929 6307 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
HERVK_113P63121 NFYA-202ENST00000353205 1660 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
HERVK_113P63121 TK1-203ENST00000588734 1681 ntTSL 2 BASIC10.47□□□□□ -0.73
HERVK_113P63121 MARCH2-208ENST00000602117 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
HERVK_113P63121 PTPRVP-205ENST00000641549 5067 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
HERVK_113P63121 BIRC5-203ENST00000374948 2446 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
HERVK_113P63121 CDK12-201ENST00000430627 5918 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
HERVK_113P63121 FCHSD2-204ENST00000409418 3154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.47□□□□□ -0.73
HERVK_113P63121 BSG-204ENST00000545507 1795 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
HERVK_113P63121 RNF216-205ENST00000425013 5639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
HERVK_113P63121 STRA6-205ENST00000432245 1889 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
HERVK_113P63121 NCOA7-203ENST00000392477 6457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
HERVK_113P63121 UPB1-202ENST00000382760 1928 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
HERVK_113P63121 SCAF11-204ENST00000395454 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
HERVK_113P63121 ITPRIPL1-205ENST00000536814 1947 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.47□□□□□ -0.73
HERVK_113P63121 TLL2-201ENST00000357947 6756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
HERVK_113P63121 ZNF354B-201ENST00000322434 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
HERVK_113P63121 TCF12-201ENST00000267811 6061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
HERVK_113P63121 SERPINA4-203ENST00000557004 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
HERVK_113P63121 PRMT7-203ENST00000449359 2091 ntTSL 2 BASIC10.47□□□□□ -0.73
HERVK_113P63121 AIPL1-207ENST00000574506 2074 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
HERVK_113P63121 CDH1-213ENST00000612417 2068 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
HERVK_113P63121 FANCC-201ENST00000289081 4585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
HERVK_113P63121 MAP3K12-203ENST00000547035 2944 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
HERVK_113P63121 GYPC-201ENST00000259254 1246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
HERVK_113P63121 NKX2-6-201ENST00000325017 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.47□□□□□ -0.73
HERVK_113P63121 TMEM128-202ENST00000382753 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
HERVK_113P63121 MNX1-AS2-201ENST00000429228 374 ntTSL 3 BASIC10.47□□□□□ -0.73
HERVK_113P63121 SPDYE11-202ENST00000450699 704 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
HERVK_113P63121 NDUFB2-209ENST00000472695 503 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
HERVK_113P63121 MRVI1-AS1-203ENST00000529979 784 ntTSL 3 BASIC10.47□□□□□ -0.73
HERVK_113P63121 BRK1-201ENST00000530758 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
HERVK_113P63121 CSRP2-202ENST00000546966 754 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.47□□□□□ -0.73
HERVK_113P63121 RNF34-208ENST00000555076 593 ntTSL 3 BASIC10.47□□□□□ -0.73
HERVK_113P63121 AL359317.2-203ENST00000557409 538 ntTSL 4 BASIC10.47□□□□□ -0.73
HERVK_113P63121 INO80E-210ENST00000567705 880 ntTSL 3 BASIC10.47□□□□□ -0.73
HERVK_113P63121 GNAO1-210ENST00000569295 930 ntTSL 2 BASIC10.47□□□□□ -0.73
HERVK_113P63121 SPDYE9P-201ENST00000570642 692 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
HERVK_113P63121 AP001005.1-201ENST00000571755 1248 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
HERVK_113P63121 IL11-202ENST00000585513 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
HERVK_113P63121 KF456478.1-201ENST00000585980 472 ntTSL 3 BASIC10.47□□□□□ -0.73
HERVK_113P63121 ZNF519-206ENST00000589498 2117 ntTSL 2 BASIC10.47□□□□□ -0.73
HERVK_113P63121 ZSCAN1-203ENST00000601162 813 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
HERVK_113P63121 NUTM2B-AS1-211ENST00000601369 1233 ntTSL 2 BASIC10.47□□□□□ -0.73
HERVK_113P63121 AC131235.3-202ENST00000608135 362 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
HERVK_113P63121 LINC00454-206ENST00000609861 841 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
HERVK_113P63121 SPDYE10P-202ENST00000612005 668 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
HERVK_113P63121 SPDYE8P-202ENST00000612377 668 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
HERVK_113P63121 AC012313.10-201ENST00000623509 926 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
HERVK_113P63121 BRPF3-201ENST00000339717 4820 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
HERVK_113P63121 ABI2-201ENST00000261016 6634 ntTSL 2 BASIC10.47□□□□□ -0.73
HERVK_113P63121 ABI2-203ENST00000261018 6638 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
HERVK_113P63121 SC5D-202ENST00000392789 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
HERVK_113P63121 LLGL2-209ENST00000578363 1393 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
HERVK_113P63121 CACNA1G-233ENST00000515765 6981 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
HERVK_113P63121 HOXC11-202ENST00000546378 3261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
HERVK_113P63121 SSTR1-201ENST00000267377 4295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.47□□□□□ -0.73
HERVK_113P63121 KRT17-201ENST00000311208 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
HERVK_113P63121 TUSC3-204ENST00000506802 1546 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
HERVK_113P63121 FAM219A-209ENST00000445726 3644 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.47□□□□□ -0.73
HERVK_113P63121 VPS26B-201ENST00000281187 3691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
HERVK_113P63121 FAM103A1-201ENST00000304191 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
HERVK_113P63121 TNFRSF1B-201ENST00000376259 3683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
HERVK_113P63121 METTL17-202ENST00000382985 1586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
HERVK_113P63121 RBM33-205ENST00000392759 1580 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
HERVK_113P63121 COMMD5-203ENST00000450361 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.2 ms