Protein–RNA interactions for Protein: P50613

CDK7, Cyclin-dependent kinase 7, humanhuman

Predictions only

Length 346 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK7P50613 DOK3-203ENST00000377112 1884 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CDK7P50613 MCF2L2-208ENST00000473233 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CDK7P50613 TMED7-TICAM2-201ENST00000282382 3491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CDK7P50613 TBRG4-201ENST00000258770 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CDK7P50613 TMEM132D-202ENST00000422113 5776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CDK7P50613 CCDC51-202ENST00000412398 1385 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CDK7P50613 CD27-201ENST00000266557 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CDK7P50613 CTSW-204ENST00000528419 1341 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CDK7P50613 LONRF1-201ENST00000398246 3594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CDK7P50613 KRT2-201ENST00000309680 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CDK7P50613 FBXO21-208ENST00000622495 6040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CDK7P50613 ESD-202ENST00000378720 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CDK7P50613 EVA1A-204ENST00000410071 777 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CDK7P50613 AL021707.5-201ENST00000420118 461 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CDK7P50613 AC084346.1-201ENST00000520962 528 ntTSL 4 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CDK7P50613 SIRT3-210ENST00000529382 1225 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CDK7P50613 AC026803.1-201ENST00000569130 274 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
CDK7P50613 DHRS7C-202ENST00000571134 984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CDK7P50613 IMPA2-207ENST00000588927 787 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CDK7P50613 TPGS2-209ENST00000589049 1102 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CDK7P50613 MIR6842-201ENST00000612539 65 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
CDK7P50613 YRDCP1-201ENST00000621419 643 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
CDK7P50613 FRMPD4-201ENST00000380682 8465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CDK7P50613 Z99756.1-201ENST00000458463 1951 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CDK7P50613 RTL6-201ENST00000341255 5495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CDK7P50613 CTIF-201ENST00000256413 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CDK7P50613 INPP5K-204ENST00000421807 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CDK7P50613 DIABLO-208ENST00000464942 2569 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CDK7P50613 ADORA1-203ENST00000367235 2219 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CDK7P50613 GOLGA8S-201ENST00000562295 1878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CDK7P50613 NEFL-203ENST00000619417 1879 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CDK7P50613 CYP51A1-201ENST00000003100 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CDK7P50613 KRT17-201ENST00000311208 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CDK7P50613 STK24-203ENST00000397517 4578 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CDK7P50613 RABGAP1L-201ENST00000251507 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CDK7P50613 ZFAND6-207ENST00000558494 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CDK7P50613 RIMS1-210ENST00000491071 5047 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CDK7P50613 DMTN-206ENST00000443491 2415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CDK7P50613 FMNL3-202ENST00000352151 4006 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CDK7P50613 METTL25-201ENST00000248306 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CDK7P50613 MON2-213ENST00000552738 5543 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CDK7P50613 HDAC8-209ENST00000373589 1740 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CDK7P50613 KIF22-208ENST00000569382 2020 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CDK7P50613 ERGIC3-203ENST00000357394 1357 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CDK7P50613 THEMIS2-203ENST00000373925 1650 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CDK7P50613 SIGLEC10-201ENST00000339313 2256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CDK7P50613 PIK3R6-203ENST00000614407 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CDK7P50613 KRT76-201ENST00000332411 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CDK7P50613 MGME1-202ENST00000377709 1936 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CDK7P50613 COPS3-201ENST00000268717 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CDK7P50613 TMEM169-204ENST00000437356 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CDK7P50613 UROD-201ENST00000246337 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CDK7P50613 AL138725.1-201ENST00000407347 1314 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
CDK7P50613 ELOF1-203ENST00000586683 2154 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CDK7P50613 BPIFB2-201ENST00000170150 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CDK7P50613 ZNF180-202ENST00000391956 3049 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CDK7P50613 MOB3B-201ENST00000262244 6454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CDK7P50613 DNAJB9-201ENST00000249356 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CDK7P50613 CDKN2AIP-203ENST00000504169 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CDK7P50613 FXYD5-201ENST00000342879 1580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CDK7P50613 LYAR-201ENST00000343470 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CDK7P50613 PUF60-208ENST00000526683 2412 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CDK7P50613 LENEP-202ENST00000392487 555 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CDK7P50613 APOL3-207ENST00000424878 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CDK7P50613 AL589986.1-201ENST00000429230 789 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CDK7P50613 AL137856.1-201ENST00000429398 773 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CDK7P50613 DNAJB1P1-201ENST00000429417 1024 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
CDK7P50613 HCFC1-AS1-201ENST00000438219 350 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CDK7P50613 AC246817.2-203ENST00000517357 569 ntTSL 4 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CDK7P50613 AC246817.2-202ENST00000519393 564 ntTSL 4 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CDK7P50613 AC133919.1-201ENST00000562203 416 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CDK7P50613 FAM236A-201ENST00000593662 453 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CDK7P50613 FAM236B-201ENST00000596535 465 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CDK7P50613 CCDC197-205ENST00000636493 1279 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CDK7P50613 AIFM2-201ENST00000307864 3243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CDK7P50613 INA-201ENST00000369849 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CDK7P50613 KLHDC8A-201ENST00000367155 2928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CDK7P50613 KLK6-201ENST00000310157 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CDK7P50613 TSC1-202ENST00000403810 1507 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CDK7P50613 RAP1GDS1-203ENST00000380158 2085 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CDK7P50613 AC009053.1-201ENST00000566802 2320 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CDK7P50613 UGDH-202ENST00000501493 2826 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CDK7P50613 GPN3-201ENST00000228827 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CDK7P50613 PROZ-202ENST00000375547 1488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CDK7P50613 CRELD1-203ENST00000397170 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CDK7P50613 SCGN-203ENST00000612225 1402 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CDK7P50613 ARHGEF1-204ENST00000378152 2986 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CDK7P50613 LOXL3-203ENST00000409249 2431 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CDK7P50613 ZXDC-202ENST00000389709 3405 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CDK7P50613 EPN2-201ENST00000314728 4871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CDK7P50613 PEF1-201ENST00000373703 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CDK7P50613 ID2-203ENST00000396290 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CDK7P50613 LYRM1-203ENST00000412082 1399 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CDK7P50613 TOB1-AS1-201ENST00000416263 1351 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CDK7P50613 RPN1-207ENST00000497289 2137 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CDK7P50613 AL137783.1-201ENST00000623494 1896 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
CDK7P50613 DNAJC22-201ENST00000395069 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CDK7P50613 LINC00680-205ENST00000450081 1593 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CDK7P50613 DIABLO-201ENST00000267169 1316 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CDK7P50613 CISH-201ENST00000348721 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.1 ms