Protein–RNA interactions for Protein: P49768

PSEN1, Presenilin-1, humanhuman

Predictions only

Length 467 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSEN1P49768 LINC01098-201ENST00000507870 1034 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PSEN1P49768 LINC02207-201ENST00000554530 1256 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PSEN1P49768 LINC01220-201ENST00000558575 715 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PSEN1P49768 AC106886.1-201ENST00000568660 600 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
PSEN1P49768 AC010319.3-201ENST00000597028 470 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
PSEN1P49768 AC015819.2-201ENST00000618730 555 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PSEN1P49768 AC006449.3-201ENST00000620144 563 ntTSL 4 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PSEN1P49768 AC004706.3-207ENST00000634823 977 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PSEN1P49768 AL645728.2-202ENST00000641679 227 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
PSEN1P49768 ACP2-201ENST00000256997 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PSEN1P49768 CLN5-208ENST00000636183 6664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PSEN1P49768 RPL15-213ENST00000611050 2363 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PSEN1P49768 HPSE-206ENST00000512196 1571 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PSEN1P49768 AC084364.1-201ENST00000551967 1556 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
PSEN1P49768 FUT8-202ENST00000358307 2664 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PSEN1P49768 TRIM67-201ENST00000366653 3936 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PSEN1P49768 CLEC18A-203ENST00000449317 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PSEN1P49768 KIAA1217-206ENST00000376462 6123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PSEN1P49768 STYXL1-203ENST00000359697 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PSEN1P49768 WSB2-202ENST00000441406 1353 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PSEN1P49768 PTPRN2-201ENST00000389413 4723 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PSEN1P49768 RHNO1-202ENST00000461997 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PSEN1P49768 ZNF197-203ENST00000383744 1989 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PSEN1P49768 ZNF7-218ENST00000544249 2125 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PSEN1P49768 E2F6-212ENST00000546212 3191 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PSEN1P49768 DEGS2-201ENST00000305631 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PSEN1P49768 PTPN13-204ENST00000436978 8573 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PSEN1P49768 GFRA2-208ENST00000524240 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PSEN1P49768 TPD52L2-203ENST00000348257 2237 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PSEN1P49768 IL25-201ENST00000329715 1315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PSEN1P49768 GRAPL-201ENST00000344415 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PSEN1P49768 SEMA4F-201ENST00000339773 2177 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PSEN1P49768 CCDC144B-202ENST00000445752 2197 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PSEN1P49768 ZNF143-213ENST00000530463 2022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PSEN1P49768 SERPINA4-203ENST00000557004 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PSEN1P49768 STEAP3-202ENST00000393107 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PSEN1P49768 DYM-201ENST00000269445 5049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PSEN1P49768 TBC1D26-206ENST00000579428 1583 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PSEN1P49768 AMBP-201ENST00000265132 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PSEN1P49768 SHANK2-204ENST00000409530 2123 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PSEN1P49768 OR51A6P-201ENST00000418680 1004 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
PSEN1P49768 ACTG1P3-201ENST00000431775 1114 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
PSEN1P49768 WBP2-203ENST00000433525 928 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PSEN1P49768 AL162253.1-201ENST00000443792 758 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PSEN1P49768 FKBP11-203ENST00000453172 959 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PSEN1P49768 AL513217.1-202ENST00000458139 600 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PSEN1P49768 LINC01336-201ENST00000503568 534 ntTSL 4 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PSEN1P49768 MTX3-202ENST00000512528 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PSEN1P49768 HBS1L-208ENST00000525067 582 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PSEN1P49768 C12orf10-204ENST00000548632 988 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PSEN1P49768 AC009486.1-201ENST00000569860 813 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
PSEN1P49768 AC012181.2-201ENST00000570210 699 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
PSEN1P49768 AC011497.1-201ENST00000596781 561 ntTSL 4 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PSEN1P49768 AC025181.2-201ENST00000606994 802 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
PSEN1P49768 AC107373.2-201ENST00000607735 490 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
PSEN1P49768 AC097065.2-201ENST00000608159 533 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
PSEN1P49768 OR6C71P-202ENST00000641886 1107 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
PSEN1P49768 FLAD1-205ENST00000368431 1803 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PSEN1P49768 ARHGAP4-201ENST00000350060 3235 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PSEN1P49768 CACNA1G-202ENST00000354983 8138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PSEN1P49768 IFNA6-202ENST00000380210 1544 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PSEN1P49768 ZCCHC17-206ENST00000616393 1534 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PSEN1P49768 RUBCNL-201ENST00000378781 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PSEN1P49768 SPOCD1-201ENST00000257100 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PSEN1P49768 HPCAL1-202ENST00000381765 1904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PSEN1P49768 COL2A1-202ENST00000380518 5071 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PSEN1P49768 MAP7-205ENST00000544465 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PSEN1P49768 AP003680.1-201ENST00000598970 3660 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
PSEN1P49768 CDY3P-201ENST00000454543 1618 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
PSEN1P49768 SLC12A5-201ENST00000243964 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PSEN1P49768 HACE1-201ENST00000262903 4576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PSEN1P49768 SCARA5-201ENST00000354914 4026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PSEN1P49768 L2HGDH-202ENST00000267436 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PSEN1P49768 RAB40B-206ENST00000571995 3859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PSEN1P49768 GALC-206ENST00000544807 2528 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PSEN1P49768 PDE8B-201ENST00000264917 5956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PSEN1P49768 DMAP1-203ENST00000372289 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PSEN1P49768 CCNT2P1-201ENST00000423082 1315 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
PSEN1P49768 SNHG20-204ENST00000566583 1338 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PSEN1P49768 MFSD8-213ENST00000641134 1327 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
PSEN1P49768 GNE-202ENST00000396594 5298 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PSEN1P49768 NRXN1-204ENST00000401669 5870 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PSEN1P49768 COX6B2-201ENST00000326529 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PSEN1P49768 TRIP10-208ENST00000596758 1920 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PSEN1P49768 FBXO21-208ENST00000622495 6040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PSEN1P49768 PTPRH-201ENST00000263434 3343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PSEN1P49768 PGGT1B-202ENST00000379615 903 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PSEN1P49768 SNORA40.4-201ENST00000390971 128 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
PSEN1P49768 RFESDP1-201ENST00000422350 461 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
PSEN1P49768 AL157832.1-201ENST00000428273 495 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PSEN1P49768 AC068898.1-201ENST00000440750 335 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PSEN1P49768 LINC00928-204ENST00000561201 1123 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PSEN1P49768 HAUS2-207ENST00000568846 709 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PSEN1P49768 AC090371.2-202ENST00000582239 644 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PSEN1P49768 LINC01515-215ENST00000608678 854 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PSEN1P49768 SERPINA3-203ENST00000467132 2660 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PSEN1P49768 C19orf48-201ENST00000345523 1503 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PSEN1P49768 SHOX2-202ENST00000425436 1513 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PSEN1P49768 CYP4F11-204ENST00000591841 2531 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PSEN1P49768 TIPRL-202ENST00000367833 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.1 ms