Protein–RNA interactions for Protein: P48681

NES, Nestin, humanhuman

Predictions only

Length 1,621 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NESP48681 AC010255.3-203ENST00000509403 1727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
NESP48681 RARS2-201ENST00000369536 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
NESP48681 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
NESP48681 ARMCX6-207ENST00000538627 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
NESP48681 ISM1-201ENST00000262487 2593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
NESP48681 TMEM198B-203ENST00000482378 2230 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
NESP48681 HCK-209ENST00000538448 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
NESP48681 FOLH1-202ENST00000340334 2697 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
NESP48681 RSPO1-202ENST00000401068 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
NESP48681 SUPT20H-201ENST00000350612 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
NESP48681 RUNX1-203ENST00000358356 2720 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
NESP48681 PGAM2-201ENST00000297283 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
NESP48681 MYMK-201ENST00000339996 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
NESP48681 HIST1H2BK-201ENST00000356950 381 ntAPPRIS P1 BASIC24.92■■□□□ 1.58
NESP48681 OR7E115P-201ENST00000382617 1024 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
NESP48681 CIDEC-205ENST00000443115 443 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
NESP48681 GRPEL2P1-201ENST00000453145 339 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
NESP48681 PILRA-205ENST00000453419 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
NESP48681 CU639417.1-201ENST00000464664 460 ntAPPRIS P1 BASIC24.92■■□□□ 1.58
NESP48681 NDUFA3-214ENST00000485876 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
NESP48681 AC093510.1-202ENST00000546238 442 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
NESP48681 H2BFS-201ENST00000599962 460 ntAPPRIS P1 BASIC24.92■■□□□ 1.58
NESP48681 AC010503.4-201ENST00000615487 688 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
NESP48681 CARD10-202ENST00000403299 4113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
NESP48681 NAT9-210ENST00000580301 1860 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
NESP48681 AL050341.2-201ENST00000567508 1541 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
NESP48681 PANK4-201ENST00000378466 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
NESP48681 DUS2-207ENST00000565263 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
NESP48681 JPT2-203ENST00000382711 894 ntTSL 4 BASIC24.91■■□□□ 1.58
NESP48681 AC092295.1-201ENST00000446262 434 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
NESP48681 PLSCR1-202ENST00000448787 996 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
NESP48681 AC011431.1-201ENST00000512971 230 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
NESP48681 AC009055.1-201ENST00000562656 781 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
NESP48681 AP005264.5-201ENST00000590066 467 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
NESP48681 AC254633.1-201ENST00000606790 345 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
NESP48681 JHDM1D-AS1-201ENST00000566699 2380 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
NESP48681 KCTD11-201ENST00000333751 2783 ntAPPRIS P1 BASIC24.91■■□□□ 1.58
NESP48681 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
NESP48681 RBCK1-201ENST00000353660 2511 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
NESP48681 RFPL2-203ENST00000400237 2407 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
NESP48681 YWHAE-208ENST00000571732 1818 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
NESP48681 AC109466.1-209ENST00000486913 1618 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
NESP48681 CTSS-202ENST00000448301 1421 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
NESP48681 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
NESP48681 KCTD18-202ENST00000409157 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
NESP48681 INSIG1-201ENST00000340368 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
NESP48681 ERICH1-206ENST00000522706 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
NESP48681 AC007952.5-201ENST00000572818 1486 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
NESP48681 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
NESP48681 AC104809.1-201ENST00000425110 2345 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
NESP48681 VAC14-AS1-201ENST00000398177 2145 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
NESP48681 AC253536.3-201ENST00000444093 558 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
NESP48681 LINC01875-201ENST00000454477 660 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
NESP48681 TREX1-203ENST00000456089 629 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
NESP48681 RNASEK-204ENST00000552039 591 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
NESP48681 PFDN5-220ENST00000628881 231 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
NESP48681 UBQLN1-201ENST00000257468 2299 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
NESP48681 GOT2-202ENST00000434819 1615 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
NESP48681 ST3GAL5-229ENST00000638986 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
NESP48681 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
NESP48681 GABRB2-205ENST00000517901 1779 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
NESP48681 LRRC59-201ENST00000225972 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
NESP48681 AC132872.2-201ENST00000581303 2368 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
NESP48681 SPECC1-203ENST00000395525 2536 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
NESP48681 STAG3L3-203ENST00000436857 1033 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
NESP48681 ZNF877P-201ENST00000437614 612 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
NESP48681 LINC01502-203ENST00000447907 880 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
NESP48681 RN7SL173P-201ENST00000461853 292 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
NESP48681 TMEM222-203ENST00000464813 1071 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
NESP48681 AC097381.2-201ENST00000510640 859 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
NESP48681 AC090820.1-201ENST00000519722 591 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
NESP48681 LY6E-215ENST00000523847 427 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
NESP48681 AC005865.2-202ENST00000635814 725 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
NESP48681 FDFT1-224ENST00000618539 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
NESP48681 SAMD11-202ENST00000342066 2551 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
NESP48681 SAMD11-217ENST00000622503 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
NESP48681 EN2-201ENST00000297375 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
NESP48681 PCSK4-201ENST00000300954 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
NESP48681 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
NESP48681 ZDHHC8P1-204ENST00000433168 2309 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
NESP48681 CXCL12-201ENST00000343575 1857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
NESP48681 AC139712.1-201ENST00000378256 1875 ntBASIC24.89■■□□□ 1.57
NESP48681 CAAP1-201ENST00000333916 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
NESP48681 MFNG-202ENST00000416983 2034 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
NESP48681 NXPH3-202ENST00000513748 1530 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
NESP48681 RPL3P2-204ENST00000413027 1203 ntBASIC24.89■■□□□ 1.57
NESP48681 CBR3-AS1-202ENST00000427491 741 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
NESP48681 STK24P1-201ENST00000455035 1291 ntBASIC24.89■■□□□ 1.57
NESP48681 ALG1L15P-201ENST00000482834 794 ntBASIC24.89■■□□□ 1.57
NESP48681 LAMTOR4-209ENST00000488241 613 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
NESP48681 AC087269.1-202ENST00000519147 400 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.57
NESP48681 AP003351.1-201ENST00000522743 668 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.57
NESP48681 C1orf198-207ENST00000523410 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
NESP48681 CBR3-AS1-207ENST00000608641 777 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
NESP48681 AC020922.4-201ENST00000621389 339 ntBASIC24.89■■□□□ 1.57
NESP48681 AC126755.5-201ENST00000622756 267 ntBASIC24.89■■□□□ 1.57
NESP48681 ESR1-214ENST00000638569 132 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
NESP48681 SPATA20-202ENST00000356488 2634 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
NESP48681 ALDH8A1-204ENST00000367847 1587 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
NESP48681 MAPKAP1-205ENST00000373503 3045 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 378.3 ms