Protein–RNA interactions for Protein: P46063

RECQL, ATP-dependent DNA helicase Q1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 649 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RECQLP46063 PDP1-201ENST00000297598 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RECQLP46063 WAC-203ENST00000354911 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RECQLP46063 MCFD2-201ENST00000319466 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RECQLP46063 ZMYND10-202ENST00000360165 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RECQLP46063 OGFOD2-202ENST00000397389 2308 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
RECQLP46063 ABCG5-202ENST00000405322 2896 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RECQLP46063 ARMC8-220ENST00000489213 1714 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
RECQLP46063 KRT71-201ENST00000267119 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RECQLP46063 AP4B1-204ENST00000369569 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RECQLP46063 SLC43A2-202ENST00000412517 1658 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
RECQLP46063 PIP5K1C-202ENST00000537021 3326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RECQLP46063 ZNF331-217ENST00000512387 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RECQLP46063 MLF1-216ENST00000618075 2116 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
RECQLP46063 PSMC3-213ENST00000619920 1580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RECQLP46063 CDK16-202ENST00000357227 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RECQLP46063 WDR45B-201ENST00000392325 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RECQLP46063 NFATC3-203ENST00000349223 6328 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
RECQLP46063 GRM7-215ENST00000486284 4241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
RECQLP46063 PTPN9-206ENST00000618819 7813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
RECQLP46063 CEP70-213ENST00000489254 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
RECQLP46063 ASAH1-249ENST00000637528 2215 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
RECQLP46063 AC022532.1-201ENST00000624563 1728 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
RECQLP46063 ANKMY2-201ENST00000306999 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
RECQLP46063 RTEL1-201ENST00000318100 4676 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
RECQLP46063 PRTFDC1-203ENST00000376378 747 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
RECQLP46063 DBI-203ENST00000393103 599 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
RECQLP46063 AL592464.1-201ENST00000429389 429 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
RECQLP46063 KLK4-202ENST00000431178 481 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
RECQLP46063 PRPS2-205ENST00000489404 763 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
RECQLP46063 HYAL3-206ENST00000513170 636 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
RECQLP46063 DHRS7C-202ENST00000571134 984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
RECQLP46063 STXBP2-221ENST00000602355 716 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
RECQLP46063 AC138466.3-201ENST00000619983 221 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
RECQLP46063 UGT3A1-204ENST00000507113 1650 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
RECQLP46063 LINC00900-201ENST00000499809 3322 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
RECQLP46063 ADRA2A-201ENST00000280155 3745 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.03
RECQLP46063 KIF22-208ENST00000569382 2020 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
RECQLP46063 MYH11-201ENST00000300036 6029 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
RECQLP46063 ADGRG2-207ENST00000379869 4768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
RECQLP46063 MEGF10-206ENST00000508365 2365 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
RECQLP46063 CPT2-201ENST00000371486 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
RECQLP46063 GNB2-202ENST00000393924 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
RECQLP46063 REXO1L6P-201ENST00000603433 1515 ntBASIC15.27■□□□□ 0.03
RECQLP46063 SMARCA2-208ENST00000382194 5679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
RECQLP46063 ZBED1-202ENST00000381222 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
RECQLP46063 AC073347.1-201ENST00000421633 2643 ntBASIC15.27■□□□□ 0.03
RECQLP46063 FGF1-201ENST00000337706 1469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
RECQLP46063 KCNJ18-201ENST00000567955 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
RECQLP46063 NRBP1-201ENST00000233557 2887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
RECQLP46063 ATP6V1B2-201ENST00000276390 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
RECQLP46063 TMED7-TICAM2-202ENST00000333314 3453 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
RECQLP46063 HS1BP3-203ENST00000406618 1375 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
RECQLP46063 AMZ2P1-202ENST00000430983 3425 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
RECQLP46063 DDX17-202ENST00000396821 4791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
RECQLP46063 CADPS2-205ENST00000449022 4073 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
RECQLP46063 MRPL49-201ENST00000279242 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
RECQLP46063 TTYH2-206ENST00000529107 2015 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
RECQLP46063 TLL1-201ENST00000061240 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
RECQLP46063 CCNE1-203ENST00000444983 1680 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
RECQLP46063 STEAP2-202ENST00000394621 7033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
RECQLP46063 ZNF131-214ENST00000509634 3340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
RECQLP46063 CLUHP2-201ENST00000426660 1303 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
RECQLP46063 CENPBD1P1-204ENST00000487264 1308 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
RECQLP46063 CCDC59-201ENST00000256151 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
RECQLP46063 PLXNB1-204ENST00000456774 5859 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
RECQLP46063 EIF3G-201ENST00000253108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
RECQLP46063 AL157392.1-201ENST00000412388 373 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
RECQLP46063 C9orf116-205ENST00000429260 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
RECQLP46063 ADAMTSL1-210ENST00000431052 824 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
RECQLP46063 H2AFV-207ENST00000446531 1041 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
RECQLP46063 Z93015.1-201ENST00000451718 390 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
RECQLP46063 AC092658.1-201ENST00000505836 891 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
RECQLP46063 AC005865.1-202ENST00000543036 641 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
RECQLP46063 MAP1LC3B2-202ENST00000556529 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
RECQLP46063 AL122035.1-201ENST00000556640 550 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
RECQLP46063 AC105020.3-201ENST00000566036 560 ntTSL 4 BASIC15.26■□□□□ 0.03
RECQLP46063 PLA2G4C-AS1-201ENST00000596552 568 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
RECQLP46063 PPP1R37-201ENST00000221462 3163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
RECQLP46063 CHTF18-205ENST00000455171 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
RECQLP46063 ANKK1-201ENST00000303941 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
RECQLP46063 FOXRED1-213ENST00000532125 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
RECQLP46063 AL109954.1-202ENST00000564051 2148 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
RECQLP46063 WDR1-202ENST00000382451 2722 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
RECQLP46063 TBC1D1-219ENST00000615497 2383 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
RECQLP46063 KAT5-202ENST00000352980 2059 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
RECQLP46063 MYOC-201ENST00000037502 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
RECQLP46063 RPP40-202ENST00000380051 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
RECQLP46063 DNAJC19-201ENST00000382564 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
RECQLP46063 AC092053.3-201ENST00000641308 4975 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
RECQLP46063 KLHDC8A-201ENST00000367155 2928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
RECQLP46063 EHD4-201ENST00000220325 6416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
RECQLP46063 NUDT4-201ENST00000337179 9753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
RECQLP46063 AL365199.1-201ENST00000421320 1714 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
RECQLP46063 YTHDF3-205ENST00000539294 5163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
RECQLP46063 CYTH3-201ENST00000350796 4505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
RECQLP46063 CYTH3-202ENST00000396741 4508 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
RECQLP46063 MAX-204ENST00000358402 1973 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
RECQLP46063 TBC1D3P5-202ENST00000581469 2513 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
RECQLP46063 CRISPLD2-203ENST00000564567 1651 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
RECQLP46063 PITPNM1-216ENST00000534749 4189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
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