Protein–RNA interactions for Protein: P43005

SLC1A1, Excitatory amino acid transporter 3, humanhuman

Predictions only

Length 524 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC1A1P43005 CTXND1-201ENST00000560778 6890 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SLC1A1P43005 MKS1-202ENST00000393119 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SLC1A1P43005 TRMT11-201ENST00000334379 1565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SLC1A1P43005 SMARCA2-203ENST00000349721 5761 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SLC1A1P43005 FANCG-201ENST00000378643 2631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SLC1A1P43005 ERLIN2-205ENST00000518586 2623 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SLC1A1P43005 IBA57-201ENST00000366711 7817 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SLC1A1P43005 RNF157-AS1-204ENST00000590137 1812 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SLC1A1P43005 PRAMEF25-202ENST00000619661 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SLC1A1P43005 PPP1R13L-202ENST00000418234 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SLC1A1P43005 LRRC20-204ENST00000373224 3095 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SLC1A1P43005 MRPL16-201ENST00000300151 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SLC1A1P43005 RNU1-114P-201ENST00000365297 166 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
SLC1A1P43005 LYPLA2-201ENST00000374501 1117 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SLC1A1P43005 KLF2P2-201ENST00000416807 1039 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
SLC1A1P43005 DFFBP1-201ENST00000433250 979 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
SLC1A1P43005 DLX2-AS1-201ENST00000448117 950 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SLC1A1P43005 CXorf40A-211ENST00000450602 1204 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SLC1A1P43005 PRKAG2-AS1-202ENST00000467458 1064 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SLC1A1P43005 TIMM8B-201ENST00000504148 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SLC1A1P43005 AC026434.2-201ENST00000506094 1078 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
SLC1A1P43005 AC092552.1-201ENST00000547243 906 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
SLC1A1P43005 AL132639.3-201ENST00000556537 530 ntTSL 4 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SLC1A1P43005 AC138304.1-201ENST00000563841 424 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SLC1A1P43005 MYMX-202ENST00000576476 682 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SLC1A1P43005 AP005019.2-201ENST00000615104 511 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
SLC1A1P43005 AC092506.1-201ENST00000634580 2275 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SLC1A1P43005 PNPLA5-201ENST00000216177 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SLC1A1P43005 PODN-202ENST00000371500 3287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SLC1A1P43005 FAM219A-204ENST00000379081 3543 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SLC1A1P43005 TMEM41B-204ENST00000528080 3968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SLC1A1P43005 TRAF3-202ENST00000351691 2239 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SLC1A1P43005 KLHDC7A-201ENST00000400664 5145 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SLC1A1P43005 SLC34A2-203ENST00000504570 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SLC1A1P43005 ZNF79-202ENST00000543471 2194 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SLC1A1P43005 ZNF79-203ENST00000612342 2192 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SLC1A1P43005 NDNF-201ENST00000379692 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SLC1A1P43005 CCNE1-203ENST00000444983 1680 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SLC1A1P43005 PSD2-201ENST00000274710 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SLC1A1P43005 UCP3-202ENST00000426995 1406 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SLC1A1P43005 UMODL1-AS1-201ENST00000329015 2141 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SLC1A1P43005 PRMT9-201ENST00000322396 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SLC1A1P43005 ZNF84-215ENST00000543758 3501 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SLC1A1P43005 NATD1-201ENST00000611551 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SLC1A1P43005 MAP3K1-201ENST00000399503 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SLC1A1P43005 AC007603.1-201ENST00000563124 2085 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SLC1A1P43005 INO80-201ENST00000361937 6439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SLC1A1P43005 AL391825.1-201ENST00000457671 1364 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
SLC1A1P43005 HNRNPR-212ENST00000606561 1837 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SLC1A1P43005 LINC01285-201ENST00000412422 2289 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SLC1A1P43005 CTNS-202ENST00000381870 2470 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SLC1A1P43005 FP565260.2-201ENST00000623476 1599 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SLC1A1P43005 PITPNM1-216ENST00000534749 4189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SLC1A1P43005 ITSN2-203ENST00000406921 4563 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SLC1A1P43005 FUNDC2-201ENST00000369498 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SLC1A1P43005 PUS1-202ENST00000376649 4094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SLC1A1P43005 CABP5-201ENST00000293255 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SLC1A1P43005 EIF5A-201ENST00000336452 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SLC1A1P43005 KCNK7-201ENST00000340313 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SLC1A1P43005 CKS1B-202ENST00000368436 820 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SLC1A1P43005 MFAP2-201ENST00000375534 970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SLC1A1P43005 KRTAP1-4-201ENST00000377747 408 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SLC1A1P43005 IGHV3-16-201ENST00000390604 425 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SLC1A1P43005 CPLX2-202ENST00000393745 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SLC1A1P43005 HNRNPA1P40-201ENST00000426371 1278 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
SLC1A1P43005 AL035588.1-201ENST00000438967 408 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SLC1A1P43005 RBAKDN-201ENST00000498308 514 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SLC1A1P43005 RFPL4AP1-201ENST00000530883 850 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
SLC1A1P43005 AL359711.2-201ENST00000563105 872 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
SLC1A1P43005 PIMREG-202ENST00000570337 891 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SLC1A1P43005 PIMREG-203ENST00000571373 1002 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SLC1A1P43005 SMIM22-211ENST00000615889 1047 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SLC1A1P43005 AC008761.3-201ENST00000624803 892 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
SLC1A1P43005 KISS1-202ENST00000625357 435 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SLC1A1P43005 ABR-228ENST00000574437 3196 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SLC1A1P43005 KLHDC3-203ENST00000332245 1494 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SLC1A1P43005 RPP40-202ENST00000380051 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SLC1A1P43005 USP4-203ENST00000415188 1454 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SLC1A1P43005 KATNBL1-201ENST00000256544 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SLC1A1P43005 F2RL1-201ENST00000296677 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SLC1A1P43005 PWWP2A-201ENST00000307063 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SLC1A1P43005 AC104452.1-203ENST00000636166 2266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SLC1A1P43005 NIPA1-201ENST00000337435 6567 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SLC1A1P43005 GATA3-202ENST00000379328 3078 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SLC1A1P43005 MLLT3-210ENST00000630269 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SLC1A1P43005 CHD4-201ENST00000357008 6496 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SLC1A1P43005 NDFIP2-201ENST00000218652 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SLC1A1P43005 VARS2-211ENST00000541562 3566 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SLC1A1P43005 ATP5F1-202ENST00000369722 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SLC1A1P43005 PIDD1-201ENST00000347755 2998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SLC1A1P43005 RABL2B-202ENST00000395590 2380 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SLC1A1P43005 MYLK3-201ENST00000394809 6911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SLC1A1P43005 HORMAD1-201ENST00000322343 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SLC1A1P43005 HNRNPA1P48-201ENST00000562726 1377 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
SLC1A1P43005 MROH1-209ENST00000534366 5092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SLC1A1P43005 RUSC1-202ENST00000368347 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SLC1A1P43005 CYB561D1-201ENST00000310611 5009 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SLC1A1P43005 ILF2-205ENST00000615950 1906 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SLC1A1P43005 CRELD1-203ENST00000397170 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SLC1A1P43005 HSD17B6-201ENST00000322165 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.4 ms