Protein–RNA interactions for Protein: P31150

GDI1, Rab GDP dissociation inhibitor alpha, humanhuman

Predictions only

Length 447 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GDI1P31150 TIMP3-201ENST00000266085 4603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
GDI1P31150 MYL12B-201ENST00000237500 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
GDI1P31150 C11orf52-201ENST00000278601 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
GDI1P31150 CRB3-201ENST00000308243 631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
GDI1P31150 TNNT2-206ENST00000367320 1007 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
GDI1P31150 AL627231.1-201ENST00000394467 1125 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
GDI1P31150 STX1A-202ENST00000395154 1022 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
GDI1P31150 TMEM177-203ENST00000409951 1216 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
GDI1P31150 AC069277.1-202ENST00000414438 761 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
GDI1P31150 AL021707.5-201ENST00000420118 461 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
GDI1P31150 TLE1P1-201ENST00000422965 589 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
GDI1P31150 AC012360.1-201ENST00000433219 674 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
GDI1P31150 AC098935.1-201ENST00000446057 611 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
GDI1P31150 CICP12-201ENST00000455801 843 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
GDI1P31150 AC105389.3-201ENST00000508038 907 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
GDI1P31150 MIR4750-201ENST00000584564 56 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
GDI1P31150 SCP2-217ENST00000640998 1101 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
GDI1P31150 AL805961.1-201ENST00000642026 753 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
GDI1P31150 TMEM40-204ENST00000435218 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
GDI1P31150 CDC42EP4-201ENST00000335793 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
GDI1P31150 LINC00472-203ENST00000426635 2958 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
GDI1P31150 GRSF1-208ENST00000545193 2682 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
GDI1P31150 NPHP3-201ENST00000337331 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
GDI1P31150 SLC25A45-214ENST00000534028 2432 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
GDI1P31150 PEPD-201ENST00000244137 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
GDI1P31150 OTUD6A-201ENST00000338352 1689 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
GDI1P31150 TC2N-201ENST00000340892 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
GDI1P31150 AC009242.1-201ENST00000634300 2706 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
GDI1P31150 ATG9A-205ENST00000409618 4025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
GDI1P31150 SLC29A1-205ENST00000371740 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
GDI1P31150 NSUN2-201ENST00000264670 3303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
GDI1P31150 CD8A-201ENST00000283635 2873 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
GDI1P31150 AL391005.1-201ENST00000623953 2435 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
GDI1P31150 PRR18-201ENST00000322583 3084 ntAPPRIS P2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
GDI1P31150 HSD17B6-206ENST00000555159 1525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
GDI1P31150 PPP1R21-206ENST00000449090 3049 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
GDI1P31150 GINS3-203ENST00000426538 1728 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
GDI1P31150 AC010424.3-201ENST00000635510 1745 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
GDI1P31150 SCYL1-206ENST00000525364 2584 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
GDI1P31150 PIMREG-205ENST00000572447 1948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
GDI1P31150 SLC45A1-202ENST00000471889 2784 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
GDI1P31150 IL27-201ENST00000356897 1044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
GDI1P31150 APOL3-207ENST00000424878 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
GDI1P31150 TREML1-202ENST00000426005 981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
GDI1P31150 LINC01806-201ENST00000436506 765 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
GDI1P31150 RN7SL181P-201ENST00000462921 277 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
GDI1P31150 FBXO24-204ENST00000465843 957 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
GDI1P31150 PRKRA-211ENST00000487082 1211 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
GDI1P31150 FANCA-204ENST00000534992 1088 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
GDI1P31150 AL132639.2-202ENST00000553520 467 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
GDI1P31150 AC135983.1-201ENST00000562108 1097 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
GDI1P31150 WDR7-208ENST00000589935 544 ntTSL 4 BASIC15.24■□□□□ 0.03
GDI1P31150 ACP7-202ENST00000594229 1149 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
GDI1P31150 EXOSC5-204ENST00000596905 826 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
GDI1P31150 AC007718.1-201ENST00000621078 280 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
GDI1P31150 AC011491.1-203ENST00000637688 543 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
GDI1P31150 POLR3H-202ENST00000355209 4416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
GDI1P31150 PRODH2-201ENST00000301175 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
GDI1P31150 CBFB-201ENST00000290858 3136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
GDI1P31150 CLIC5-208ENST00000544153 2051 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
GDI1P31150 BANP-204ENST00000393208 2283 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
GDI1P31150 TUBB4B-201ENST00000340384 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
GDI1P31150 CHIA-204ENST00000369740 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
GDI1P31150 PPP3CA-207ENST00000512215 4007 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
GDI1P31150 CPXM1-201ENST00000380605 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
GDI1P31150 CKMT1B-201ENST00000300283 1779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
GDI1P31150 EPHX1-202ENST00000366837 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
GDI1P31150 CKMT1A-204ENST00000434505 1779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
GDI1P31150 SLC35G2-201ENST00000393079 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
GDI1P31150 ERGIC3-203ENST00000357394 1357 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
GDI1P31150 LHFPL3-201ENST00000401970 1378 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
GDI1P31150 AL121845.3-201ENST00000490623 3119 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
GDI1P31150 DIS3-202ENST00000377780 5232 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
GDI1P31150 AP000845.1-201ENST00000581677 2131 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
GDI1P31150 NOS1AP-205ENST00000493151 5559 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
GDI1P31150 LRRC6-205ENST00000519595 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
GDI1P31150 SLC13A5-208ENST00000573648 1723 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
GDI1P31150 STRN-202ENST00000379213 2254 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
GDI1P31150 KIF5B-201ENST00000302418 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
GDI1P31150 SIX6-201ENST00000327720 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
GDI1P31150 UCN2-201ENST00000273610 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
GDI1P31150 FOXE1-201ENST00000375123 3462 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
GDI1P31150 ALOX15B-204ENST00000572022 2396 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
GDI1P31150 IER3-201ENST00000259874 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
GDI1P31150 TPM1-202ENST00000288398 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
GDI1P31150 NFU1-201ENST00000303698 1034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
GDI1P31150 CMTM5-203ENST00000359320 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
GDI1P31150 OR2K2-202ENST00000374428 1038 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
GDI1P31150 CST9L-201ENST00000376979 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
GDI1P31150 UBE4B-203ENST00000377153 1273 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
GDI1P31150 RPP25L-202ENST00000378959 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
GDI1P31150 TMEM219-202ENST00000414689 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
GDI1P31150 BX284668.5-201ENST00000422124 406 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
GDI1P31150 GLIS3-AS1-201ENST00000451340 734 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
GDI1P31150 MCPH1-AS1-203ENST00000525186 869 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
GDI1P31150 AP000911.1-202ENST00000532706 543 ntTSL 4 BASIC15.23■□□□□ 0.03
GDI1P31150 AP001160.1-201ENST00000535817 565 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
GDI1P31150 UBE3B-206ENST00000536398 1120 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
GDI1P31150 TMEM219-204ENST00000566848 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
GDI1P31150 AC093330.1-206ENST00000582546 812 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.2 ms