Protein–RNA interactions for Protein: P30536

TSPO, Translocator protein, humanhuman

Predictions only

Length 169 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSPOP30536 TRIM65-201ENST00000269383 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
TSPOP30536 TMEM104-201ENST00000335464 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
TSPOP30536 PAG1-201ENST00000220597 10744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
TSPOP30536 AC004223.3-201ENST00000593039 1638 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
TSPOP30536 ZKSCAN7-202ENST00000341840 1757 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
TSPOP30536 MYO16-203ENST00000357550 6779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
TSPOP30536 SLC22A2-202ENST00000366953 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
TSPOP30536 AC026992.2-202ENST00000565312 1934 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
TSPOP30536 PHF19-203ENST00000419155 3525 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
TSPOP30536 MPHOSPH10-205ENST00000498451 2068 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
TSPOP30536 KDM1B-201ENST00000297792 3811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
TSPOP30536 CA4-201ENST00000300900 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
TSPOP30536 POP7-201ENST00000303151 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
TSPOP30536 LRRC28-202ENST00000331450 752 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
TSPOP30536 LCE5A-201ENST00000334269 819 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
TSPOP30536 AZGP1P1-201ENST00000411909 902 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
TSPOP30536 TMEM191A-202ENST00000419950 663 ntTSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
TSPOP30536 CDH23-AS1-201ENST00000428918 378 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
TSPOP30536 GPS2P2-201ENST00000430745 888 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
TSPOP30536 TATDN3-212ENST00000530441 492 ntTSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
TSPOP30536 AC026150.2-201ENST00000564693 1156 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
TSPOP30536 CEMP1-201ENST00000565480 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
TSPOP30536 TRAPPC6A-202ENST00000585934 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
TSPOP30536 ZNF586-205ENST00000598885 578 ntTSL 4 BASIC11.65□□□□□ -0.54
TSPOP30536 WNT1-202ENST00000613114 1278 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
TSPOP30536 PDCD6-214ENST00000628729 1073 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
TSPOP30536 CACNA1C-211ENST00000399617 7482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
TSPOP30536 GCC1-201ENST00000321407 4149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
TSPOP30536 LMAN2L-201ENST00000264963 2397 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
TSPOP30536 CDHR5-203ENST00000397542 3489 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
TSPOP30536 AC008770.3-201ENST00000590798 1562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
TSPOP30536 DNM1-212ENST00000627543 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
TSPOP30536 WASHC2C-201ENST00000336378 4669 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
TSPOP30536 CHMP7-202ENST00000397677 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
TSPOP30536 COL4A1-201ENST00000375820 6532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
TSPOP30536 MAPKAPK5-206ENST00000550735 11349 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
TSPOP30536 MGME1-203ENST00000377710 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
TSPOP30536 NUTM2HP-201ENST00000442076 2498 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
TSPOP30536 ATE1-203ENST00000369043 4900 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
TSPOP30536 SMC5-201ENST00000361138 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
TSPOP30536 KRT8P12-202ENST00000472924 1397 ntBASIC11.65□□□□□ -0.55
TSPOP30536 CAND2-201ENST00000295989 4429 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
TSPOP30536 HSD17B6-206ENST00000555159 1525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.55
TSPOP30536 PKM-220ENST00000568459 1806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
TSPOP30536 CELP-203ENST00000624767 2414 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.55
TSPOP30536 NRROS-201ENST00000328557 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
TSPOP30536 FUT1-201ENST00000310160 4246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.55
TSPOP30536 GRM5-AS1-201ENST00000526448 4821 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.55
TSPOP30536 NUP133-201ENST00000261396 5207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
TSPOP30536 USP22-201ENST00000261497 5220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
TSPOP30536 STK32B-201ENST00000282908 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
TSPOP30536 SYDE1-201ENST00000342784 3264 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
TSPOP30536 CICP11-201ENST00000434745 2827 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
TSPOP30536 CARHSP1-217ENST00000611932 2833 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
TSPOP30536 AL356275.1-201ENST00000638446 7440 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
TSPOP30536 SGK2-204ENST00000373100 2225 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
TSPOP30536 HYAL2-201ENST00000357750 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
TSPOP30536 DSCAML1-203ENST00000527706 6099 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
TSPOP30536 FLJ42969-201ENST00000514926 1948 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
TSPOP30536 AC093525.2-201ENST00000564543 1944 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
TSPOP30536 TMEM147-AS1-203ENST00000589137 1627 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
TSPOP30536 DENND3-202ENST00000424248 4740 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
TSPOP30536 KIAA0513-202ENST00000538274 7381 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
TSPOP30536 PCGF2-206ENST00000618941 1499 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
TSPOP30536 TMX4-201ENST00000246024 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
TSPOP30536 CLEC16A-202ENST00000409552 3365 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
TSPOP30536 MAP3K12-203ENST00000547035 2944 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
TSPOP30536 SLC1A7-202ENST00000371494 2637 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
TSPOP30536 DHCR7-202ENST00000407721 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
TSPOP30536 CMBL-201ENST00000296658 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
TSPOP30536 REC8-209ENST00000611366 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
TSPOP30536 TOLLIP-202ENST00000317204 3617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
TSPOP30536 CETN4P-206ENST00000642099 2168 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
TSPOP30536 AGPAT1-201ENST00000336984 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
TSPOP30536 AAMP-201ENST00000248450 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
TSPOP30536 TFR2-201ENST00000223051 2888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
TSPOP30536 HDAC8-209ENST00000373589 1740 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
TSPOP30536 ZNRF3-202ENST00000406323 2878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
TSPOP30536 OXCT1-AS1-201ENST00000508458 1731 ntTSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
TSPOP30536 OTOL1-201ENST00000327928 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
TSPOP30536 MATN3-202ENST00000421259 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
TSPOP30536 ZNF575-202ENST00000458714 2285 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
TSPOP30536 FKBP2-201ENST00000309366 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
TSPOP30536 NUDT4P1-201ENST00000322209 1206 ntAPPRIS P1 BASIC11.64□□□□□ -0.55
TSPOP30536 SUV39H2-202ENST00000354919 1233 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
TSPOP30536 ZUFSP-201ENST00000368573 1225 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
TSPOP30536 CACNB2-206ENST00000377328 1233 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
TSPOP30536 AL135791.1-201ENST00000429214 826 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
TSPOP30536 ZMYND10-AS1-201ENST00000440013 250 ntTSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
TSPOP30536 SPDYE14P-201ENST00000442619 822 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
TSPOP30536 CALML4-206ENST00000467889 987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
TSPOP30536 HLA-J-203ENST00000494367 1087 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
TSPOP30536 AL160313.1-201ENST00000502101 1039 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
TSPOP30536 AKR1E2-212ENST00000532248 844 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
TSPOP30536 AC004803.1-204ENST00000543290 512 ntTSL 4 BASIC11.64□□□□□ -0.55
TSPOP30536 JKAMP-207ENST00000554271 2137 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
TSPOP30536 LINC00668-203ENST00000579012 605 ntTSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
TSPOP30536 AP001160.2-201ENST00000596071 487 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
TSPOP30536 AC097359.3-201ENST00000603982 1210 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
TSPOP30536 AL596442.2-201ENST00000610240 980 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.6 ms