Protein–RNA interactions for Protein: P30511

HLA-F, HLA class I histocompatibility antigen, alpha chain F, humanhuman

Predictions only

Length 346 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLA-FP30511 API5-203ENST00000455725 2257 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
HLA-FP30511 SNX14-215ENST00000513865 2259 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
HLA-FP30511 OR4D1-202ENST00000641449 4925 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
HLA-FP30511 PPP1CA-201ENST00000312989 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
HLA-FP30511 A1BG-AS1-204ENST00000595302 2130 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
HLA-FP30511 SRCIN1-215ENST00000621492 4644 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
HLA-FP30511 ANXA6-215ENST00000523714 2451 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
HLA-FP30511 ZNF7-202ENST00000446747 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
HLA-FP30511 SF3A2-201ENST00000221494 1963 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
HLA-FP30511 PELI2-201ENST00000267460 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
HLA-FP30511 CRHBP-201ENST00000274368 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
HLA-FP30511 GNAI2-207ENST00000451956 1486 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
HLA-FP30511 KIF18B-203ENST00000590129 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
HLA-FP30511 COL25A1-201ENST00000399126 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
HLA-FP30511 ZXDA-201ENST00000358697 4113 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
HLA-FP30511 PEPD-201ENST00000244137 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
HLA-FP30511 MGME1-202ENST00000377709 1936 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
HLA-FP30511 KL-201ENST00000380099 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
HLA-FP30511 FXN-201ENST00000377270 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
HLA-FP30511 SEPT11-203ENST00000502584 2615 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
HLA-FP30511 LONRF1-201ENST00000398246 3594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
HLA-FP30511 LINC00665-203ENST00000438368 1863 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
HLA-FP30511 SYNCRIP-202ENST00000369622 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
HLA-FP30511 SF1-209ENST00000433274 2317 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
HLA-FP30511 TUBB4B-201ENST00000340384 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
HLA-FP30511 BLCAP-204ENST00000397135 685 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.19■□□□□ 0.02
HLA-FP30511 PGAP2-214ENST00000465307 1100 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
HLA-FP30511 CHMP2B-205ENST00000494980 1175 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
HLA-FP30511 HNRNPA1P36-201ENST00000521313 955 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
HLA-FP30511 AC125603.3-201ENST00000550742 486 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
HLA-FP30511 ZNF385A-213ENST00000551771 1111 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
HLA-FP30511 AC100827.2-201ENST00000563214 1194 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
HLA-FP30511 AC132192.2-201ENST00000596206 1147 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
HLA-FP30511 BNIP3P13-201ENST00000599968 566 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
HLA-FP30511 AC008825.2-201ENST00000603374 718 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
HLA-FP30511 BX088702.1-201ENST00000610784 235 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
HLA-FP30511 AC024941.2-201ENST00000625763 493 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
HLA-FP30511 ZMYND15-204ENST00000573751 2409 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
HLA-FP30511 BDP1-202ENST00000380675 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
HLA-FP30511 AC009961.1-203ENST00000607836 2520 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
HLA-FP30511 GTF2IRD1-203ENST00000455841 3315 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
HLA-FP30511 AC007292.2-201ENST00000593524 1812 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
HLA-FP30511 AC013726.1-201ENST00000563747 2285 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
HLA-FP30511 CICP23-201ENST00000605013 2741 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
HLA-FP30511 TNKS1BP1-207ENST00000532437 5952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
HLA-FP30511 RAB3IL1-201ENST00000301773 2125 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
HLA-FP30511 RUFY2-204ENST00000399200 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
HLA-FP30511 PEG3-206ENST00000598410 5304 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
HLA-FP30511 RSPO1-202ENST00000401068 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
HLA-FP30511 LINC01101-201ENST00000622953 1884 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
HLA-FP30511 DHX36-202ENST00000329463 2985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
HLA-FP30511 ZNF302-207ENST00000505365 2955 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
HLA-FP30511 MLKL-202ENST00000308807 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
HLA-FP30511 ACOT7-203ENST00000377845 1432 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
HLA-FP30511 DLX4-202ENST00000411890 1404 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
HLA-FP30511 SYN1-202ENST00000340666 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
HLA-FP30511 TRIM13-204ENST00000420995 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
HLA-FP30511 TMPRSS4-201ENST00000437212 2074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
HLA-FP30511 TOM1L2-205ENST00000478943 2098 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
HLA-FP30511 ECSIT-201ENST00000252440 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
HLA-FP30511 ASH2L-212ENST00000545394 2808 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
HLA-FP30511 SIGLEC10-201ENST00000339313 2256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
HLA-FP30511 RASA4B-202ENST00000465829 2931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
HLA-FP30511 EIF4G3-212ENST00000602326 6196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
HLA-FP30511 ASB3-202ENST00000394717 1734 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
HLA-FP30511 AP002360.1-202ENST00000530460 2462 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
HLA-FP30511 MCFD2-201ENST00000319466 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
HLA-FP30511 AMZ2P1-202ENST00000430983 3425 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
HLA-FP30511 ULK4-203ENST00000420927 1904 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
HLA-FP30511 TEX13B-201ENST00000302917 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
HLA-FP30511 SF3B5-201ENST00000367569 693 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
HLA-FP30511 DPM3-202ENST00000368399 517 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
HLA-FP30511 RBM38-204ENST00000371219 760 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
HLA-FP30511 IP6K2-205ENST00000413298 792 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
HLA-FP30511 AL450469.2-201ENST00000427132 499 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
HLA-FP30511 AC016700.1-201ENST00000429424 312 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
HLA-FP30511 AL162742.1-201ENST00000434792 954 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
HLA-FP30511 TUBB8P8-201ENST00000458717 1058 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
HLA-FP30511 AC106047.1-202ENST00000467484 482 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
HLA-FP30511 NAPSB-201ENST00000525179 678 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
HLA-FP30511 AC007406.3-201ENST00000537295 1063 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
HLA-FP30511 AP000438.1-201ENST00000543624 749 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
HLA-FP30511 NR2C2AP-207ENST00000544883 899 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
HLA-FP30511 NRN1L-202ENST00000576147 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
HLA-FP30511 RANGRF-205ENST00000580434 749 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
HLA-FP30511 GMIP-204ENST00000587238 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
HLA-FP30511 AC005324.6-201ENST00000587972 613 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
HLA-FP30511 AL445288.1-201ENST00000610846 654 ntTSL 4 BASIC15.18■□□□□ 0.02
HLA-FP30511 AC068790.8-201ENST00000618862 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
HLA-FP30511 NDUFA11-202ENST00000418389 2406 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
HLA-FP30511 MRFAP1-202ENST00000382581 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
HLA-FP30511 MTFMT-201ENST00000220058 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
HLA-FP30511 GLT1D1-201ENST00000281703 2725 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
HLA-FP30511 SUSD4-204ENST00000366878 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
HLA-FP30511 NPHP3-201ENST00000337331 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
HLA-FP30511 LINC01107-201ENST00000446979 1975 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
HLA-FP30511 AFTPH-201ENST00000238855 4113 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
HLA-FP30511 ZFAND5-205ENST00000376962 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
HLA-FP30511 BAG1-210ENST00000634734 3786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
HLA-FP30511 AFAP1L2-202ENST00000369271 3964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.6 ms