Protein–RNA interactions for Protein: P29279

CTGF, Connective tissue growth factor, humanhuman

Predictions only

Length 349 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTGFP29279 CSAG2-204ENST00000640702 793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CTGFP29279 MAP3K9-206ENST00000555993 4449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CTGFP29279 SQLE-201ENST00000265896 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CTGFP29279 MBP-204ENST00000382582 2281 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CTGFP29279 DYNC1I1-212ENST00000630942 2249 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CTGFP29279 STIM2-203ENST00000467011 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CTGFP29279 ANKRD42-208ENST00000531895 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CTGFP29279 AC005329.1-201ENST00000501448 3571 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CTGFP29279 PUS1-208ENST00000542167 2151 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CTGFP29279 UBL4B-201ENST00000334179 1478 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CTGFP29279 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CTGFP29279 SMG1P3-206ENST00000522841 2774 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CTGFP29279 APBA2-207ENST00000558402 4031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CTGFP29279 KCNJ5-203ENST00000533599 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CTGFP29279 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CTGFP29279 LCORL-203ENST00000382226 5009 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CTGFP29279 API5-203ENST00000455725 2257 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CTGFP29279 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CTGFP29279 TCP10L2-202ENST00000366832 2185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CTGFP29279 DNM2-202ENST00000359692 3588 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CTGFP29279 RNF157-201ENST00000269391 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CTGFP29279 ANO1-201ENST00000316296 2118 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CTGFP29279 MAPK13-202ENST00000373759 1036 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CTGFP29279 CYB561D1-203ENST00000393709 620 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CTGFP29279 GSTT2B-202ENST00000404172 819 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CTGFP29279 AC112721.1-201ENST00000409162 588 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CTGFP29279 ACTG2-204ENST00000409918 927 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CTGFP29279 AC011247.2-201ENST00000457097 233 ntTSL 4 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CTGFP29279 AC112487.1-201ENST00000498032 1097 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CTGFP29279 AC109479.3-201ENST00000520163 360 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CTGFP29279 OR5BD1P-201ENST00000532527 817 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
CTGFP29279 FXYD6-FXYD2-201ENST00000532984 670 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CTGFP29279 AC226150.1-201ENST00000544259 466 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
CTGFP29279 DUXAP9-201ENST00000547220 665 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CTGFP29279 HELLS-212ENST00000630929 400 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CTGFP29279 ENDOU-203ENST00000545824 1513 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CTGFP29279 LINC00339-208ENST00000634934 1518 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CTGFP29279 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CTGFP29279 TMC7-201ENST00000304381 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CTGFP29279 SLC47A1-203ENST00000436810 1719 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CTGFP29279 RTP1-201ENST00000312295 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CTGFP29279 ELAVL2-208ENST00000544538 3789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CTGFP29279 PLPPR2-201ENST00000251473 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CTGFP29279 LINC00963-203ENST00000423918 1654 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CTGFP29279 ACTL6A-202ENST00000429709 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CTGFP29279 ZNF574-202ENST00000359044 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CTGFP29279 RTN1-201ENST00000267484 3435 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CTGFP29279 THAP10-201ENST00000249861 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CTGFP29279 THUMPD3-210ENST00000515662 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CTGFP29279 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CTGFP29279 HOXD3-201ENST00000249440 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CTGFP29279 SEMA4C-201ENST00000305476 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CTGFP29279 ZNF691-206ENST00000372508 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CTGFP29279 GPD1-205ENST00000548814 1591 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CTGFP29279 PMS1-206ENST00000418224 3018 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CTGFP29279 GPAT2-201ENST00000359548 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CTGFP29279 UBAC2-AS1-201ENST00000426037 1771 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CTGFP29279 IMPDH1-202ENST00000348127 2479 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CTGFP29279 LRIT1-201ENST00000372105 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CTGFP29279 ZNF226-201ENST00000300823 817 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CTGFP29279 MBD3L4-201ENST00000381394 775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CTGFP29279 KLK11-203ENST00000391804 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CTGFP29279 PTTG1IP-202ENST00000397886 755 ntTSL 4 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CTGFP29279 GYPC-203ENST00000409836 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CTGFP29279 RAD51C-203ENST00000421782 567 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CTGFP29279 AC092580.1-201ENST00000433998 658 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
CTGFP29279 RPL9-203ENST00000449470 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CTGFP29279 AC106047.2-201ENST00000511723 743 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
CTGFP29279 IGHVIII-5-2-201ENST00000522505 261 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
CTGFP29279 BANF1-205ENST00000527348 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CTGFP29279 AP003390.1-201ENST00000533253 523 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CTGFP29279 TMEM202-AS1-201ENST00000562573 723 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CTGFP29279 AC100778.2-201ENST00000580150 483 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CTGFP29279 AC006548.2-201ENST00000605217 529 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
CTGFP29279 AL118522.1-201ENST00000611368 560 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
CTGFP29279 AL137793.2-201ENST00000632635 659 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CTGFP29279 CPSF1-213ENST00000620219 4462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CTGFP29279 ELOF1-203ENST00000586683 2154 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CTGFP29279 C18orf63-201ENST00000579455 5127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
CTGFP29279 PRMT2-207ENST00000440086 1932 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
CTGFP29279 PIGQ-201ENST00000026218 2846 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
CTGFP29279 RGL2-247ENST00000497454 3278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
CTGFP29279 TRMT10B-207ENST00000537911 2108 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
CTGFP29279 RSPO1-202ENST00000401068 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
CTGFP29279 NRSN2-210ENST00000621012 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
CTGFP29279 DDX51-202ENST00000397333 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
CTGFP29279 KCNN2-201ENST00000264773 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
CTGFP29279 ATF4-202ENST00000396680 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
CTGFP29279 ZNF423-206ENST00000563137 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
CTGFP29279 CLPTM1-202ENST00000541297 2732 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
CTGFP29279 GLS2-216ENST00000610413 2296 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
CTGFP29279 SEC14L4-201ENST00000255858 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
CTGFP29279 TRIM9-202ENST00000338969 3312 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
CTGFP29279 TBC1D17-202ENST00000535102 2025 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
CTGFP29279 SLC2A13-202ENST00000380858 3082 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CTGFP29279 AL513315.1-201ENST00000640756 1370 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CTGFP29279 METTL9-201ENST00000358154 3256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CTGFP29279 RARA-206ENST00000425707 3041 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CTGFP29279 WDR20-211ENST00000556807 2382 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CTGFP29279 ACTN4-201ENST00000252699 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 78.4 ms