Protein–RNA interactions for Protein: P24723

PRKCH, Protein kinase C eta type, humanhuman

Predictions only

Length 683 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKCHP24723 GABARAPL2-201ENST00000037243 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PRKCHP24723 C9orf16-201ENST00000372994 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PRKCHP24723 CDKN1A-202ENST00000373711 793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PRKCHP24723 MYLK2-202ENST00000375994 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PRKCHP24723 CRYAA-203ENST00000398133 600 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PRKCHP24723 AC017104.1-201ENST00000415129 720 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PRKCHP24723 AL365277.1-206ENST00000417869 487 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PRKCHP24723 AL592464.1-201ENST00000429389 429 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PRKCHP24723 SPATA3-204ENST00000433428 856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PRKCHP24723 DRGX-202ENST00000434016 955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PRKCHP24723 AL365277.1-204ENST00000450157 599 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PRKCHP24723 AL365277.1-203ENST00000458207 693 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PRKCHP24723 SLC45A2-204ENST00000509381 1040 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PRKCHP24723 CLRN2-201ENST00000511148 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PRKCHP24723 GNLY-210ENST00000524600 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PRKCHP24723 C11orf98-201ENST00000524958 654 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PRKCHP24723 RAB40B-202ENST00000538809 704 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PRKCHP24723 RIT1-205ENST00000539040 919 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PRKCHP24723 LINC02279-201ENST00000553435 737 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PRKCHP24723 SDR39U1-212ENST00000555365 976 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PRKCHP24723 AC009133.1-202ENST00000563806 494 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PRKCHP24723 GPR182-203ENST00000622922 591 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
PRKCHP24723 FP236240.1-202ENST00000624019 601 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PRKCHP24723 ARHGAP4-202ENST00000370016 3095 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PRKCHP24723 TSPOAP1-202ENST00000343736 5947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PRKCHP24723 GOLGA6L2-201ENST00000312015 1379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PRKCHP24723 C1orf159-202ENST00000379320 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PRKCHP24723 LHCGR-202ENST00000401907 1477 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PRKCHP24723 MICALL1-201ENST00000215957 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PRKCHP24723 PGBD5-202ENST00000525115 1569 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PRKCHP24723 NKIRAS1-203ENST00000415901 1644 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PRKCHP24723 DDHD2-201ENST00000397166 4921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PRKCHP24723 USP25-201ENST00000285679 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PRKCHP24723 MLST8-201ENST00000301724 1735 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PRKCHP24723 AC025674.2-201ENST00000522622 2971 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PRKCHP24723 ELF2-202ENST00000379549 3005 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PRKCHP24723 MARCKS-201ENST00000612661 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PRKCHP24723 IPPK-201ENST00000287996 4401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PRKCHP24723 TOM1L2-205ENST00000478943 2098 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PRKCHP24723 GALNT16-202ENST00000448469 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PRKCHP24723 SRPRA-206ENST00000532259 2453 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PRKCHP24723 POU2F2-207ENST00000529067 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PRKCHP24723 STAT1-203ENST00000392323 2723 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PRKCHP24723 SLC35A2-204ENST00000376521 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PRKCHP24723 SEPT9-208ENST00000541152 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PRKCHP24723 E2F6-212ENST00000546212 3191 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PRKCHP24723 PFDN5-202ENST00000334478 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PRKCHP24723 BEX2-202ENST00000372677 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PRKCHP24723 PFDN6-202ENST00000374607 598 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PRKCHP24723 PFDN6-203ENST00000374610 521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PRKCHP24723 C17orf51-202ENST00000412778 877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PRKCHP24723 KLK4-202ENST00000431178 481 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PRKCHP24723 DGCR5-204ENST00000440005 1299 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PRKCHP24723 CR769775.1-201ENST00000443347 931 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PRKCHP24723 AL356489.1-201ENST00000449144 1144 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PRKCHP24723 AC114812.1-204ENST00000449669 728 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
PRKCHP24723 AC080188.2-201ENST00000508985 552 ntTSL 4 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PRKCHP24723 FAM8A2P-201ENST00000528813 1142 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
PRKCHP24723 NOP2-211ENST00000540228 668 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PRKCHP24723 AC034102.5-201ENST00000548731 540 ntTSL 4 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PRKCHP24723 DUX4L45-201ENST00000566406 1057 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
PRKCHP24723 DYNLRB2-205ENST00000568035 409 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PRKCHP24723 RN7SL560P-201ENST00000577943 264 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
PRKCHP24723 ETV2-208ENST00000621247 941 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PRKCHP24723 BMP7-201ENST00000395863 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PRKCHP24723 CKMT2-201ENST00000254035 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PRKCHP24723 SMYD3-214ENST00000490107 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PRKCHP24723 CCDC51-204ENST00000442740 1554 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PRKCHP24723 RPS9-205ENST00000402367 1617 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PRKCHP24723 THEMIS2-203ENST00000373925 1650 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PRKCHP24723 GOLGA8H-201ENST00000566740 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PRKCHP24723 GOLGA8J-201ENST00000567927 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PRKCHP24723 PLD3-201ENST00000356508 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PRKCHP24723 ZNF586-202ENST00000396150 1977 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PRKCHP24723 FZD4-201ENST00000531380 7383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PRKCHP24723 OR2V1-205ENST00000642036 2609 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PRKCHP24723 RPL15-201ENST00000307839 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PRKCHP24723 TEAD3-201ENST00000338863 2983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PRKCHP24723 FAM114A2-215ENST00000522858 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PRKCHP24723 RRBP1-204ENST00000377813 5041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PRKCHP24723 ZNF628-203ENST00000598519 3847 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PRKCHP24723 IL12RB2-206ENST00000544434 3782 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PRKCHP24723 ATXN10-202ENST00000381061 3135 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PRKCHP24723 RGPD6-202ENST00000330331 2848 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PRKCHP24723 RGPD8-202ENST00000330575 2848 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PRKCHP24723 TSEN2-201ENST00000284995 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PRKCHP24723 SLC26A10-201ENST00000320442 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PRKCHP24723 FAN1-207ENST00000565466 2304 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PRKCHP24723 LINC01010-201ENST00000431422 2069 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PRKCHP24723 GPANK1-203ENST00000375896 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PRKCHP24723 ZNF32-AS3-201ENST00000458063 1932 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PRKCHP24723 C4A-243ENST00000428956 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PRKCHP24723 C4B-202ENST00000435363 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PRKCHP24723 ZKSCAN7-202ENST00000341840 1757 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PRKCHP24723 POU5F1-204ENST00000471529 1723 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PRKCHP24723 SNUPN-206ENST00000564675 1682 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PRKCHP24723 UBL7-AS1-203ENST00000564621 1612 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PRKCHP24723 AC007787.1-201ENST00000588095 1583 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
PRKCHP24723 EGOT-201ENST00000414938 1464 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PRKCHP24723 ZNF365-205ENST00000395254 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.2 ms