Protein–RNA interactions for Protein: P23434

GCSH, Glycine cleavage system H protein, mitochondrial, humanhuman

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Length 173 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCSHP23434 CNTN1-203ENST00000547702 3033 ntTSL 2 BASIC11.1□□□□□ -0.63
GCSHP23434 TWSG1-201ENST00000262120 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
GCSHP23434 AL512652.2-201ENST00000625156 1716 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
GCSHP23434 TFAP2D-201ENST00000008391 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
GCSHP23434 GPD2-208ENST00000438166 2457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
GCSHP23434 FYN-205ENST00000368682 3234 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
GCSHP23434 MYO9B-201ENST00000397274 7532 ntTSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
GCSHP23434 UCKL1-201ENST00000354216 1837 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
GCSHP23434 SLC7A8-212ENST00000529705 1819 ntTSL 2 BASIC11.1□□□□□ -0.63
GCSHP23434 SAMD15-201ENST00000216471 2564 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.1□□□□□ -0.63
GCSHP23434 SMARCA4-204ENST00000444061 4938 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
GCSHP23434 SGMS1-203ENST00000429490 3634 ntTSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
GCSHP23434 ZNF71-201ENST00000328070 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
GCSHP23434 MRNIP-201ENST00000292586 1238 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
GCSHP23434 BAX-203ENST00000354470 433 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
GCSHP23434 LMO4-201ENST00000370542 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
GCSHP23434 AC021188.1-201ENST00000421534 740 ntTSL 3 BASIC11.1□□□□□ -0.63
GCSHP23434 HHATL-AS1-201ENST00000423165 557 ntTSL 4 BASIC11.1□□□□□ -0.63
GCSHP23434 TREML1-203ENST00000437044 647 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
GCSHP23434 TMEM205-202ENST00000447337 916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.1□□□□□ -0.63
GCSHP23434 TWIST2-201ENST00000448943 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
GCSHP23434 FBXL21-206ENST00000495672 589 ntTSL 4 BASIC11.1□□□□□ -0.63
GCSHP23434 KIAA0930-215ENST00000496226 589 ntTSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
GCSHP23434 AC112191.1-201ENST00000523689 701 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
GCSHP23434 STT3A-AS1-201ENST00000530526 429 ntTSL 3 BASIC11.1□□□□□ -0.63
GCSHP23434 DUX4L17-201ENST00000557360 1267 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
GCSHP23434 LINC00596-201ENST00000559615 937 ntTSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
GCSHP23434 PRELID3A-208ENST00000590956 777 ntTSL 2 BASIC11.1□□□□□ -0.63
GCSHP23434 AC106028.4-201ENST00000614509 607 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
GCSHP23434 CITED2-204ENST00000618718 901 ntTSL 2 BASIC11.1□□□□□ -0.63
GCSHP23434 AC092634.8-201ENST00000639687 773 ntTSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
GCSHP23434 PGLYRP1-201ENST00000008938 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
GCSHP23434 RAB6C-201ENST00000410061 3075 ntAPPRIS P1 BASIC11.1□□□□□ -0.63
GCSHP23434 KCTD10-208ENST00000540089 3096 ntTSL 2 BASIC11.1□□□□□ -0.63
GCSHP23434 CEP19-202ENST00000409690 2201 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
GCSHP23434 RGMA-204ENST00000543599 3174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
GCSHP23434 SETD1B-204ENST00000619791 5901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
GCSHP23434 TMEM177-201ENST00000272521 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
GCSHP23434 PRR22-202ENST00000419421 1392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.1□□□□□ -0.63
GCSHP23434 GRM7-215ENST00000486284 4241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
GCSHP23434 RAB44-202ENST00000612677 4233 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
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GCSHP23434 HMBS-209ENST00000537841 1559 ntTSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
GCSHP23434 EIF2B3-201ENST00000360403 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
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GCSHP23434 DNM2-204ENST00000408974 3013 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.1□□□□□ -0.63
GCSHP23434 KIAA1549-202ENST00000440172 12379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
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GCSHP23434 VIPAS39-202ENST00000343765 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
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GCSHP23434 SRRM4-201ENST00000267260 8477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
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GCSHP23434 ZNF501-205ENST00000620116 3382 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC11.09□□□□□ -0.63
GCSHP23434 PRAME-214ENST00000543184 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
GCSHP23434 AL365205.1-204ENST00000359201 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
GCSHP23434 AL591623.1-201ENST00000417786 1960 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
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GCSHP23434 EMILIN1-201ENST00000380320 3943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
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GCSHP23434 CLTA-201ENST00000242285 1152 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
GCSHP23434 TMEM179B-201ENST00000333449 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
GCSHP23434 NDUFA4L2-201ENST00000393825 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
GCSHP23434 IZUMO4-201ENST00000395296 869 ntTSL 2 BASIC11.09□□□□□ -0.63
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GCSHP23434 SHF-202ENST00000458022 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.09□□□□□ -0.63
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GCSHP23434 UBE2V2-201ENST00000517630 612 ntTSL 4 BASIC11.09□□□□□ -0.63
GCSHP23434 RIMS4-202ENST00000541604 1036 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
GCSHP23434 TUBB3-205ENST00000554336 903 ntTSL 3 BASIC11.09□□□□□ -0.63
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GCSHP23434 LINC01128-208ENST00000608189 824 ntTSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
GCSHP23434 LINC01128-210ENST00000609139 455 ntTSL 3 BASIC11.09□□□□□ -0.63
GCSHP23434 METTL13-202ENST00000362019 3022 ntTSL 2 BASIC11.09□□□□□ -0.63
GCSHP23434 TTC7A-203ENST00000409245 3033 ntTSL 2 BASIC11.09□□□□□ -0.63
GCSHP23434 RBMS1-201ENST00000348849 4273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
GCSHP23434 YME1L1-202ENST00000375972 2517 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
GCSHP23434 DYRK1B-202ENST00000348817 2448 ntTSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
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