Protein–RNA interactions for Protein: P18206

VCL, Vinculin, humanhuman

Predictions only

Length 1,134 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VCLP18206 DGAT2L6-201ENST00000333026 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
VCLP18206 ELAVL2-201ENST00000223951 3763 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
VCLP18206 ZSCAN32-205ENST00000439568 1746 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
VCLP18206 ZMYM3-204ENST00000373982 1867 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
VCLP18206 MFF-204ENST00000353339 2186 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
VCLP18206 PPFIA3-203ENST00000602351 4341 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
VCLP18206 KDM2B-205ENST00000536437 2762 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
VCLP18206 HSDL2-202ENST00000398805 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
VCLP18206 DHX36-213ENST00000496811 6733 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
VCLP18206 RHNO1-202ENST00000461997 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
VCLP18206 CEACAM19-202ENST00000403660 1982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
VCLP18206 AL354714.1-201ENST00000356006 2136 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
VCLP18206 BTN1A1-201ENST00000244513 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
VCLP18206 PRSS30P-201ENST00000390681 2881 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
VCLP18206 SPRED1-201ENST00000299084 7780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
VCLP18206 ZFP64-201ENST00000216923 3264 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
VCLP18206 ALOX15-201ENST00000293761 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
VCLP18206 ZEB1-AS1-208ENST00000607166 2503 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
VCLP18206 TBC1D1-219ENST00000615497 2383 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
VCLP18206 BPGM-201ENST00000344924 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
VCLP18206 ODF3-201ENST00000325113 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
VCLP18206 RGR-201ENST00000358110 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
VCLP18206 RCOR2-201ENST00000301459 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
VCLP18206 UBR2-201ENST00000372899 7857 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
VCLP18206 UBR2-202ENST00000372901 7857 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
VCLP18206 DHCR7-202ENST00000407721 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
VCLP18206 ARRDC4-201ENST00000268042 4072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
VCLP18206 NCOR2-203ENST00000404621 8520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
VCLP18206 AC097376.2-205ENST00000610159 5334 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
VCLP18206 KCTD1-203ENST00000417602 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
VCLP18206 ZEB2-225ENST00000558170 4012 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
VCLP18206 DRD5P1-201ENST00000456605 1438 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
VCLP18206 TMPRSS6-202ENST00000381792 3260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
VCLP18206 PHLDA2-201ENST00000314222 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
VCLP18206 TNFRSF12A-202ENST00000341627 881 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
VCLP18206 FANK1-204ENST00000368695 1296 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
VCLP18206 ATP1A1-AS1-202ENST00000369492 1011 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
VCLP18206 NDUFB8-202ENST00000370320 684 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
VCLP18206 PGGT1B-202ENST00000379615 903 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
VCLP18206 SZT2-AS1-201ENST00000396885 699 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
VCLP18206 IFNL3-201ENST00000413851 656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
VCLP18206 RPSAP31-202ENST00000445165 716 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
VCLP18206 AL451067.1-201ENST00000453111 394 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
VCLP18206 CLNS1A-210ENST00000528364 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
VCLP18206 AC243562.3-201ENST00000559866 1212 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
VCLP18206 LINC00928-204ENST00000561201 1123 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
VCLP18206 AC009486.1-201ENST00000569860 813 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
VCLP18206 AC124283.3-201ENST00000570869 594 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
VCLP18206 AC010327.1-201ENST00000587871 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
VCLP18206 AC015936.2-201ENST00000593177 259 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
VCLP18206 AC107373.2-201ENST00000607735 490 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
VCLP18206 KATNB1-201ENST00000379661 2664 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
VCLP18206 KIF1BP-214ENST00000638119 2537 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
VCLP18206 TAB1-201ENST00000216160 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
VCLP18206 KIF1A-201ENST00000320389 8832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
VCLP18206 TATDN3-202ENST00000366974 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
VCLP18206 TCAF1-205ENST00000479870 5733 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
VCLP18206 IRAK4-212ENST00000551736 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
VCLP18206 HNF1B-201ENST00000613727 1546 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
VCLP18206 ABCA7-203ENST00000435683 6211 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
VCLP18206 SDR42E2-201ENST00000602312 2630 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
VCLP18206 SPAG9-201ENST00000262013 8273 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
VCLP18206 EXOC6B-202ENST00000410104 5795 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
VCLP18206 COX10-AS1-202ENST00000449363 1944 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
VCLP18206 RALYL-207ENST00000521695 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
VCLP18206 GJD2-201ENST00000290374 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
VCLP18206 KIF1C-201ENST00000320785 7919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
VCLP18206 AC107918.4-201ENST00000641966 3141 ntBASIC15.21■□□□□ 0.02
VCLP18206 MRPL11-201ENST00000310999 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
VCLP18206 PDPK1-201ENST00000268673 4728 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
VCLP18206 ZNF143-213ENST00000530463 2022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
VCLP18206 CICP11-201ENST00000434745 2827 ntBASIC15.21■□□□□ 0.02
VCLP18206 INPP5B-204ENST00000373026 3230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
VCLP18206 GUCD1-206ENST00000435822 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
VCLP18206 ANKRD18A-201ENST00000399703 4041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
VCLP18206 INTS14-204ENST00000442903 1863 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
VCLP18206 MEOX2-201ENST00000262041 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
VCLP18206 MAGI1-201ENST00000330909 7415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
VCLP18206 KIF17-201ENST00000247986 3969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
VCLP18206 GRAPL-201ENST00000344415 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
VCLP18206 PDRG1-201ENST00000202017 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
VCLP18206 PES1-201ENST00000335214 1988 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
VCLP18206 SMARCA4-207ENST00000541122 5139 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
VCLP18206 KCNT1-208ENST00000488444 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
VCLP18206 FAM8A1-201ENST00000259963 4677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
VCLP18206 MAP2K7-201ENST00000397979 3361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
VCLP18206 AC025674.2-201ENST00000522622 2971 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
VCLP18206 CDT1-201ENST00000301019 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
VCLP18206 NEDD4L-202ENST00000356462 3335 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
VCLP18206 NFU1-201ENST00000303698 1034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
VCLP18206 MAGEA12-203ENST00000393900 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
VCLP18206 LNCPRESS1-201ENST00000429254 756 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
VCLP18206 AL807752.4-201ENST00000439076 580 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
VCLP18206 TTTY23B-201ENST00000442790 549 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
VCLP18206 GIMAP3P-201ENST00000495150 836 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
VCLP18206 SERF1A-205ENST00000507348 663 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
VCLP18206 MTX3-202ENST00000512528 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
VCLP18206 AP001360.1-202ENST00000526934 479 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
VCLP18206 GABARAPL2-202ENST00000563744 791 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
VCLP18206 INO80C-210ENST00000590757 595 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.3 ms