Protein–RNA interactions for Protein: P17081

RHOQ, Rho-related GTP-binding protein RhoQ, humanhuman

Predictions only

Length 205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RHOQP17081 AL391650.2-201ENST00000640097 941 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RHOQP17081 SCAF11-204ENST00000395454 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RHOQP17081 EPHA5-202ENST00000354839 3427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RHOQP17081 CBLN4-201ENST00000064571 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RHOQP17081 SUMO1-203ENST00000392246 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RHOQP17081 UGGT2-204ENST00000397618 1547 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RHOQP17081 FBXO8-202ENST00000503293 1546 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RHOQP17081 MAGED4B-207ENST00000485287 2618 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RHOQP17081 ABCC1-201ENST00000399408 6594 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RHOQP17081 ABCC1-202ENST00000399410 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RHOQP17081 ECE1-204ENST00000415912 5099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RHOQP17081 CENPBD1P1-204ENST00000487264 1308 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RHOQP17081 TIGD4-201ENST00000304337 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RHOQP17081 BCAT2-201ENST00000316273 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RHOQP17081 TRMT11-201ENST00000334379 1565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RHOQP17081 RPS6KL1-201ENST00000354625 5195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RHOQP17081 HNRNPA1-202ENST00000340913 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RHOQP17081 ZXDC-202ENST00000389709 3405 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RHOQP17081 KIAA1211-206ENST00000541073 4117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RHOQP17081 KCNN2-201ENST00000264773 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RHOQP17081 LINC01136-203ENST00000457348 2539 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RHOQP17081 KIAA1211-203ENST00000504228 4628 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RHOQP17081 ALDH3A2-221ENST00000581518 2785 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RHOQP17081 RSPH6A-202ENST00000597055 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RHOQP17081 SYT13-201ENST00000020926 5144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RHOQP17081 MSI2-202ENST00000322684 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RHOQP17081 GOLGA8R-201ENST00000327271 1896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RHOQP17081 CPSF7-205ENST00000439958 3524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RHOQP17081 NFYA-202ENST00000353205 1660 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RHOQP17081 SPAG1-202ENST00000388798 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RHOQP17081 CICP24-201ENST00000605464 2705 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
RHOQP17081 TDRD10-201ENST00000368480 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RHOQP17081 BST2-201ENST00000252593 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RHOQP17081 LCN9-201ENST00000277526 531 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RHOQP17081 AC011450.1-202ENST00000358234 573 ntTSL 4 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RHOQP17081 C9orf16-201ENST00000372994 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RHOQP17081 NCR3-204ENST00000376073 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RHOQP17081 TPO-206ENST00000382269 1155 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RHOQP17081 MCFD2-204ENST00000409207 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RHOQP17081 FAM221A-203ENST00000409653 761 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RHOQP17081 FAM221A-204ENST00000409994 1136 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RHOQP17081 CNN2P10-201ENST00000443067 918 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
RHOQP17081 HDAC2-AS2-213ENST00000520891 603 ntTSL 4 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RHOQP17081 AC090099.4-201ENST00000527671 1027 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RHOQP17081 VPS18-202ENST00000558474 873 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RHOQP17081 LINC00621-201ENST00000577004 1177 ntTSL 4 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RHOQP17081 TUBB6-210ENST00000590967 430 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RHOQP17081 ZACNP1-201ENST00000612259 710 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
RHOQP17081 LCN9-204ENST00000619315 528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RHOQP17081 SLC26A1-202ENST00000398516 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RHOQP17081 RNF157-AS1-204ENST00000590137 1812 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RHOQP17081 GPN1-212ENST00000616939 1832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RHOQP17081 TMCO5B-204ENST00000529696 1568 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RHOQP17081 SCAMP4-202ENST00000409472 2394 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RHOQP17081 SLC25A38-201ENST00000273158 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RHOQP17081 IDH2-201ENST00000330062 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RHOQP17081 INTS11-204ENST00000421495 1868 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RHOQP17081 PRPF40B-201ENST00000261897 3602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RHOQP17081 TNS2-201ENST00000314250 5010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RHOQP17081 PTGES3L-AARSD1-202ENST00000409103 1670 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RHOQP17081 RNF167-214ENST00000576229 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RHOQP17081 EML4-201ENST00000318522 5549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RHOQP17081 BCL11A-201ENST00000335712 5942 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RHOQP17081 CSAD-202ENST00000379843 2086 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RHOQP17081 AC023824.1-201ENST00000562945 2975 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
RHOQP17081 USP47-207ENST00000527733 4525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RHOQP17081 AC027601.1-201ENST00000575922 4506 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RHOQP17081 ANKRD50-202ENST00000515641 4212 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RHOQP17081 CYTH2-214ENST00000641098 2721 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RHOQP17081 USP35-204ENST00000530267 2419 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RHOQP17081 AMN1-201ENST00000281471 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RHOQP17081 CALD1-206ENST00000424922 2124 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RHOQP17081 BCAR3-210ENST00000539242 2114 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RHOQP17081 FKBP6-201ENST00000252037 1500 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RHOQP17081 KRT17-201ENST00000311208 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RHOQP17081 FGD1-201ENST00000375135 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RHOQP17081 DYSF-207ENST00000409762 6727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RHOQP17081 DYSF-211ENST00000429174 6739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RHOQP17081 OTUD7A-201ENST00000307050 10770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RHOQP17081 TMEM141-201ENST00000290079 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RHOQP17081 NOL4L-202ENST00000326071 701 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RHOQP17081 SPAG11A-201ENST00000326558 612 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RHOQP17081 CKLF-203ENST00000351137 508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RHOQP17081 FAM27C-201ENST00000377542 616 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RHOQP17081 PHACTR1-202ENST00000379329 707 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RHOQP17081 IGHV3-35-201ENST00000390617 366 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RHOQP17081 SELENOM-201ENST00000400299 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RHOQP17081 RGS5-214ENST00000429865 754 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RHOQP17081 GEMIN4-202ENST00000437269 1182 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RHOQP17081 MAATS1-203ENST00000463700 939 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RHOQP17081 STAG3L5P-205ENST00000473757 1255 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RHOQP17081 CDC23-208ENST00000505120 455 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RHOQP17081 GCOM2-201ENST00000509133 1104 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
RHOQP17081 TNNT1-212ENST00000588981 1163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RHOQP17081 YIF1B-215ENST00000592246 936 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RHOQP17081 AC092384.2-204ENST00000565053 2566 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RHOQP17081 ARNT2-209ENST00000622346 2932 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RHOQP17081 ERO1B-202ENST00000354619 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RHOQP17081 MED15-202ENST00000292733 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RHOQP17081 GRB7-203ENST00000394209 1955 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70.2 ms