Protein–RNA interactions for Protein: P11388

TOP2A, DNA topoisomerase 2-alpha, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,531 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOP2AP11388 AC108734.2-201ENST00000420887 1069 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
TOP2AP11388 THRB-AS1-202ENST00000438096 702 ntTSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
TOP2AP11388 CSNK1G2P1-201ENST00000442675 955 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
TOP2AP11388 AP003390.1-201ENST00000533253 523 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
TOP2AP11388 HERC2P11-201ENST00000562845 725 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
TOP2AP11388 AC100756.2-201ENST00000569537 736 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
TOP2AP11388 SNHG15-205ENST00000580458 710 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
TOP2AP11388 RPL13A-213ENST00000621674 1098 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
TOP2AP11388 WDR13-202ENST00000376729 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
TOP2AP11388 GCH1-204ENST00000491895 2943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
TOP2AP11388 FOXP1-218ENST00000498215 2400 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
TOP2AP11388 ZNF620-202ENST00000418905 2022 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
TOP2AP11388 AC067931.2-201ENST00000623655 2003 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
TOP2AP11388 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
TOP2AP11388 IL3RA-201ENST00000331035 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
TOP2AP11388 AC015688.4-201ENST00000580780 1647 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
TOP2AP11388 FMR1-215ENST00000616382 1648 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
TOP2AP11388 LHX3-203ENST00000619587 2698 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
TOP2AP11388 KCTD6-202ENST00000404589 1533 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
TOP2AP11388 CRHBP-201ENST00000274368 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
TOP2AP11388 FAM103A1-201ENST00000304191 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
TOP2AP11388 CUTA-203ENST00000374500 937 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
TOP2AP11388 FAM92A-202ENST00000423990 914 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
TOP2AP11388 RNF144A-AS1-203ENST00000426122 579 ntTSL 4 BASIC25.47■■□□□ 1.67
TOP2AP11388 AC007319.1-201ENST00000453517 802 ntTSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
TOP2AP11388 AC011247.2-201ENST00000457097 233 ntTSL 4 BASIC25.47■■□□□ 1.67
TOP2AP11388 MUTYH-231ENST00000488731 740 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
TOP2AP11388 LINC02435-201ENST00000508291 584 ntTSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
TOP2AP11388 HIST2H2BF-204ENST00000545683 999 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
TOP2AP11388 CSAG3-203ENST00000638835 793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
TOP2AP11388 CSAG2-204ENST00000640702 793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
TOP2AP11388 PNKD-202ENST00000258362 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
TOP2AP11388 AL162727.3-201ENST00000635661 2787 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
TOP2AP11388 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
TOP2AP11388 MBD1-211ENST00000585595 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
TOP2AP11388 SSH1-201ENST00000326470 2432 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
TOP2AP11388 IL1F10-202ENST00000393197 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
TOP2AP11388 CRYGC-201ENST00000282141 629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
TOP2AP11388 OBSCN-AS1-201ENST00000295012 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
TOP2AP11388 CHTF8-202ENST00000398235 1073 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
TOP2AP11388 ACTG2-204ENST00000409918 927 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
TOP2AP11388 LTF-202ENST00000417439 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
TOP2AP11388 AL161932.2-201ENST00000435436 679 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
TOP2AP11388 AREG-202ENST00000502307 956 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
TOP2AP11388 LINC01154-201ENST00000548617 454 ntTSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
TOP2AP11388 NDUFB10P1-201ENST00000567319 521 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
TOP2AP11388 AC023421.2-201ENST00000589510 313 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
TOP2AP11388 SLC12A5-219ENST00000628272 401 ntTSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
TOP2AP11388 SNTB1-201ENST00000395601 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
TOP2AP11388 MS4A15-201ENST00000337911 1536 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
TOP2AP11388 SFT2D3-201ENST00000310981 3735 ntAPPRIS P1 BASIC25.46■■□□□ 1.67
TOP2AP11388 CD59-201ENST00000351554 1775 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
TOP2AP11388 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
TOP2AP11388 FARS2-202ENST00000324331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
TOP2AP11388 C15orf38-AP3S2-201ENST00000398333 2439 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
TOP2AP11388 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
TOP2AP11388 TEKT4P2-202ENST00000559466 1312 ntBASIC25.45■■□□□ 1.67
TOP2AP11388 RBP1-205ENST00000492918 1487 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
TOP2AP11388 SNCAIP-207ENST00000504884 1885 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
TOP2AP11388 HEY1-202ENST00000354724 2293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
TOP2AP11388 ACP2-212ENST00000533929 1366 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
TOP2AP11388 OXA1L-202ENST00000358043 1750 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
TOP2AP11388 RNF166-210ENST00000568683 1768 ntTSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
TOP2AP11388 MAEL-202ENST00000367872 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
TOP2AP11388 ABAT-203ENST00000425191 1923 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
TOP2AP11388 ANXA6-215ENST00000523714 2451 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
TOP2AP11388 AC112721.1-201ENST00000409162 588 ntTSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
TOP2AP11388 AC019118.2-201ENST00000425776 718 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
TOP2AP11388 LINC02228-201ENST00000507600 534 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
TOP2AP11388 PRR7-AS1-204ENST00000514846 543 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
TOP2AP11388 LINC01485-202ENST00000520324 566 ntTSL 4 BASIC25.45■■□□□ 1.66
TOP2AP11388 JAKMIP1-205ENST00000410077 1835 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
TOP2AP11388 LINC002481-201ENST00000499502 1821 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
TOP2AP11388 Z84468.1-201ENST00000626321 1408 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
TOP2AP11388 TRIM46-211ENST00000611379 3082 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
TOP2AP11388 F2-201ENST00000311907 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
TOP2AP11388 GPX3-201ENST00000388825 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
TOP2AP11388 TDRD10-201ENST00000368480 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
TOP2AP11388 TMEM117-201ENST00000266534 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
TOP2AP11388 POLR3K-201ENST00000293860 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
TOP2AP11388 IRF9-202ENST00000396864 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
TOP2AP11388 CCDC47-201ENST00000225726 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
TOP2AP11388 POLR2L-201ENST00000322028 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
TOP2AP11388 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
TOP2AP11388 YY1AP1-211ENST00000368340 2927 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
TOP2AP11388 AIF1L-205ENST00000372301 671 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
TOP2AP11388 HCG9-201ENST00000376800 663 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
TOP2AP11388 RLN3-201ENST00000431365 580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
TOP2AP11388 SWAP70-202ENST00000447399 3538 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
TOP2AP11388 RUFY2-205ENST00000454950 2613 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
TOP2AP11388 SCARNA12-201ENST00000459155 270 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
TOP2AP11388 CD59-210ENST00000528700 652 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
TOP2AP11388 KLF17P1-201ENST00000547105 1126 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
TOP2AP11388 AC093567.1-201ENST00000590649 877 ntTSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
TOP2AP11388 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
TOP2AP11388 AC011471.3-201ENST00000623576 402 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
TOP2AP11388 AL121956.4-201ENST00000629925 581 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
TOP2AP11388 C2orf50-201ENST00000381585 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
TOP2AP11388 ZCCHC17-201ENST00000344147 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
TOP2AP11388 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 74.8 ms