Protein–RNA interactions for Protein: P05106

ITGB3, Integrin beta-3, humanhuman

Predictions only

Length 788 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGB3P05106 PPY2P-201ENST00000582808 702 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
ITGB3P05106 PPY2P-202ENST00000583761 657 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ITGB3P05106 TUBB6-210ENST00000590967 430 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ITGB3P05106 TECR-207ENST00000596073 1170 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ITGB3P05106 TECR-220ENST00000600083 1204 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ITGB3P05106 KRT8P4-201ENST00000509735 1454 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
ITGB3P05106 AC009093.2-202ENST00000620513 2079 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
ITGB3P05106 EDN3-201ENST00000311585 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ITGB3P05106 ANKRD35-201ENST00000355594 3342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ITGB3P05106 UBAP1-201ENST00000297661 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ITGB3P05106 CTSD-201ENST00000236671 2123 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ITGB3P05106 ENDOU-203ENST00000545824 1513 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ITGB3P05106 CENPBD1P1-204ENST00000487264 1308 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ITGB3P05106 MKNK2-201ENST00000250896 3774 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ITGB3P05106 CDSN-202ENST00000376288 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ITGB3P05106 FUCA2-201ENST00000002165 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ITGB3P05106 KATNA1-201ENST00000335643 1564 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ITGB3P05106 PSMD13-203ENST00000431206 1591 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ITGB3P05106 CRCP-201ENST00000338592 1393 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ITGB3P05106 FBXO5-202ENST00000367241 2221 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ITGB3P05106 ZC3H14-204ENST00000336693 2007 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ITGB3P05106 NOP2-222ENST00000617555 2017 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ITGB3P05106 YWHAE-208ENST00000571732 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ITGB3P05106 TNRC18P2-201ENST00000417666 2714 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
ITGB3P05106 SLC4A2-214ENST00000485713 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ITGB3P05106 NOVA2-201ENST00000263257 7803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ITGB3P05106 CCDC68-204ENST00000591504 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ITGB3P05106 PDE8B-202ENST00000333194 2572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ITGB3P05106 LCOR-202ENST00000356016 4834 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ITGB3P05106 NR1H3-203ENST00000405853 1480 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ITGB3P05106 PLTP-201ENST00000354050 1731 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ITGB3P05106 C9orf24-201ENST00000297623 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ITGB3P05106 C9orf24-205ENST00000379133 712 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ITGB3P05106 GATD1-203ENST00000397472 790 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ITGB3P05106 PEX13-202ENST00000401576 1108 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ITGB3P05106 SERF2-209ENST00000409646 559 ntTSL 4 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ITGB3P05106 AL157392.1-201ENST00000412388 373 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ITGB3P05106 TMEM225B-203ENST00000453227 1041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ITGB3P05106 TMEM14B-210ENST00000473276 730 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ITGB3P05106 RPL23A-206ENST00000496182 636 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ITGB3P05106 MRPL36-204ENST00000508987 686 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ITGB3P05106 FAM153B-214ENST00000512862 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ITGB3P05106 OSGIN2-203ENST00000520659 801 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ITGB3P05106 AC000032.1-201ENST00000562538 491 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ITGB3P05106 STXBP2-221ENST00000602355 716 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ITGB3P05106 TMEM14B-220ENST00000612333 888 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ITGB3P05106 GRAP-201ENST00000284154 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ITGB3P05106 XKR7-201ENST00000562532 7844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ITGB3P05106 KRT17-201ENST00000311208 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ITGB3P05106 AL162231.1-201ENST00000421828 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ITGB3P05106 LENG8-208ENST00000610347 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ITGB3P05106 HORMAD1-201ENST00000322343 1771 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ITGB3P05106 HMGA1-202ENST00000347617 1773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ITGB3P05106 TIMP2-201ENST00000262768 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ITGB3P05106 EID1-201ENST00000530028 2298 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ITGB3P05106 ICA1L-201ENST00000358299 3457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ITGB3P05106 KCNAB2-212ENST00000458166 1336 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ITGB3P05106 WDR45-224ENST00000485908 1301 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ITGB3P05106 TANGO2-205ENST00000401886 1559 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ITGB3P05106 SMYD1-203ENST00000444564 1816 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ITGB3P05106 EXO5-203ENST00000372703 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ITGB3P05106 SLC25A33-201ENST00000302692 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ITGB3P05106 BCL11A-201ENST00000335712 5942 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ITGB3P05106 CACNA1G-205ENST00000360761 7497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ITGB3P05106 PDGFRL-201ENST00000251630 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ITGB3P05106 CNTFR-204ENST00000610543 1926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ITGB3P05106 PARP10-201ENST00000313028 3497 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ITGB3P05106 FCHO1-206ENST00000594202 3214 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ITGB3P05106 KLK5-202ENST00000391809 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ITGB3P05106 DUS4L-201ENST00000265720 2220 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ITGB3P05106 TBC1D8-202ENST00000409318 3803 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ITGB3P05106 DIDO1-201ENST00000266070 8574 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ITGB3P05106 TGFBR2-201ENST00000295754 4621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ITGB3P05106 PDE3A-201ENST00000359062 7576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ITGB3P05106 EXOC7-213ENST00000467929 2260 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ITGB3P05106 GFOD1-203ENST00000379287 8751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ITGB3P05106 ALK-201ENST00000389048 6220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ITGB3P05106 ECSIT-201ENST00000252440 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ITGB3P05106 NPAS2-201ENST00000335681 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ITGB3P05106 XKR5-201ENST00000618742 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ITGB3P05106 BLMH-201ENST00000261714 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ITGB3P05106 C11orf52-201ENST00000278601 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ITGB3P05106 TPM2-202ENST00000360958 1189 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ITGB3P05106 AC004945.1-201ENST00000416738 983 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
ITGB3P05106 RGS5-214ENST00000429865 754 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ITGB3P05106 MAATS1-203ENST00000463700 939 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ITGB3P05106 AC080188.2-201ENST00000508985 552 ntTSL 4 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ITGB3P05106 NDUFC1-210ENST00000539387 725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ITGB3P05106 NDRG2-226ENST00000554104 2146 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ITGB3P05106 AL133153.2-201ENST00000557524 303 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ITGB3P05106 LINC00621-201ENST00000577004 1177 ntTSL 4 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ITGB3P05106 MIR4683-201ENST00000579659 81 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
ITGB3P05106 HVCN1-202ENST00000356742 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ITGB3P05106 AC087164.1-202ENST00000583062 2158 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ITGB3P05106 GNB4-201ENST00000232564 6434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ITGB3P05106 LDHAL6B-201ENST00000307144 1693 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ITGB3P05106 FAM180B-201ENST00000538490 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ITGB3P05106 CERS3-202ENST00000394113 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ITGB3P05106 AC003986.2-201ENST00000419944 1711 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ITGB3P05106 PABPC4-202ENST00000372857 3048 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 94 ms