Protein–RNA interactions for Protein: O95602

POLR1A, DNA-directed RNA polymerase I subunit RPA1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,720 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR1AO95602 AC244197.1-201ENST00000456494 951 ntBASIC21.32■■□□□ 1
POLR1AO95602 AC105219.2-201ENST00000527908 299 ntTSL 4 BASIC21.32■■□□□ 1
POLR1AO95602 AC069185.1-202ENST00000533405 471 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
POLR1AO95602 MT1H-202ENST00000569155 697 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
POLR1AO95602 HNRNPA1-202ENST00000340913 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
POLR1AO95602 RASA4B-202ENST00000465829 2931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
POLR1AO95602 AL354813.1-201ENST00000526566 2437 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
POLR1AO95602 AC010547.4-201ENST00000561754 1378 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
POLR1AO95602 CNN3-207ENST00000545882 1902 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
POLR1AO95602 NR4A1-204ENST00000394825 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
POLR1AO95602 ERRFI1-201ENST00000377482 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
POLR1AO95602 PIAS4-201ENST00000262971 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
POLR1AO95602 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
POLR1AO95602 LINC00513-201ENST00000447430 1616 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
POLR1AO95602 LINC02021-201ENST00000504808 1608 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
POLR1AO95602 NUP88-207ENST00000573584 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
POLR1AO95602 ARL8B-208ENST00000611208 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
POLR1AO95602 MAPK8IP1-202ENST00000395629 3180 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
POLR1AO95602 CLDN22-201ENST00000323319 2581 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
POLR1AO95602 MTFMT-201ENST00000220058 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
POLR1AO95602 TMEM119-201ENST00000392806 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
POLR1AO95602 AL157414.3-201ENST00000624276 1954 ntBASIC21.31■■□□□ 1
POLR1AO95602 ABHD4-201ENST00000216327 716 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
POLR1AO95602 NPFF-201ENST00000267017 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
POLR1AO95602 OBSCN-AS1-201ENST00000295012 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
POLR1AO95602 HIST1H2AE-201ENST00000303910 509 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
POLR1AO95602 NQO2-202ENST00000380430 1098 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
POLR1AO95602 SERF2-209ENST00000409646 559 ntTSL 4 BASIC21.31■■□□□ 1
POLR1AO95602 TRPM2-AS-201ENST00000423310 586 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
POLR1AO95602 AC233724.6-201ENST00000503184 1088 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
POLR1AO95602 HIST2H2BF-204ENST00000545683 999 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
POLR1AO95602 ATP2A1-AS1-201ENST00000561547 558 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
POLR1AO95602 AP005131.2-201ENST00000589045 487 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
POLR1AO95602 PGPEP1-206ENST00000597431 545 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
POLR1AO95602 ASNSD1-206ENST00000607062 968 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
POLR1AO95602 AC009145.4-201ENST00000625119 1294 ntBASIC21.31■■□□□ 1
POLR1AO95602 AL138720.1-201ENST00000629853 778 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
POLR1AO95602 CSAG3-203ENST00000638835 793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
POLR1AO95602 CSAG2-204ENST00000640702 793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
POLR1AO95602 HVCN1-202ENST00000356742 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
POLR1AO95602 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
POLR1AO95602 AC060234.2-201ENST00000428825 1610 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
POLR1AO95602 KIFC3-205ENST00000540079 2781 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
POLR1AO95602 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
POLR1AO95602 MEX3C-204ENST00000616921 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
POLR1AO95602 CLCN2-201ENST00000265593 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
POLR1AO95602 MAPK3-204ENST00000395200 997 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
POLR1AO95602 AC156455.1-203ENST00000423999 893 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
POLR1AO95602 KRT17P4-201ENST00000429445 819 ntBASIC21.3■■□□□ 1
POLR1AO95602 TSPY25P-201ENST00000429463 745 ntBASIC21.3■■□□□ 1
POLR1AO95602 AC020636.2-201ENST00000569170 1189 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
POLR1AO95602 MIR3180-2-201ENST00000581748 88 ntBASIC21.3■■□□□ 1
POLR1AO95602 CYP4B1-215ENST00000640628 969 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
POLR1AO95602 NDUFB6-203ENST00000379847 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
POLR1AO95602 ESRRB-207ENST00000556177 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
POLR1AO95602 MEIKIN-205ENST00000616644 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
POLR1AO95602 NFYC-205ENST00000372654 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
POLR1AO95602 RPP40-202ENST00000380051 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
POLR1AO95602 CKM-201ENST00000221476 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
POLR1AO95602 DRC3-216ENST00000584166 1953 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
POLR1AO95602 AL390755.1-201ENST00000623716 2027 ntBASIC21.3■■□□□ 1
POLR1AO95602 ZBTB32-202ENST00000392197 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
POLR1AO95602 SERPINE2-202ENST00000409304 2161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
POLR1AO95602 MIER1-208ENST00000401041 2552 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
POLR1AO95602 CYP4F22-201ENST00000269703 2641 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
POLR1AO95602 DACT1-202ENST00000395153 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
POLR1AO95602 TDRP-205ENST00000613071 3421 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
POLR1AO95602 DTNB-228ENST00000496972 2328 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
POLR1AO95602 ZNF398-205ENST00000491174 2232 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
POLR1AO95602 MEOX1-202ENST00000329168 2129 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
POLR1AO95602 APBB1-219ENST00000608704 2095 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
POLR1AO95602 AGPAT1-201ENST00000336984 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
POLR1AO95602 SLC50A1-202ENST00000368401 1166 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
POLR1AO95602 RPSAP15-201ENST00000448168 861 ntBASIC21.29■■□□□ 1
POLR1AO95602 OR2T27-202ENST00000460972 1136 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
POLR1AO95602 AC012213.1-201ENST00000517376 722 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
POLR1AO95602 HTATIP2-205ENST00000530266 713 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
POLR1AO95602 LINC01783-202ENST00000614408 828 ntBASIC21.29■■□□□ 1
POLR1AO95602 BX284668.2-205ENST00000619677 828 ntBASIC21.29■■□□□ 1
POLR1AO95602 AC133540.1-201ENST00000620845 1019 ntBASIC21.29■■□□□ 1
POLR1AO95602 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
POLR1AO95602 PPP1R9B-202ENST00000612501 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
POLR1AO95602 NR2F1-201ENST00000327111 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
POLR1AO95602 ST3GAL3-209ENST00000361400 2195 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
POLR1AO95602 CISH-202ENST00000443053 2167 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
POLR1AO95602 NRBP2-202ENST00000442628 3587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
POLR1AO95602 EPS8L2-201ENST00000318562 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
POLR1AO95602 AC007743.1-201ENST00000596663 3075 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
POLR1AO95602 NUP62-212ENST00000597723 1824 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
POLR1AO95602 ATP6V0D1-201ENST00000290949 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
POLR1AO95602 C2-205ENST00000418949 1658 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
POLR1AO95602 ADSL-201ENST00000216194 1620 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
POLR1AO95602 SERPINA3-203ENST00000467132 2660 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
POLR1AO95602 IQCA1L-203ENST00000615129 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
POLR1AO95602 TINF2-202ENST00000399423 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
POLR1AO95602 POLR2L-201ENST00000322028 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
POLR1AO95602 HIST1H1B-201ENST00000331442 681 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
POLR1AO95602 EEF1B2-203ENST00000392222 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
POLR1AO95602 PPM1N-201ENST00000396735 895 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
POLR1AO95602 PPM1N-208ENST00000456399 618 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.1 ms