Protein–RNA interactions for Protein: O76041

NEBL, Nebulette, humanhuman

Predictions only

Length 1,014 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEBLO76041 SNHG28-203ENST00000621242 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NEBLO76041 FKBP4-208ENST00000630279 156 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NEBLO76041 GLIDR-204ENST00000638724 1765 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NEBLO76041 NLRP13-201ENST00000342929 3132 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NEBLO76041 ANP32A-203ENST00000465139 2440 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NEBLO76041 FAM219A-203ENST00000379080 3591 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NEBLO76041 ZBTB32-202ENST00000392197 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NEBLO76041 RBM33-205ENST00000392759 1580 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NEBLO76041 MINDY4-201ENST00000265299 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NEBLO76041 SCAMP4-202ENST00000409472 2394 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NEBLO76041 HSPA4L-204ENST00000508776 3020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NEBLO76041 FHOD3-201ENST00000257209 4967 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NEBLO76041 LIMD2-201ENST00000259006 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NEBLO76041 PWWP2A-201ENST00000307063 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NEBLO76041 RNPS1-220ENST00000566458 2037 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NEBLO76041 PGC-202ENST00000373025 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NEBLO76041 STXBP5-207ENST00000546097 2160 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NEBLO76041 MYLK-201ENST00000346322 5892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NEBLO76041 NACC2-202ENST00000371753 6802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NEBLO76041 SDC1-201ENST00000254351 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NEBLO76041 AC131212.3-201ENST00000624087 4219 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
NEBLO76041 HAL-202ENST00000538703 2637 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NEBLO76041 ATP5B-201ENST00000262030 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NEBLO76041 MAN1B1-202ENST00000371589 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NEBLO76041 SPOCK3-210ENST00000506886 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NEBLO76041 SPOCK3-218ENST00000511531 2908 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NEBLO76041 TP73-205ENST00000378285 2117 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NEBLO76041 PPP2R5E-201ENST00000337537 6659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NEBLO76041 PAX3-206ENST00000392070 2258 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NEBLO76041 USP22-201ENST00000261497 5220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NEBLO76041 ACY3-201ENST00000255082 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NEBLO76041 MOCS1-201ENST00000340692 2747 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NEBLO76041 ZC3HAV1-204ENST00000471652 3182 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NEBLO76041 AFF3-201ENST00000317233 8135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NEBLO76041 KAT7-210ENST00000509773 1774 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NEBLO76041 AC079447.1-201ENST00000424491 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NEBLO76041 DPYSL2-204ENST00000521913 4805 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NEBLO76041 BAIAP2-220ENST00000575712 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NEBLO76041 PCDHGA11-201ENST00000398587 4647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NEBLO76041 TMEM52-201ENST00000310991 929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NEBLO76041 VCX2-201ENST00000317103 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NEBLO76041 HNRNPF-201ENST00000337970 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NEBLO76041 FCRLB-204ENST00000367946 1152 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NEBLO76041 NRAS-201ENST00000369535 4449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NEBLO76041 GK-202ENST00000378941 458 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NEBLO76041 KRTAP6-3-201ENST00000391624 636 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NEBLO76041 TBC1D8-202ENST00000409318 3803 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NEBLO76041 RPSAP31-202ENST00000445165 716 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NEBLO76041 PCCB-204ENST00000462637 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NEBLO76041 LACTB2-203ENST00000522447 1034 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NEBLO76041 STAU2-219ENST00000522509 2173 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NEBLO76041 SIPA1-203ENST00000527525 3235 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NEBLO76041 RAB35-202ENST00000534951 939 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NEBLO76041 AP000721.1-201ENST00000535431 559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NEBLO76041 COQ7-202ENST00000544894 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NEBLO76041 AL596325.1-201ENST00000563991 1082 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
NEBLO76041 AC015688.8-201ENST00000577746 656 ntTSL 4 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NEBLO76041 VCX-203ENST00000620630 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NEBLO76041 CREB3L2-208ENST00000620715 1053 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NEBLO76041 DBI-211ENST00000627093 554 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NEBLO76041 AC004461.2-201ENST00000629517 803 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
NEBLO76041 AC004840.1-201ENST00000636359 365 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
NEBLO76041 IER3IP1-202ENST00000639845 832 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NEBLO76041 NRCAM-217ENST00000613830 3025 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NEBLO76041 CELF1-201ENST00000310513 4583 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NEBLO76041 LTA-214ENST00000454783 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NEBLO76041 RAD51D-218ENST00000590016 1528 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NEBLO76041 ATE1-202ENST00000369040 4803 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NEBLO76041 ECE1-201ENST00000264205 2381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NEBLO76041 ARHGEF26-203ENST00000465817 2353 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NEBLO76041 CYB5D2-201ENST00000301391 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NEBLO76041 MFSD11-211ENST00000588460 3612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NEBLO76041 PI4K2A-201ENST00000370631 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NEBLO76041 SNHG22-201ENST00000589499 1615 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NEBLO76041 NKIRAS1-201ENST00000388759 2335 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NEBLO76041 GORAB-202ENST00000367763 2189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NEBLO76041 KIAA0895L-201ENST00000290881 3550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NEBLO76041 TGIF2-201ENST00000373872 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NEBLO76041 UBXN11-206ENST00000374222 2043 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NEBLO76041 TMED1-201ENST00000214869 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NEBLO76041 AKR7L-202ENST00000429712 1313 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NEBLO76041 PDE8B-202ENST00000333194 2572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NEBLO76041 TMEM50A-201ENST00000374358 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NEBLO76041 WSCD1-202ENST00000539421 2665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NEBLO76041 DDO-202ENST00000368924 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NEBLO76041 MARVELD3-201ENST00000268485 2912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NEBLO76041 DEK-201ENST00000244776 1441 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NEBLO76041 FDPS-202ENST00000368356 1431 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NEBLO76041 TMEM92-201ENST00000300433 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NEBLO76041 UBQLN1-202ENST00000376395 4118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NEBLO76041 AC068580.4-201ENST00000636615 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NEBLO76041 WDFY2-203ENST00000612477 6932 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NEBLO76041 PKIG-203ENST00000372887 769 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NEBLO76041 AL096814.1-202ENST00000372963 647 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NEBLO76041 AKIP1-204ENST00000396648 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NEBLO76041 AL807752.4-201ENST00000439076 580 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NEBLO76041 AL158198.1-201ENST00000449143 380 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NEBLO76041 AL161781.2-201ENST00000509911 739 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NEBLO76041 ZNF890P-202ENST00000530367 1156 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
NEBLO76041 CDK4-206ENST00000549606 558 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.3 ms