Protein–RNA interactions for Protein: O75386

TULP3, Tubby-related protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 442 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TULP3O75386 YY1AP1-210ENST00000368339 3073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TULP3O75386 GRIN2A-201ENST00000330684 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TULP3O75386 KCP-208ENST00000620378 4515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TULP3O75386 SLC5A7-201ENST00000264047 5152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TULP3O75386 TPBG-202ENST00000535040 3392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TULP3O75386 INPPL1-207ENST00000538751 4656 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TULP3O75386 SLC26A1-202ENST00000398516 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TULP3O75386 PPP1R16B-202ENST00000373331 6106 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TULP3O75386 C11orf80-201ENST00000360962 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TULP3O75386 LAPTM5-201ENST00000294507 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TULP3O75386 PDK2-201ENST00000007708 2384 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TULP3O75386 CA10-203ENST00000451037 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TULP3O75386 TCP10-202ENST00000397829 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TULP3O75386 CASQ1-201ENST00000368078 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TULP3O75386 KCNQ2-204ENST00000359125 3253 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TULP3O75386 HMOX2-204ENST00000414777 1752 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TULP3O75386 ZNF385A-201ENST00000338010 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TULP3O75386 HGSNAT-207ENST00000521576 2332 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TULP3O75386 LZTS1-201ENST00000265801 5459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TULP3O75386 ABCG5-202ENST00000405322 2896 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TULP3O75386 CCAR2-202ENST00000389279 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TULP3O75386 KCNS1-201ENST00000306117 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TULP3O75386 KIF26A-201ENST00000315264 6714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TULP3O75386 TARBP2-203ENST00000456234 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TULP3O75386 DNAJC22-201ENST00000395069 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TULP3O75386 CKM-201ENST00000221476 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TULP3O75386 CRISPLD2-203ENST00000564567 1651 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TULP3O75386 MYCN-202ENST00000638417 1693 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TULP3O75386 DEPDC5-203ENST00000400242 2395 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TULP3O75386 LIPE-AS1-205ENST00000594688 2383 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TULP3O75386 PSD4-201ENST00000245796 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TULP3O75386 RNF183-201ENST00000297894 1830 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TULP3O75386 TFB2M-201ENST00000366514 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TULP3O75386 AKIP1-201ENST00000299576 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TULP3O75386 FAM24B-202ENST00000368898 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TULP3O75386 UCK1-203ENST00000372211 2114 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TULP3O75386 VCX3B-201ENST00000381029 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TULP3O75386 SLC25A24P2-201ENST00000415059 510 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
TULP3O75386 IGHJ2P-201ENST00000454480 60 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
TULP3O75386 PGAP2-214ENST00000465307 1100 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TULP3O75386 ANO1-AS1-201ENST00000524987 646 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TULP3O75386 AC113192.2-201ENST00000525320 308 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TULP3O75386 NEU3-202ENST00000526068 431 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TULP3O75386 AC126696.1-201ENST00000561567 756 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TULP3O75386 TMEM219-203ENST00000561899 1249 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TULP3O75386 AP000229.1-202ENST00000609365 559 ntTSL 4 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TULP3O75386 SMIM22-211ENST00000615889 1047 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TULP3O75386 SGK3-211ENST00000522398 3106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TULP3O75386 STRN-202ENST00000379213 2254 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TULP3O75386 ZNF620-202ENST00000418905 2022 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TULP3O75386 RCOR3-203ENST00000419091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TULP3O75386 OR4D1-202ENST00000641449 4925 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TULP3O75386 AC136759.1-203ENST00000527477 2196 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TULP3O75386 IMPDH1-202ENST00000348127 2479 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TULP3O75386 SLC20A1-201ENST00000272542 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TULP3O75386 LINC00327-203ENST00000576696 1308 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TULP3O75386 PPIL6-207ENST00000521072 4128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TULP3O75386 RPP40-202ENST00000380051 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TULP3O75386 AP1S3-206ENST00000443700 1785 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TULP3O75386 CADPS2-205ENST00000449022 4073 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TULP3O75386 PPP1R37-201ENST00000221462 3163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TULP3O75386 HSPA12B-201ENST00000254963 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TULP3O75386 INSIG1-201ENST00000340368 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TULP3O75386 ZNF180-202ENST00000391956 3049 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TULP3O75386 ARMC5-204ENST00000538189 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TULP3O75386 NFE2L2-201ENST00000397062 2853 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TULP3O75386 ANKRD23-201ENST00000318357 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TULP3O75386 DMTN-206ENST00000443491 2415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TULP3O75386 DLGAP1-214ENST00000539435 2402 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TULP3O75386 DEGS1-201ENST00000323699 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TULP3O75386 AL109954.1-202ENST00000564051 2148 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
TULP3O75386 CAMK2D-207ENST00000505990 1802 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TULP3O75386 PDHB-206ENST00000474765 1503 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TULP3O75386 COL9A1-204ENST00000370496 1372 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TULP3O75386 PUDP-202ENST00000412827 1376 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TULP3O75386 B3GAT1-201ENST00000312527 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TULP3O75386 CDR2L-201ENST00000337231 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TULP3O75386 AC136621.1-201ENST00000624017 2304 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
TULP3O75386 DDX55-201ENST00000238146 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TULP3O75386 TMED7-TICAM2-202ENST00000333314 3453 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TULP3O75386 CENPT-202ENST00000440851 2200 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TULP3O75386 YIPF7-201ENST00000332990 937 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TULP3O75386 RN7SKP175-201ENST00000408472 289 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
TULP3O75386 DMKN-204ENST00000408915 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TULP3O75386 AL021707.3-201ENST00000418803 527 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TULP3O75386 AC005077.2-201ENST00000449786 690 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
TULP3O75386 SEPT7P2-209ENST00000450436 601 ntTSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TULP3O75386 SERPINA13P-202ENST00000478994 924 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
TULP3O75386 ZNF527-203ENST00000483919 1142 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TULP3O75386 AC044849.1-201ENST00000519737 1188 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
TULP3O75386 AC007406.3-201ENST00000537295 1063 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TULP3O75386 SSTR5-AS1-201ENST00000565992 575 ntTSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TULP3O75386 RPS15-202ENST00000585665 467 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TULP3O75386 AC004637.1-201ENST00000586675 482 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TULP3O75386 RPS5-209ENST00000601521 1203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TULP3O75386 CDCP2-201ENST00000371330 2723 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TULP3O75386 ANKRD26-201ENST00000376087 6591 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TULP3O75386 LENG8-208ENST00000610347 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TULP3O75386 PITPNM1-202ENST00000436757 4216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TULP3O75386 NLRX1-202ENST00000409109 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.3 ms