Protein–RNA interactions for Protein: O75145

PPFIA3, Liprin-alpha-3, humanhuman

Predictions only

Length 1,194 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPFIA3O75145 CACNG5-201ENST00000307139 926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PPFIA3O75145 MGST3-203ENST00000367885 680 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
PPFIA3O75145 NDUFA3-203ENST00000391763 338 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
PPFIA3O75145 PGF-202ENST00000405431 666 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
PPFIA3O75145 AL929472.3-201ENST00000433474 700 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
PPFIA3O75145 INE1-201ENST00000456273 945 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
PPFIA3O75145 AC097717.1-202ENST00000457577 740 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
PPFIA3O75145 RN7SL837P-201ENST00000463010 287 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
PPFIA3O75145 MRPL36-204ENST00000508987 686 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
PPFIA3O75145 AC012640.1-201ENST00000509915 688 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
PPFIA3O75145 MRPL52-211ENST00000555536 451 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
PPFIA3O75145 AC005520.2-201ENST00000556194 573 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
PPFIA3O75145 SPIN2A-203ENST00000614076 966 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
PPFIA3O75145 METTL26-214ENST00000614890 801 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
PPFIA3O75145 ABCC1-201ENST00000399408 6594 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
PPFIA3O75145 ABCC1-202ENST00000399410 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PPFIA3O75145 TMCO3-207ENST00000474393 2843 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
PPFIA3O75145 MAP3K11-208ENST00000530153 2830 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
PPFIA3O75145 SRSF5-203ENST00000553521 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PPFIA3O75145 INPP5E-201ENST00000371712 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PPFIA3O75145 ZNF74-209ENST00000611540 3714 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
PPFIA3O75145 MAGED4B-202ENST00000360134 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PPFIA3O75145 EIF3J-AS1-201ENST00000313807 2863 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PPFIA3O75145 ACVR1B-206ENST00000542485 2362 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
PPFIA3O75145 MICAL1-201ENST00000358577 3142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PPFIA3O75145 LINC01101-201ENST00000622953 1884 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
PPFIA3O75145 CD300C-201ENST00000330793 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PPFIA3O75145 SPATA33-210ENST00000611218 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
PPFIA3O75145 AP001267.2-201ENST00000532619 2086 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
PPFIA3O75145 WDR20-203ENST00000335263 2616 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PPFIA3O75145 HPGD-202ENST00000296522 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
PPFIA3O75145 PDP1-203ENST00000517764 2140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
PPFIA3O75145 FGFR1-204ENST00000356207 3824 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
PPFIA3O75145 CDCA7-202ENST00000347703 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
PPFIA3O75145 AC020659.1-201ENST00000309874 2900 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
PPFIA3O75145 SCGN-202ENST00000377961 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
PPFIA3O75145 SPRY4-202ENST00000434127 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
PPFIA3O75145 PAX6-202ENST00000379107 2579 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
PPFIA3O75145 DDX49-201ENST00000247003 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
PPFIA3O75145 TMPRSS2-202ENST00000398585 3240 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
PPFIA3O75145 RPL39L-201ENST00000296277 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
PPFIA3O75145 ADAMTSL1-208ENST00000380570 931 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
PPFIA3O75145 AL136311.1-206ENST00000416069 899 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
PPFIA3O75145 TMEM247-204ENST00000434431 680 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
PPFIA3O75145 ATP5G2P4-201ENST00000442175 420 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
PPFIA3O75145 AC078785.1-203ENST00000467342 573 ntTSL 4 BASIC17.66■□□□□ 0.42
PPFIA3O75145 LINC01336-201ENST00000503568 534 ntTSL 4 BASIC17.66■□□□□ 0.42
PPFIA3O75145 AC067930.5-201ENST00000531730 1173 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
PPFIA3O75145 ST8SIA2-202ENST00000539113 1089 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
PPFIA3O75145 ZSCAN2-213ENST00000541040 965 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
PPFIA3O75145 AP000808.2-201ENST00000542410 569 ntTSL 4 BASIC17.66■□□□□ 0.42
PPFIA3O75145 AL132639.3-201ENST00000556537 530 ntTSL 4 BASIC17.66■□□□□ 0.42
PPFIA3O75145 AC010319.3-201ENST00000597028 470 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
PPFIA3O75145 ATF5-205ENST00000600336 682 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
PPFIA3O75145 DSE-202ENST00000359564 4037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
PPFIA3O75145 SELENON-203ENST00000374315 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
PPFIA3O75145 KLK6-203ENST00000391808 1478 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
PPFIA3O75145 ABCC9-203ENST00000326684 1693 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
PPFIA3O75145 HENMT1-202ENST00000370032 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
PPFIA3O75145 AC018442.1-201ENST00000421439 2061 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
PPFIA3O75145 AIFM1-209ENST00000535724 2468 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
PPFIA3O75145 PHLDA1-203ENST00000619060 5913 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
PPFIA3O75145 C15orf52-202ENST00000397536 4717 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
PPFIA3O75145 CYTH3-201ENST00000350796 4505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
PPFIA3O75145 CYTH3-202ENST00000396741 4508 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
PPFIA3O75145 HSDL1-201ENST00000219439 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
PPFIA3O75145 TPM1-206ENST00000358278 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
PPFIA3O75145 AC026688.2-201ENST00000518984 1734 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
PPFIA3O75145 ETV7-201ENST00000339796 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
PPFIA3O75145 GNB2-202ENST00000393924 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
PPFIA3O75145 SLC25A36-201ENST00000324194 1301 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
PPFIA3O75145 KCNC2-208ENST00000549446 5625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
PPFIA3O75145 VWCE-202ENST00000335613 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
PPFIA3O75145 NCAPH2-201ENST00000299821 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
PPFIA3O75145 INHBE-201ENST00000266646 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
PPFIA3O75145 HTR3A-205ENST00000504030 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
PPFIA3O75145 FAM172A-206ENST00000509163 1369 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
PPFIA3O75145 ZNF785-202ENST00000470110 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
PPFIA3O75145 PI4K2A-201ENST00000370631 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
PPFIA3O75145 POLR3D-202ENST00000397802 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
PPFIA3O75145 CPD-201ENST00000225719 9394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
PPFIA3O75145 LINC00667-206ENST00000582363 2935 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
PPFIA3O75145 AC004223.3-201ENST00000593039 1638 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
PPFIA3O75145 GLIS2-201ENST00000262366 4469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
PPFIA3O75145 AC232323.1-201ENST00000540724 2099 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
PPFIA3O75145 STAM-202ENST00000377524 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
PPFIA3O75145 SLC12A8-207ENST00000469902 2989 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
PPFIA3O75145 CCDC22-201ENST00000376227 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
PPFIA3O75145 SLC7A4-202ENST00000403586 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
PPFIA3O75145 VIPAS39-202ENST00000343765 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
PPFIA3O75145 PAFAH1B1-202ENST00000397195 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
PPFIA3O75145 A1BG-AS1-204ENST00000595302 2130 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
PPFIA3O75145 SLC22A7-202ENST00000372585 2555 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
PPFIA3O75145 HNF4A-202ENST00000316673 1470 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
PPFIA3O75145 QRICH1-202ENST00000395443 3549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
PPFIA3O75145 SEPT8-212ENST00000458488 1726 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
PPFIA3O75145 KANK2-201ENST00000586659 5162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
PPFIA3O75145 PLEKHN1-203ENST00000379410 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
PPFIA3O75145 B4GALT3-213ENST00000622395 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
PPFIA3O75145 FOXD4L5-201ENST00000377420 3109 ntAPPRIS P1 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 138.8 ms