Protein–RNA interactions for Protein: O43924

PDE6D, Retinal rod rhodopsin-sensitive cGMP 3',5'-cyclic phosphodiesterase subunit delta, humanhuman

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Length 150 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE6DO43924 BCAR1-208ENST00000542031 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.71□□□□□ -0.54
PDE6DO43924 ACTL8-202ENST00000617065 1670 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.71□□□□□ -0.54
PDE6DO43924 PIGT-202ENST00000279036 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
PDE6DO43924 TUBGCP3-201ENST00000261965 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
PDE6DO43924 MAMDC4-202ENST00000445819 3895 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.54
PDE6DO43924 AC092053.3-201ENST00000641308 4975 ntBASIC11.71□□□□□ -0.54
PDE6DO43924 ZNF79-202ENST00000543471 2194 ntTSL 2 BASIC11.71□□□□□ -0.54
PDE6DO43924 ZNF79-203ENST00000612342 2192 ntTSL 2 BASIC11.71□□□□□ -0.54
PDE6DO43924 NDUFB2-AS1-201ENST00000465466 1648 ntTSL 2 BASIC11.71□□□□□ -0.54
PDE6DO43924 CDC45-205ENST00000437685 2072 ntTSL 2 BASIC11.71□□□□□ -0.54
PDE6DO43924 TRPV1-206ENST00000571088 4105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
PDE6DO43924 HSD17B4-215ENST00000510025 2589 ntTSL 2 BASIC11.71□□□□□ -0.54
PDE6DO43924 RAVER1-206ENST00000611074 3586 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.54
PDE6DO43924 KIF25-202ENST00000354419 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
PDE6DO43924 LMNA-213ENST00000473598 2015 ntTSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
PDE6DO43924 ZFP64-203ENST00000361387 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
PDE6DO43924 ZNF417-203ENST00000595559 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
PDE6DO43924 MEG3-213ENST00000455531 4867 ntTSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
PDE6DO43924 TGFBR3-204ENST00000465892 2908 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
PDE6DO43924 PLXNA1-201ENST00000393409 9066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
PDE6DO43924 ADD1-204ENST00000398123 2361 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
PDE6DO43924 AC010619.2-201ENST00000595815 1421 ntTSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
PDE6DO43924 COBL-205ENST00000441453 3785 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
PDE6DO43924 HARS-205ENST00000457527 1896 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
PDE6DO43924 AC007663.2-201ENST00000506039 2228 ntTSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
PDE6DO43924 CACNA1G-230ENST00000514717 6699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
PDE6DO43924 FAM3D-201ENST00000358781 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
PDE6DO43924 AXIN2-201ENST00000307078 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
PDE6DO43924 PIH1D1-201ENST00000262265 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
PDE6DO43924 INVS-201ENST00000262456 2968 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
PDE6DO43924 MRPL55-201ENST00000295008 632 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
PDE6DO43924 PRSS27-201ENST00000302641 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
PDE6DO43924 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
PDE6DO43924 ICOSLG-201ENST00000344330 1009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
PDE6DO43924 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
PDE6DO43924 MRPS18A-201ENST00000372116 785 ntTSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
PDE6DO43924 SNHG11-207ENST00000434729 1058 ntTSL 4 BASIC11.7□□□□□ -0.54
PDE6DO43924 HYAL1-206ENST00000447605 666 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
PDE6DO43924 ZNF655-216ENST00000449244 544 ntTSL 4 BASIC11.7□□□□□ -0.54
PDE6DO43924 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
PDE6DO43924 SAPCD2P3-201ENST00000455031 850 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
PDE6DO43924 PFN2-205ENST00000461868 613 ntTSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
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PDE6DO43924 TTLL12-204ENST00000494035 888 ntTSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
PDE6DO43924 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC11.7□□□□□ -0.54
PDE6DO43924 AC069287.3-201ENST00000527297 589 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
PDE6DO43924 BAHD1-203ENST00000561234 4698 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
PDE6DO43924 AC096734.2-201ENST00000562054 433 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
PDE6DO43924 AC133919.2-201ENST00000565965 589 ntTSL 4 BASIC11.7□□□□□ -0.54
PDE6DO43924 NUBP2-214ENST00000568706 913 ntTSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
PDE6DO43924 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
PDE6DO43924 SUCO-202ENST00000367723 5916 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
PDE6DO43924 CKM-201ENST00000221476 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
PDE6DO43924 MAP7-201ENST00000354570 4152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
PDE6DO43924 C15orf41-208ENST00000566621 2866 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
PDE6DO43924 BTRC-202ENST00000370187 6134 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
PDE6DO43924 TCF3-201ENST00000262965 4451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
PDE6DO43924 SELPLG-202ENST00000388962 1613 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
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PDE6DO43924 TBC1D9B-208ENST00000519746 2755 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
PDE6DO43924 SCFD1-203ENST00000458591 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
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PDE6DO43924 FAM153B-220ENST00000515817 1966 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
PDE6DO43924 KRT17P5-203ENST00000445433 2333 ntTSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
PDE6DO43924 FOXO1B-201ENST00000504678 1527 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
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PDE6DO43924 MST1-202ENST00000449682 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
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PDE6DO43924 NEU3-201ENST00000294064 6728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
PDE6DO43924 NFYC-205ENST00000372654 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
PDE6DO43924 ILK-201ENST00000299421 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
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PDE6DO43924 EPHB1-201ENST00000398015 4672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
PDE6DO43924 PRRG2-201ENST00000246794 1404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
PDE6DO43924 PLEKHB2-205ENST00000409279 2488 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
PDE6DO43924 L3MBTL1-206ENST00000427442 3157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
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PDE6DO43924 KCNJ9-201ENST00000368088 4170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
PDE6DO43924 TBC1D8-202ENST00000409318 3803 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
PDE6DO43924 ZDHHC8-203ENST00000405930 3112 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
PDE6DO43924 AC004241.5-201ENST00000623870 2448 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
PDE6DO43924 IRF3-217ENST00000597198 1741 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
PDE6DO43924 PUDP-202ENST00000412827 1376 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
PDE6DO43924 TMX4-201ENST00000246024 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
PDE6DO43924 INTS14-201ENST00000313182 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
PDE6DO43924 AC083964.2-201ENST00000623988 2396 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
PDE6DO43924 ANO10-202ENST00000350459 2039 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
PDE6DO43924 HOXA3-207ENST00000612286 3396 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
PDE6DO43924 TXLNA-201ENST00000373609 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
PDE6DO43924 ALG3-207ENST00000455059 1697 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
PDE6DO43924 SEPT6-201ENST00000343984 2693 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
PDE6DO43924 ZFP36L2-201ENST00000282388 3696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
PDE6DO43924 NTNG1-204ENST00000370067 4628 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
PDE6DO43924 FLNA-201ENST00000344736 7932 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
PDE6DO43924 EML5-207ENST00000554922 9570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
PDE6DO43924 MKNK1-203ENST00000371945 2618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
PDE6DO43924 AP1G2-201ENST00000308724 3298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
PDE6DO43924 LINC01782-201ENST00000591212 2908 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
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