Protein–RNA interactions for Protein: O43189

PHF1, PHD finger protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 567 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHF1O43189 RPS6KC1-202ENST00000366960 5490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
PHF1O43189 ADAM15-204ENST00000359280 2874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
PHF1O43189 MOCS1-205ENST00000373195 2852 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
PHF1O43189 HYAL1-209ENST00000618175 2225 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
PHF1O43189 PAX6-276ENST00000640684 1557 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
PHF1O43189 EEPD1-205ENST00000534978 2769 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
PHF1O43189 SKOR1-201ENST00000341418 3332 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
PHF1O43189 SNX14-202ENST00000346348 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
PHF1O43189 HIST1H2AC-203ENST00000602637 1462 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
PHF1O43189 SEZ6-203ENST00000360295 4306 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
PHF1O43189 GPN2-202ENST00000374135 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
PHF1O43189 CALM3-212ENST00000599839 1355 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
PHF1O43189 FGD5P1-202ENST00000614866 2498 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
PHF1O43189 GPS1-227ENST00000623761 1943 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
PHF1O43189 MON1B-203ENST00000545553 1814 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
PHF1O43189 TM4SF19-201ENST00000273695 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
PHF1O43189 IFNL2-201ENST00000331982 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
PHF1O43189 OR10H1-201ENST00000334920 1124 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
PHF1O43189 OR5C1-201ENST00000373680 963 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
PHF1O43189 IGHV3-16-201ENST00000390604 425 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
PHF1O43189 NME2-201ENST00000393183 568 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
PHF1O43189 SETD4-205ENST00000399208 1165 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
PHF1O43189 AC074338.1-201ENST00000416825 156 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
PHF1O43189 FAM197Y5-201ENST00000423213 765 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
PHF1O43189 HOXB-AS1-201ENST00000435312 806 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
PHF1O43189 GOLGA2P4-201ENST00000441462 777 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
PHF1O43189 AC103563.7-201ENST00000448734 478 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
PHF1O43189 CTBP2P5-201ENST00000454986 1264 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
PHF1O43189 SLC1A4-205ENST00000531327 1217 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
PHF1O43189 AC011499.1-201ENST00000586012 581 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
PHF1O43189 TNNT1-209ENST00000587758 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
PHF1O43189 BTNL10-201ENST00000595971 695 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
PHF1O43189 PDCD6-212ENST00000614778 1050 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
PHF1O43189 RAB18-207ENST00000535776 4811 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
PHF1O43189 AMPD2-218ENST00000528454 2728 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
PHF1O43189 SPATA20-201ENST00000006658 2719 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
PHF1O43189 TCP10-210ENST00000617120 2182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
PHF1O43189 AGPAT3-205ENST00000398063 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
PHF1O43189 AC007191.1-201ENST00000623179 2995 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
PHF1O43189 KDELC2-201ENST00000323468 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
PHF1O43189 MAX-204ENST00000358402 1973 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
PHF1O43189 C21orf33-202ENST00000348499 1506 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
PHF1O43189 TMEM92-201ENST00000300433 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
PHF1O43189 CUX1-215ENST00000556210 4044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
PHF1O43189 C16orf52-202ENST00000542527 4360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
PHF1O43189 LYSMD4-204ENST00000409796 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
PHF1O43189 OXA1L-203ENST00000412791 1440 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
PHF1O43189 STARD8-201ENST00000252336 4862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
PHF1O43189 CRYBG1-204ENST00000633556 9909 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
PHF1O43189 PLXNB3-209ENST00000538966 6377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
PHF1O43189 EIF3K-203ENST00000545173 1327 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
PHF1O43189 LMNA-203ENST00000368297 1679 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
PHF1O43189 NUP93-201ENST00000308159 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
PHF1O43189 IRAK1-203ENST00000369980 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
PHF1O43189 AKAP7-204ENST00000431975 2954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
PHF1O43189 VLDLR-202ENST00000382099 3240 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
PHF1O43189 EIF4G3-204ENST00000374935 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
PHF1O43189 ALOX12B-201ENST00000319144 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
PHF1O43189 ST3GAL3-209ENST00000361400 2195 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
PHF1O43189 JAKMIP1-205ENST00000410077 1835 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
PHF1O43189 BTD-207ENST00000449107 1820 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
PHF1O43189 LSMEM2-201ENST00000316436 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
PHF1O43189 GRK6-203ENST00000393576 2792 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
PHF1O43189 THOC5-203ENST00000397872 2676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
PHF1O43189 HDAC8-209ENST00000373589 1740 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
PHF1O43189 DUOXA1-210ENST00000559014 1965 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
PHF1O43189 AC023024.2-201ENST00000623561 1993 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
PHF1O43189 CASP2-207ENST00000619992 4006 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
PHF1O43189 TICRR-202ENST00000560985 6656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
PHF1O43189 AL158154.2-201ENST00000585776 2208 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
PHF1O43189 SFMBT1-201ENST00000394752 4548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
PHF1O43189 KIRREL1-202ENST00000360089 3304 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
PHF1O43189 SNCAIP-207ENST00000504884 1885 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
PHF1O43189 PHLDA2-201ENST00000314222 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
PHF1O43189 EDN2-201ENST00000372587 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
PHF1O43189 TSPAN32-204ENST00000381121 999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
PHF1O43189 STPG3-201ENST00000388931 1207 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
PHF1O43189 PLD3-204ENST00000409281 2115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
PHF1O43189 AC098850.1-201ENST00000419919 790 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
PHF1O43189 AC007731.4-201ENST00000420225 652 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
PHF1O43189 Z82214.2-201ENST00000420269 531 ntTSL 4 BASIC13.11□□□□□ -0.31
PHF1O43189 KRT18P64-201ENST00000434946 1219 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
PHF1O43189 AC099754.1-201ENST00000435884 454 ntTSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
PHF1O43189 ZMYND10-AS1-201ENST00000440013 250 ntTSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
PHF1O43189 RPL13P2-201ENST00000440687 659 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
PHF1O43189 KLF2P4-201ENST00000451959 1225 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
PHF1O43189 AC093904.3-201ENST00000492300 368 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
PHF1O43189 AC093904.2-201ENST00000495580 418 ntTSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
PHF1O43189 C8orf88-201ENST00000517562 894 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
PHF1O43189 AC109479.1-201ENST00000519603 624 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
PHF1O43189 TROAP-207ENST00000548311 623 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
PHF1O43189 HNRNPUP1-201ENST00000554987 333 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
PHF1O43189 ACYP1-206ENST00000555694 565 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
PHF1O43189 AC009088.3-201ENST00000563605 357 ntTSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
PHF1O43189 LINC01887-202ENST00000584734 860 ntTSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
PHF1O43189 AC010327.1-201ENST00000587871 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
PHF1O43189 AC073082.1-201ENST00000602369 2103 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
PHF1O43189 Z84492.1-201ENST00000606589 408 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
PHF1O43189 WNT11-204ENST00000621122 789 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
PHF1O43189 PCSK6-221ENST00000632686 1210 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.7 ms