Protein–RNA interactions for Protein: O00408

PDE2A, cGMP-dependent 3',5'-cyclic phosphodiesterase, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 941 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE2AO00408 ATRIP-204ENST00000412052 2721 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PDE2AO00408 SLC39A9-209ENST00000556605 2065 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PDE2AO00408 TPM3P9-201ENST00000424846 2920 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PDE2AO00408 GSG1L-203ENST00000447459 4916 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PDE2AO00408 OFD1-204ENST00000398395 3307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PDE2AO00408 VANGL2-201ENST00000368061 5340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PDE2AO00408 PCNX2-201ENST00000258229 7518 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PDE2AO00408 FBLIM1-206ENST00000441801 1543 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PDE2AO00408 RAD51D-218ENST00000590016 1528 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PDE2AO00408 NR1H3-221ENST00000481889 1704 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PDE2AO00408 PLCD1-204ENST00000463876 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PDE2AO00408 OPN5-202ENST00000371211 1801 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PDE2AO00408 AC090505.1-201ENST00000430515 1834 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
PDE2AO00408 YWHAE-208ENST00000571732 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PDE2AO00408 PAM-201ENST00000304400 3156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PDE2AO00408 NR6A1-205ENST00000487099 7031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PDE2AO00408 PITX2-205ENST00000394598 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PDE2AO00408 SMG8-201ENST00000300917 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PDE2AO00408 NATD1-201ENST00000611551 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PDE2AO00408 SLC41A3-204ENST00000383598 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PDE2AO00408 LANCL2-201ENST00000254770 4353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PDE2AO00408 SLC1A7-202ENST00000371494 2637 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PDE2AO00408 NTN4-201ENST00000343702 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PDE2AO00408 EBI3-201ENST00000221847 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PDE2AO00408 C2orf40-201ENST00000238044 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PDE2AO00408 HCST-201ENST00000246551 613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PDE2AO00408 PNKD-201ENST00000248451 758 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PDE2AO00408 TAAR5-201ENST00000258034 1014 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PDE2AO00408 PSMB6-201ENST00000270586 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PDE2AO00408 H1FOO-201ENST00000324382 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PDE2AO00408 CD8B-201ENST00000331469 832 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PDE2AO00408 AC073349.1-201ENST00000340779 1062 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PDE2AO00408 IFT20-202ENST00000357896 974 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PDE2AO00408 ASB12-201ENST00000362002 1289 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PDE2AO00408 FAM19A3-202ENST00000369630 1282 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PDE2AO00408 PKIG-202ENST00000372886 1180 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PDE2AO00408 HDAC8-203ENST00000373559 632 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PDE2AO00408 HDAC8-208ENST00000373583 434 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PDE2AO00408 CIB3-202ENST00000379859 467 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PDE2AO00408 AC236430.1-201ENST00000402231 743 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
PDE2AO00408 AC009477.1-201ENST00000452936 217 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
PDE2AO00408 VCX3B-204ENST00000453306 868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PDE2AO00408 AL627443.1-201ENST00000456477 1035 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PDE2AO00408 RBAKDN-201ENST00000498308 514 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PDE2AO00408 CNOT8-210ENST00000519404 945 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PDE2AO00408 CNOT8-214ENST00000520671 923 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PDE2AO00408 CNOT8-218ENST00000521583 1151 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PDE2AO00408 SPSB2-204ENST00000523102 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PDE2AO00408 SPSB2-205ENST00000524270 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PDE2AO00408 AC138466.1-201ENST00000535242 391 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PDE2AO00408 SAMD11P1-201ENST00000571429 661 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
PDE2AO00408 PRR29-204ENST00000577953 565 ntTSL 4 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PDE2AO00408 AC092070.4-201ENST00000599803 507 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PDE2AO00408 EBAG9-209ENST00000614147 1179 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PDE2AO00408 PSMB6-205ENST00000614486 871 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PDE2AO00408 PCSK6-221ENST00000632686 1210 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PDE2AO00408 CYP2AB1P-202ENST00000454440 1456 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
PDE2AO00408 RHD-202ENST00000342055 1557 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PDE2AO00408 ALDOA-209ENST00000563060 1550 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PDE2AO00408 GFY-202ENST00000610896 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PDE2AO00408 MVK-214ENST00000629016 1591 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PDE2AO00408 GEMIN7-201ENST00000270257 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PDE2AO00408 ATP6AP2-213ENST00000636251 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PDE2AO00408 AGGF1P1-201ENST00000509500 2073 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
PDE2AO00408 CDK20-201ENST00000325303 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PDE2AO00408 ARHGEF1-201ENST00000337665 3171 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PDE2AO00408 POLN-210ENST00000511885 3253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PDE2AO00408 AC022028.2-201ENST00000474115 2619 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PDE2AO00408 PPM1M-201ENST00000296487 2429 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PDE2AO00408 CCND3-201ENST00000372987 2233 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PDE2AO00408 HM13-202ENST00000340852 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PDE2AO00408 LINC00639-201ENST00000553932 4496 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PDE2AO00408 ACY3-201ENST00000255082 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PDE2AO00408 SHROOM4-201ENST00000289292 6261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PDE2AO00408 PDE8A-203ENST00000394553 3912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PDE2AO00408 CALCB-203ENST00000533448 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PDE2AO00408 AC023632.2-201ENST00000523011 1789 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PDE2AO00408 OAS1-202ENST00000445409 1684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PDE2AO00408 STK32B-201ENST00000282908 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PDE2AO00408 RASSF3-204ENST00000542104 3492 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PDE2AO00408 FAN1-207ENST00000565466 2304 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PDE2AO00408 PGC-202ENST00000373025 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PDE2AO00408 ASNA1-204ENST00000591090 1368 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PDE2AO00408 MYO15B-237ENST00000642007 4893 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
PDE2AO00408 RPL18A-201ENST00000222247 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PDE2AO00408 MUC1-201ENST00000337604 859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PDE2AO00408 PSMB9-207ENST00000374859 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PDE2AO00408 PSMB9-208ENST00000395330 792 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PDE2AO00408 DSCR3-204ENST00000399001 821 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PDE2AO00408 UGT1A2P-201ENST00000454886 866 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
PDE2AO00408 UBE2H-204ENST00000473814 535 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PDE2AO00408 RPL10P19-202ENST00000520582 722 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PDE2AO00408 MRNIP-220ENST00000523084 1096 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PDE2AO00408 AC190387.1-201ENST00000551683 408 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
PDE2AO00408 HDDC2-203ENST00000608284 538 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PDE2AO00408 SFT2D2-204ENST00000630869 1073 ntTSL 4 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PDE2AO00408 HIST1H3D-202ENST00000635200 948 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PDE2AO00408 AL033527.5-202ENST00000641632 1098 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
PDE2AO00408 NLGN4X-203ENST00000381093 5865 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PDE2AO00408 LRIG3-201ENST00000320743 4070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 76.4 ms