Protein–RNA interactions for Protein: O00124

UBXN8, UBX domain-containing protein 8, humanhuman

Predictions only

Length 270 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBXN8O00124 ZNF7-203ENST00000525266 1874 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
UBXN8O00124 PHTF1-202ENST00000369598 3000 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
UBXN8O00124 RGR-201ENST00000358110 1349 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
UBXN8O00124 IL6R-201ENST00000344086 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
UBXN8O00124 CLCNKA-201ENST00000331433 2475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
UBXN8O00124 ECHDC2-203ENST00000371522 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
UBXN8O00124 PIANP-202ENST00000534837 2695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
UBXN8O00124 GINS3-203ENST00000426538 1728 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
UBXN8O00124 TLL1-201ENST00000061240 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
UBXN8O00124 KCTD10-208ENST00000540089 3096 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
UBXN8O00124 ABHD16A-202ENST00000440843 1906 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
UBXN8O00124 UBAP1-202ENST00000359544 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
UBXN8O00124 SP140L-204ENST00000444636 1781 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
UBXN8O00124 CSGALNACT1-211ENST00000522854 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
UBXN8O00124 CDH23-202ENST00000299366 3954 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
UBXN8O00124 AFF3-202ENST00000409236 9849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
UBXN8O00124 GPAT3-201ENST00000264409 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
UBXN8O00124 SRPX-206ENST00000544439 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
UBXN8O00124 PLEKHA4-201ENST00000263265 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
UBXN8O00124 ZNF785-202ENST00000470110 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
UBXN8O00124 SBF1-202ENST00000380817 8008 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
UBXN8O00124 DCUN1D3-201ENST00000324344 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
UBXN8O00124 CNPY1-203ENST00000636372 2259 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
UBXN8O00124 AL365205.1-204ENST00000359201 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
UBXN8O00124 HIST2H3D-201ENST00000331491 411 ntAPPRIS P1 BASIC14.85□□□□□ -0.03
UBXN8O00124 CXorf40A-201ENST00000359293 974 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
UBXN8O00124 ZDHHC12-201ENST00000372663 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
UBXN8O00124 MFAP2-201ENST00000375534 970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
UBXN8O00124 TMEM26-AS1-201ENST00000389640 863 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
UBXN8O00124 HIST2H3PS2-201ENST00000392948 411 ntAPPRIS P1 BASIC14.85□□□□□ -0.03
UBXN8O00124 AP1S3-204ENST00000409375 552 ntTSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
UBXN8O00124 CGB8-201ENST00000448456 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
UBXN8O00124 AL033519.3-201ENST00000450618 595 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
UBXN8O00124 AC019103.1-201ENST00000503095 272 ntTSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
UBXN8O00124 LINC01605-204ENST00000522718 1093 ntTSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
UBXN8O00124 LIM2-202ENST00000596399 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
UBXN8O00124 LINC01515-215ENST00000608678 854 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
UBXN8O00124 AC006538.3-201ENST00000612495 578 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
UBXN8O00124 MIR8072-201ENST00000614241 80 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
UBXN8O00124 NDUFS7-218ENST00000618074 688 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
UBXN8O00124 NDUFS7-219ENST00000620479 754 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
UBXN8O00124 PRF1-203ENST00000638674 1080 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
UBXN8O00124 APCDD1L-201ENST00000371149 3426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
UBXN8O00124 SPRY4-202ENST00000434127 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
UBXN8O00124 RNF182-208ENST00000544682 3495 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.85□□□□□ -0.03
UBXN8O00124 IL12A-201ENST00000305579 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
UBXN8O00124 RAPH1-202ENST00000319170 9808 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
UBXN8O00124 LRRC20-204ENST00000373224 3095 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
UBXN8O00124 LGALS8-203ENST00000341872 2437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
UBXN8O00124 ACY3-201ENST00000255082 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
UBXN8O00124 RSPRY1-202ENST00000537866 3586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
UBXN8O00124 RAB11FIP1-201ENST00000287263 6253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
UBXN8O00124 NDOR1-202ENST00000371521 2497 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
UBXN8O00124 PSMD13-215ENST00000621534 1572 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
UBXN8O00124 C17orf107-201ENST00000381365 3199 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
UBXN8O00124 UBQLN1-202ENST00000376395 4118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
UBXN8O00124 AC018665.1-201ENST00000622927 1362 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
UBXN8O00124 SOX7-201ENST00000304501 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
UBXN8O00124 SAFB-201ENST00000292123 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
UBXN8O00124 NEK2-201ENST00000366998 1865 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
UBXN8O00124 KAT5-216ENST00000534650 1875 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
UBXN8O00124 ZNF354B-201ENST00000322434 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
UBXN8O00124 KCNC1-201ENST00000265969 4295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
UBXN8O00124 UNC5A-201ENST00000329542 3812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
UBXN8O00124 SNUPN-206ENST00000564675 1682 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
UBXN8O00124 TDRKH-204ENST00000368825 2651 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
UBXN8O00124 ELK4-202ENST00000357992 10239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
UBXN8O00124 ADRB2-201ENST00000305988 3443 ntAPPRIS P1 BASIC14.84□□□□□ -0.03
UBXN8O00124 FBP1-203ENST00000415431 1487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
UBXN8O00124 SELENON-203ENST00000374315 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
UBXN8O00124 KIF22-208ENST00000569382 2020 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
UBXN8O00124 KRT32-201ENST00000225899 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
UBXN8O00124 LTA-214ENST00000454783 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
UBXN8O00124 RDM1-224ENST00000619262 1535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
UBXN8O00124 KCNMA1-262ENST00000639489 4302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
UBXN8O00124 C10orf62-201ENST00000370640 1208 ntAPPRIS P1 BASIC14.84□□□□□ -0.03
UBXN8O00124 DBNDD2-208ENST00000372723 1118 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
UBXN8O00124 MPV17-203ENST00000380044 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
UBXN8O00124 PIR-201ENST00000380420 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
UBXN8O00124 AL645937.2-201ENST00000396808 931 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
UBXN8O00124 OSM-203ENST00000403463 464 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
UBXN8O00124 MPV17-208ENST00000405076 603 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
UBXN8O00124 LINC00659-201ENST00000412500 540 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
UBXN8O00124 AL022068.1-202ENST00000432171 794 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
UBXN8O00124 PRSS48-202ENST00000455694 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
UBXN8O00124 AC004522.2-201ENST00000456499 680 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
UBXN8O00124 IL32-215ENST00000529550 772 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
UBXN8O00124 RFPL4AP1-201ENST00000530883 850 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
UBXN8O00124 PIMREG-202ENST00000570337 891 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
UBXN8O00124 PIMREG-203ENST00000571373 1002 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
UBXN8O00124 GABARAP-205ENST00000573928 476 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
UBXN8O00124 BRI3BPP1-201ENST00000594224 787 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
UBXN8O00124 AC005785.1-202ENST00000597164 237 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
UBXN8O00124 AC092070.4-201ENST00000599803 507 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
UBXN8O00124 PDCD6-212ENST00000614778 1050 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
UBXN8O00124 ORC5-208ENST00000626700 344 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
UBXN8O00124 NMNAT3-201ENST00000296202 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
UBXN8O00124 SNAP91-213ENST00000521485 4521 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
UBXN8O00124 RNF123-202ENST00000432042 2670 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
UBXN8O00124 GOLGA6L2-201ENST00000312015 1379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.6 ms