Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y4K3

TRAF6, TNF receptor-associated factor 6, humanhuman

Predictions only

Length 522 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF6Q9Y4K3 PIGG-202ENST00000383028 2787 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
TRAF6Q9Y4K3 DRC3-203ENST00000399187 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
TRAF6Q9Y4K3 ARHGEF3-212ENST00000495373 2024 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
TRAF6Q9Y4K3 ATP13A2-202ENST00000341676 3681 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
TRAF6Q9Y4K3 BAIAP3-202ENST00000397488 4583 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
TRAF6Q9Y4K3 EXTL1-201ENST00000374280 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
TRAF6Q9Y4K3 AL353803.2-201ENST00000436510 1846 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
TRAF6Q9Y4K3 MRPL58-201ENST00000301585 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
TRAF6Q9Y4K3 MRPL55-208ENST00000366734 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
TRAF6Q9Y4K3 MRPL55-217ENST00000366746 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
TRAF6Q9Y4K3 AGER-204ENST00000375067 1250 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
TRAF6Q9Y4K3 LENEP-202ENST00000392487 555 ntAPPRIS P1 BASIC14.72□□□□□ -0.05
TRAF6Q9Y4K3 BAD-202ENST00000394531 631 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
TRAF6Q9Y4K3 PSMB8-203ENST00000395339 1025 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
TRAF6Q9Y4K3 TSEN15P1-201ENST00000423257 515 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
TRAF6Q9Y4K3 AC114501.2-201ENST00000439631 535 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
TRAF6Q9Y4K3 PIGZ-204ENST00000443835 675 ntTSL 4 BASIC14.72□□□□□ -0.05
TRAF6Q9Y4K3 ZNF789-211ENST00000493485 556 ntTSL 4 BASIC14.72□□□□□ -0.05
TRAF6Q9Y4K3 MEIS3P1-201ENST00000495167 958 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
TRAF6Q9Y4K3 SWI5-205ENST00000495313 466 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
TRAF6Q9Y4K3 AC091053.1-201ENST00000529883 744 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
TRAF6Q9Y4K3 CYB561D1-209ENST00000533024 913 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
TRAF6Q9Y4K3 BAD-207ENST00000544785 525 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
TRAF6Q9Y4K3 YEATS4-202ENST00000548020 1100 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
TRAF6Q9Y4K3 AC140878.1-201ENST00000565277 250 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
TRAF6Q9Y4K3 LYRM1-209ENST00000568663 857 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.72□□□□□ -0.05
TRAF6Q9Y4K3 AC116003.1-201ENST00000578340 536 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
TRAF6Q9Y4K3 AC016168.1-201ENST00000591422 722 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
TRAF6Q9Y4K3 DKKL1-202ENST00000594268 524 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
TRAF6Q9Y4K3 AC010619.1-201ENST00000599536 675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
TRAF6Q9Y4K3 AC243829.4-204ENST00000616926 1115 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
TRAF6Q9Y4K3 CDKL3-206ENST00000521118 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
TRAF6Q9Y4K3 TAGLN2-202ENST00000368096 1603 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
TRAF6Q9Y4K3 AL158070.2-201ENST00000623713 1621 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
TRAF6Q9Y4K3 FES-202ENST00000394300 2302 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
TRAF6Q9Y4K3 ZFP36L1-201ENST00000336440 3026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
TRAF6Q9Y4K3 KCNT1-209ENST00000490355 3708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
TRAF6Q9Y4K3 SLC6A20-202ENST00000358525 5423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
TRAF6Q9Y4K3 EXD3-203ENST00000465160 1585 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
TRAF6Q9Y4K3 SYMPK-213ENST00000599460 5449 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
TRAF6Q9Y4K3 GOLGA2-212ENST00000609374 2973 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
TRAF6Q9Y4K3 AC092506.1-201ENST00000634580 2275 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
TRAF6Q9Y4K3 LINC00910-206ENST00000592135 2438 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
TRAF6Q9Y4K3 GABRA1-201ENST00000023897 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
TRAF6Q9Y4K3 SLC35E2-202ENST00000355439 2078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
TRAF6Q9Y4K3 BTNL8-206ENST00000508408 1717 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
TRAF6Q9Y4K3 SMARCA4-214ENST00000589677 5181 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
TRAF6Q9Y4K3 SCUBE1-202ENST00000360835 9808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
TRAF6Q9Y4K3 RBM47-203ENST00000381795 4473 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
TRAF6Q9Y4K3 GRM7-203ENST00000389336 2901 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
TRAF6Q9Y4K3 HAND2-AS1-202ENST00000502896 5278 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
TRAF6Q9Y4K3 TM6SF2-201ENST00000389363 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
TRAF6Q9Y4K3 ZC2HC1C-202ENST00000439583 1509 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
TRAF6Q9Y4K3 BLCAP-205ENST00000397137 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
TRAF6Q9Y4K3 PPP1CB-203ENST00000395366 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
TRAF6Q9Y4K3 HNRNPU-226ENST00000640218 6858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
TRAF6Q9Y4K3 FBXL4-201ENST00000229971 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
TRAF6Q9Y4K3 TMEM170A-207ENST00000569540 2331 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
TRAF6Q9Y4K3 A1BG-AS1-204ENST00000595302 2130 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
TRAF6Q9Y4K3 AL359183.1-201ENST00000623796 2132 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
TRAF6Q9Y4K3 ZNF596-201ENST00000308811 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
TRAF6Q9Y4K3 DYDC2-204ENST00000372199 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
TRAF6Q9Y4K3 ATG5-201ENST00000343245 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
TRAF6Q9Y4K3 NR3C1-203ENST00000394464 6795 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
TRAF6Q9Y4K3 ARHGAP23P1-201ENST00000562773 1937 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
TRAF6Q9Y4K3 HNRNPUL1-205ENST00000593587 2725 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
TRAF6Q9Y4K3 SEZ6-203ENST00000360295 4306 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
TRAF6Q9Y4K3 MEGF11-204ENST00000422354 5914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
TRAF6Q9Y4K3 ZSWIM8-221ENST00000604729 6075 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
TRAF6Q9Y4K3 MBD4-204ENST00000503197 2099 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
TRAF6Q9Y4K3 GSTCD-206ENST00000507281 2091 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
TRAF6Q9Y4K3 H2AFZ-201ENST00000296417 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
TRAF6Q9Y4K3 FCRLB-204ENST00000367946 1152 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
TRAF6Q9Y4K3 PDGFB-202ENST00000381551 1125 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
TRAF6Q9Y4K3 MRPS12-203ENST00000407800 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
TRAF6Q9Y4K3 AC107890.1-201ENST00000422478 521 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
TRAF6Q9Y4K3 AC092580.3-201ENST00000430932 139 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
TRAF6Q9Y4K3 LINC02558-202ENST00000436395 298 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
TRAF6Q9Y4K3 AC006001.2-201ENST00000448096 393 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
TRAF6Q9Y4K3 OST4-203ENST00000456793 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
TRAF6Q9Y4K3 AC063976.1-201ENST00000457890 381 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
TRAF6Q9Y4K3 ST7-OT4-203ENST00000466018 894 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
TRAF6Q9Y4K3 AC022447.6-201ENST00000515522 438 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
TRAF6Q9Y4K3 IL32-211ENST00000525643 1272 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
TRAF6Q9Y4K3 IL32-213ENST00000528163 950 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
TRAF6Q9Y4K3 AC007569.1-201ENST00000550306 600 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
TRAF6Q9Y4K3 TMEM263-206ENST00000550344 925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
TRAF6Q9Y4K3 IL32-231ENST00000551513 791 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
TRAF6Q9Y4K3 AC027088.1-201ENST00000557966 1117 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
TRAF6Q9Y4K3 UBE2Q2L-201ENST00000558195 498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
TRAF6Q9Y4K3 AC025678.2-201ENST00000562061 970 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
TRAF6Q9Y4K3 MLXIPL-205ENST00000429400 3173 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
TRAF6Q9Y4K3 RPUSD2-201ENST00000315616 2358 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
TRAF6Q9Y4K3 ADI1-201ENST00000327435 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
TRAF6Q9Y4K3 GAK-201ENST00000314167 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
TRAF6Q9Y4K3 ALDOA-209ENST00000563060 1550 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
TRAF6Q9Y4K3 AC007920.1-201ENST00000356133 2674 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
TRAF6Q9Y4K3 ZBTB7B-207ENST00000535420 3777 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
TRAF6Q9Y4K3 MPZL1-203ENST00000392121 3421 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
TRAF6Q9Y4K3 SDR42E2-201ENST00000602312 2630 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.5 ms