Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3B3

TMED7, Transmembrane emp24 domain-containing protein 7, humanhuman

Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMED7Q9Y3B3 HOPX-210ENST00000553379 1001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
TMED7Q9Y3B3 HOPX-212ENST00000555760 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.21
TMED7Q9Y3B3 HOPX-213ENST00000556376 1064 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.21
TMED7Q9Y3B3 MIR3197-201ENST00000582241 73 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
TMED7Q9Y3B3 RBP1-207ENST00000619087 516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
TMED7Q9Y3B3 AL603764.1-201ENST00000636452 321 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
TMED7Q9Y3B3 TP53INP2-201ENST00000374809 4018 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
TMED7Q9Y3B3 CGN-201ENST00000271636 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
TMED7Q9Y3B3 NTMT1-204ENST00000372486 1487 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
TMED7Q9Y3B3 OSBPL5-210ENST00000525498 2733 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
TMED7Q9Y3B3 SPATA20-201ENST00000006658 2719 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
TMED7Q9Y3B3 ATP2A3-204ENST00000397035 4182 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
TMED7Q9Y3B3 CPSF7-205ENST00000439958 3524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
TMED7Q9Y3B3 HEY1-202ENST00000354724 2293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
TMED7Q9Y3B3 EFHC1-212ENST00000635984 3293 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
TMED7Q9Y3B3 ENDOD1-201ENST00000278505 4687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
TMED7Q9Y3B3 NR1H3-211ENST00000441012 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
TMED7Q9Y3B3 GLUL-202ENST00000331872 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
TMED7Q9Y3B3 PATZ1-202ENST00000266269 3781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
TMED7Q9Y3B3 CYB5R3-205ENST00000407623 2153 ntTSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.22
TMED7Q9Y3B3 USP37-202ENST00000338465 1771 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
TMED7Q9Y3B3 DNAJC7-202ENST00000426588 1774 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.22
TMED7Q9Y3B3 PSMD13-215ENST00000621534 1572 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
TMED7Q9Y3B3 LY9-204ENST00000368039 1364 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
TMED7Q9Y3B3 ENOSF1-209ENST00000580982 1397 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
TMED7Q9Y3B3 PRMT9-201ENST00000322396 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
TMED7Q9Y3B3 MAP3K4-201ENST00000348824 5295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
TMED7Q9Y3B3 RSPO1-204ENST00000615459 2331 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
TMED7Q9Y3B3 CHL1-202ENST00000397491 5235 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
TMED7Q9Y3B3 LDLRAD4-205ENST00000585931 2118 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
TMED7Q9Y3B3 AC023090.2-201ENST00000625182 2110 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
TMED7Q9Y3B3 SEZ6L-209ENST00000529632 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
TMED7Q9Y3B3 ADAM15-204ENST00000359280 2874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
TMED7Q9Y3B3 TSPAN11-201ENST00000261177 5505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
TMED7Q9Y3B3 IRF8-201ENST00000268638 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
TMED7Q9Y3B3 FKBP5-201ENST00000357266 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
TMED7Q9Y3B3 HENMT1-202ENST00000370032 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
TMED7Q9Y3B3 RTN4IP1-201ENST00000369063 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
TMED7Q9Y3B3 SORCS2-201ENST00000329016 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
TMED7Q9Y3B3 CHD4-201ENST00000357008 6496 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
TMED7Q9Y3B3 EGOT-201ENST00000414938 1464 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
TMED7Q9Y3B3 AL390755.1-201ENST00000623716 2027 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
TMED7Q9Y3B3 PDZD4-201ENST00000164640 3689 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
TMED7Q9Y3B3 KCNMA1-202ENST00000286628 6233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
TMED7Q9Y3B3 SCGN-201ENST00000334979 704 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
TMED7Q9Y3B3 MGST3-203ENST00000367885 680 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
TMED7Q9Y3B3 NDUFC1-203ENST00000394228 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
TMED7Q9Y3B3 SNCA-205ENST00000394991 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
TMED7Q9Y3B3 SZT2-AS1-201ENST00000396885 699 ntTSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
TMED7Q9Y3B3 CRYAA-202ENST00000398132 826 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
TMED7Q9Y3B3 KRTAP10-1-201ENST00000400375 1215 ntAPPRIS P1 BASIC13.7□□□□□ -0.22
TMED7Q9Y3B3 ACTG1P3-201ENST00000431775 1114 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
TMED7Q9Y3B3 TMEM247-204ENST00000434431 680 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
TMED7Q9Y3B3 EIF3FP3-201ENST00000434851 1086 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
TMED7Q9Y3B3 AL606760.2-202ENST00000452466 524 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
TMED7Q9Y3B3 RAD51D-205ENST00000460118 1064 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
TMED7Q9Y3B3 C3orf14-202ENST00000462069 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
TMED7Q9Y3B3 LHX6-205ENST00000464484 666 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
TMED7Q9Y3B3 GIMAP3P-201ENST00000495150 836 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
TMED7Q9Y3B3 AC011495.1-201ENST00000498085 584 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
TMED7Q9Y3B3 LCN10-206ENST00000527229 615 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
TMED7Q9Y3B3 NEU3-203ENST00000529024 581 ntTSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
TMED7Q9Y3B3 TDH-203ENST00000531764 1110 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
TMED7Q9Y3B3 PTP4A1P2-201ENST00000546033 454 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
TMED7Q9Y3B3 ZNF710-AS1-201ENST00000558334 1168 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
TMED7Q9Y3B3 AC010319.3-201ENST00000597028 470 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
TMED7Q9Y3B3 AL157392.3-207ENST00000601758 744 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
TMED7Q9Y3B3 IFI27-210ENST00000616764 716 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
TMED7Q9Y3B3 FP236240.1-204ENST00000624932 712 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
TMED7Q9Y3B3 AC018529.2-202ENST00000611482 3087 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
TMED7Q9Y3B3 PTPN20-206ENST00000395722 1995 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
TMED7Q9Y3B3 MEGF11-204ENST00000422354 5914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
TMED7Q9Y3B3 AC011455.3-201ENST00000599996 1967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
TMED7Q9Y3B3 COL25A1-201ENST00000399126 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
TMED7Q9Y3B3 SLCO6A1-205ENST00000506729 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
TMED7Q9Y3B3 NDC1-201ENST00000371429 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
TMED7Q9Y3B3 FAM219A-204ENST00000379081 3543 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
TMED7Q9Y3B3 ACHE-202ENST00000302913 2956 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
TMED7Q9Y3B3 PCDHA9-202ENST00000532602 6293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
TMED7Q9Y3B3 MICAL1-201ENST00000358577 3142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
TMED7Q9Y3B3 WDR25-204ENST00000554175 2055 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
TMED7Q9Y3B3 GTF2IRD1-205ENST00000476977 5868 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
TMED7Q9Y3B3 HCK-209ENST00000538448 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
TMED7Q9Y3B3 PVR-203ENST00000403059 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
TMED7Q9Y3B3 PCED1B-201ENST00000432328 1862 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
TMED7Q9Y3B3 STAT1-203ENST00000392323 2723 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
TMED7Q9Y3B3 ARHGAP27P1-BPTFP1-KPNA2P3-201ENST00000578492 2732 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
TMED7Q9Y3B3 C4A-259ENST00000498271 5269 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
TMED7Q9Y3B3 GPD1L-201ENST00000282541 4060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
TMED7Q9Y3B3 CCDC140-201ENST00000295226 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
TMED7Q9Y3B3 OTUD6A-201ENST00000338352 1689 ntAPPRIS P1 BASIC13.69□□□□□ -0.22
TMED7Q9Y3B3 KIAA1191-201ENST00000298569 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
TMED7Q9Y3B3 PHLDA1-201ENST00000266671 8069 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
TMED7Q9Y3B3 MAGED2-201ENST00000218439 1958 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
TMED7Q9Y3B3 GPER1-201ENST00000297469 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
TMED7Q9Y3B3 ITPKB-201ENST00000272117 5822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
TMED7Q9Y3B3 SLC32A1-201ENST00000217420 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
TMED7Q9Y3B3 SLC22A7-202ENST00000372585 2555 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
TMED7Q9Y3B3 PAF1-201ENST00000221265 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
TMED7Q9Y3B3 RAB41-201ENST00000276066 1071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 84.9 ms