Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPZ3

HPS5, Hermansky-Pudlak syndrome 5 protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,129 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HPS5Q9UPZ3 PITPNM1-201ENST00000356404 4225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
HPS5Q9UPZ3 KCNH3-201ENST00000257981 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
HPS5Q9UPZ3 BRCC3-201ENST00000330045 2496 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
HPS5Q9UPZ3 VTN-201ENST00000226218 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
HPS5Q9UPZ3 TPPP-201ENST00000360578 6022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
HPS5Q9UPZ3 RNFT2-203ENST00000392549 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
HPS5Q9UPZ3 TEN1-CDK3-202ENST00000569284 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
HPS5Q9UPZ3 AC058822.1-201ENST00000507166 2550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
HPS5Q9UPZ3 NFYC-205ENST00000372654 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
HPS5Q9UPZ3 DNAH14-204ENST00000366849 2215 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
HPS5Q9UPZ3 RCOR2-201ENST00000301459 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
HPS5Q9UPZ3 EPN2-201ENST00000314728 4871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
HPS5Q9UPZ3 ATF7-205ENST00000548446 1892 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
HPS5Q9UPZ3 DLGAP2-215ENST00000637795 3380 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
HPS5Q9UPZ3 HTR7-201ENST00000277874 3028 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
HPS5Q9UPZ3 ZNF586-201ENST00000391702 2265 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
HPS5Q9UPZ3 AC013726.1-201ENST00000563747 2285 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
HPS5Q9UPZ3 TEX28-203ENST00000617225 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
HPS5Q9UPZ3 GSN-203ENST00000373808 2664 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
HPS5Q9UPZ3 ASIC4-202ENST00000358078 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
HPS5Q9UPZ3 ANKRD44-203ENST00000409153 2724 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
HPS5Q9UPZ3 FGD5P1-202ENST00000614866 2498 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
HPS5Q9UPZ3 MEGF9-201ENST00000373930 6298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
HPS5Q9UPZ3 RNASE4-203ENST00000555835 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
HPS5Q9UPZ3 AHNAK-201ENST00000257247 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
HPS5Q9UPZ3 SERF2-206ENST00000409291 807 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
HPS5Q9UPZ3 AC007274.2-201ENST00000421675 662 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
HPS5Q9UPZ3 AC010745.3-201ENST00000439745 415 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
HPS5Q9UPZ3 MSRA-203ENST00000441698 788 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
HPS5Q9UPZ3 AL596276.2-201ENST00000447525 331 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
HPS5Q9UPZ3 MRPL48-210ENST00000542303 661 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
HPS5Q9UPZ3 PSORS1C1-206ENST00000547221 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
HPS5Q9UPZ3 RN7SL774P-201ENST00000577467 290 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
HPS5Q9UPZ3 INO80C-210ENST00000590757 595 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
HPS5Q9UPZ3 AC132938.4-201ENST00000623835 848 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
HPS5Q9UPZ3 MEF2C-227ENST00000626391 1182 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
HPS5Q9UPZ3 MEF2C-231ENST00000628656 1254 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
HPS5Q9UPZ3 AC006453.4-201ENST00000636949 1252 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
HPS5Q9UPZ3 TGFB1I1-201ENST00000361773 1773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
HPS5Q9UPZ3 LINC00884-202ENST00000448892 2680 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
HPS5Q9UPZ3 CERS6-201ENST00000305747 7217 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
HPS5Q9UPZ3 PCDHB8-201ENST00000239444 2740 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
HPS5Q9UPZ3 HNRNPA1-202ENST00000340913 1842 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
HPS5Q9UPZ3 GDF6-201ENST00000287020 3701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
HPS5Q9UPZ3 TMEM65-201ENST00000297632 9029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
HPS5Q9UPZ3 DCUN1D4-203ENST00000451288 4269 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
HPS5Q9UPZ3 PLD3-201ENST00000356508 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
HPS5Q9UPZ3 KLK6-203ENST00000391808 1478 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
HPS5Q9UPZ3 SLC7A5-201ENST00000261622 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
HPS5Q9UPZ3 REPS1-208ENST00000450536 4537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
HPS5Q9UPZ3 ALAS2-201ENST00000330807 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
HPS5Q9UPZ3 ILF3-203ENST00000449870 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
HPS5Q9UPZ3 ANTXR1-201ENST00000303714 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
HPS5Q9UPZ3 TDRKH-204ENST00000368825 2651 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
HPS5Q9UPZ3 STAT5A-201ENST00000345506 4301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
HPS5Q9UPZ3 GABARAP-201ENST00000302386 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
HPS5Q9UPZ3 KCNG4-202ENST00000568181 2199 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
HPS5Q9UPZ3 ARHGEF28-214ENST00000545377 6351 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
HPS5Q9UPZ3 C6orf106-203ENST00000374026 4232 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
HPS5Q9UPZ3 CAPZB-201ENST00000264202 858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
HPS5Q9UPZ3 CGB5-201ENST00000301408 841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
HPS5Q9UPZ3 IGLV4-69-201ENST00000390282 419 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
HPS5Q9UPZ3 AL627389.1-201ENST00000413508 1182 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
HPS5Q9UPZ3 DHDDS-206ENST00000427245 868 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
HPS5Q9UPZ3 AC018680.1-202ENST00000500324 525 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
HPS5Q9UPZ3 GDNF-AS1-201ENST00000503382 604 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
HPS5Q9UPZ3 NUP210P1-202ENST00000504322 710 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
HPS5Q9UPZ3 GUSBP1-202ENST00000508260 1012 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
HPS5Q9UPZ3 RNA5SP486-201ENST00000515961 83 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
HPS5Q9UPZ3 AC090735.1-201ENST00000523881 488 ntTSL 4 BASIC17.87■□□□□ 0.45
HPS5Q9UPZ3 RBM4B-202ENST00000524637 867 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
HPS5Q9UPZ3 AC073352.2-201ENST00000609385 439 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
HPS5Q9UPZ3 AC007663.3-201ENST00000609632 465 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
HPS5Q9UPZ3 AC145423.3-201ENST00000615987 467 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
HPS5Q9UPZ3 AC091544.8-201ENST00000619490 361 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
HPS5Q9UPZ3 WNK1-206ENST00000535572 9886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
HPS5Q9UPZ3 TUBBP5-203ENST00000508529 1334 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
HPS5Q9UPZ3 ZNF581-203ENST00000587252 1324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
HPS5Q9UPZ3 GLUL-201ENST00000311223 4719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
HPS5Q9UPZ3 SEC13-201ENST00000337354 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
HPS5Q9UPZ3 LILRP1-201ENST00000444199 1370 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
HPS5Q9UPZ3 MBD4-204ENST00000503197 2099 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
HPS5Q9UPZ3 DHX36-201ENST00000308361 3487 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
HPS5Q9UPZ3 GPRIN1-201ENST00000303991 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
HPS5Q9UPZ3 ARIH2-205ENST00000449376 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
HPS5Q9UPZ3 SPATA33-210ENST00000611218 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
HPS5Q9UPZ3 FUCA2-201ENST00000002165 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
HPS5Q9UPZ3 SCAMP4-202ENST00000409472 2394 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
HPS5Q9UPZ3 FANCA-213ENST00000563673 1694 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
HPS5Q9UPZ3 SEPT8-212ENST00000458488 1726 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
HPS5Q9UPZ3 RAB11FIP5-205ENST00000486777 6120 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
HPS5Q9UPZ3 MBD1-217ENST00000588937 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
HPS5Q9UPZ3 COX10-201ENST00000261643 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
HPS5Q9UPZ3 PIDD1-202ENST00000411829 2886 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
HPS5Q9UPZ3 CNN3-207ENST00000545882 1902 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
HPS5Q9UPZ3 STAT5A-211ENST00000590949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
HPS5Q9UPZ3 COL27A1-201ENST00000356083 7790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
HPS5Q9UPZ3 LRP8-202ENST00000347547 2382 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
HPS5Q9UPZ3 AL157392.1-201ENST00000412388 373 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
HPS5Q9UPZ3 AL008707.1-201ENST00000422498 534 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.7 ms