Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULW0

TPX2, Targeting protein for Xklp2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 747 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TPX2Q9ULW0 POLE2-203ENST00000553805 496 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TPX2Q9ULW0 AC133919.2-202ENST00000563515 416 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TPX2Q9ULW0 AC126696.2-201ENST00000563687 522 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TPX2Q9ULW0 AC007216.4-201ENST00000574364 562 ntTSL 4 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TPX2Q9ULW0 LINC00237-203ENST00000593272 630 ntTSL 4 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TPX2Q9ULW0 AC007431.3-201ENST00000623221 587 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
TPX2Q9ULW0 AL031056.2-201ENST00000637957 1217 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TPX2Q9ULW0 PRF1-203ENST00000638674 1080 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TPX2Q9ULW0 TMPRSS9-201ENST00000332578 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TPX2Q9ULW0 DDR1-271ENST00000513240 2882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TPX2Q9ULW0 AKTIP-202ENST00000394657 2426 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TPX2Q9ULW0 TP73-205ENST00000378285 2117 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TPX2Q9ULW0 HTR3E-202ENST00000415389 2139 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TPX2Q9ULW0 ACE3P-201ENST00000423435 1973 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
TPX2Q9ULW0 NUTM2E-201ENST00000429984 3292 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TPX2Q9ULW0 CPEB3-201ENST00000265997 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TPX2Q9ULW0 UVRAG-201ENST00000356136 4123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TPX2Q9ULW0 SLC52A3-205ENST00000632431 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TPX2Q9ULW0 PRMT7-202ENST00000441236 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TPX2Q9ULW0 AMIGO2-201ENST00000266581 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TPX2Q9ULW0 UBAC2-AS1-201ENST00000426037 1771 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TPX2Q9ULW0 NUP98-203ENST00000359171 7023 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TPX2Q9ULW0 C22orf34-204ENST00000414287 2197 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TPX2Q9ULW0 ALAS2-201ENST00000330807 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TPX2Q9ULW0 ATP6V1H-202ENST00000359530 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TPX2Q9ULW0 GREB1-205ENST00000389825 1315 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TPX2Q9ULW0 NUTM2A-202ENST00000381707 3290 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TPX2Q9ULW0 NUTM2B-203ENST00000429828 3292 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TPX2Q9ULW0 MLLT6-211ENST00000621332 7578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TPX2Q9ULW0 MEGF11-203ENST00000409699 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TPX2Q9ULW0 STMN1-203ENST00000399728 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TPX2Q9ULW0 SUPT20H-212ENST00000475892 2836 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TPX2Q9ULW0 AC104407.1-201ENST00000511017 1568 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TPX2Q9ULW0 STAC3-206ENST00000554578 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TPX2Q9ULW0 CMPK1-203ENST00000371873 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TPX2Q9ULW0 AGAP4-208ENST00000618171 2387 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TPX2Q9ULW0 B4GALNT3-201ENST00000266383 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TPX2Q9ULW0 MRPS17-201ENST00000285298 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TPX2Q9ULW0 PLXNC1-202ENST00000545312 1813 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TPX2Q9ULW0 PML-208ENST00000436891 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TPX2Q9ULW0 CD164L2-203ENST00000374030 993 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TPX2Q9ULW0 DGCR5-201ENST00000399539 862 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
TPX2Q9ULW0 TMEM247-204ENST00000434431 680 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TPX2Q9ULW0 ZMYND10-AS1-201ENST00000440013 250 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TPX2Q9ULW0 TARDBPP1-201ENST00000442013 1203 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
TPX2Q9ULW0 AJ271736.1-201ENST00000483543 773 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TPX2Q9ULW0 AC104596.2-201ENST00000512793 793 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
TPX2Q9ULW0 LINC02356-202ENST00000552663 314 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TPX2Q9ULW0 NDUFA4L2-206ENST00000556732 883 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TPX2Q9ULW0 RARRES2P5-201ENST00000564013 466 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
TPX2Q9ULW0 CD300LG-205ENST00000586233 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TPX2Q9ULW0 AC010326.2-201ENST00000602124 1020 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TPX2Q9ULW0 UBE2E3-205ENST00000602475 602 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TPX2Q9ULW0 TMEM261P1-201ENST00000604899 340 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
TPX2Q9ULW0 SLC9A3-AS1-206ENST00000607005 435 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TPX2Q9ULW0 KLHL33-203ENST00000637228 5404 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TPX2Q9ULW0 LHFPL4-201ENST00000287585 4880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TPX2Q9ULW0 FOXRED2-201ENST00000216187 3933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TPX2Q9ULW0 PLIN3-202ENST00000585479 1535 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TPX2Q9ULW0 UBXN11-205ENST00000374221 1792 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TPX2Q9ULW0 AL034550.2-201ENST00000620523 1771 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TPX2Q9ULW0 RAD51-201ENST00000267868 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TPX2Q9ULW0 ZKSCAN2-201ENST00000328086 7523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TPX2Q9ULW0 MED4-201ENST00000258648 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TPX2Q9ULW0 AL354714.1-201ENST00000356006 2136 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TPX2Q9ULW0 GSKIP-201ENST00000438650 2140 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TPX2Q9ULW0 CHEK2-204ENST00000382580 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TPX2Q9ULW0 EVL-201ENST00000392920 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TPX2Q9ULW0 NARFL-202ENST00000540986 3212 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TPX2Q9ULW0 UBC-205ENST00000536769 3745 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TPX2Q9ULW0 PRPS2-203ENST00000398491 1348 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TPX2Q9ULW0 COMMD5-203ENST00000450361 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TPX2Q9ULW0 REXO1L2P-201ENST00000425429 2069 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
TPX2Q9ULW0 MAP2K1-201ENST00000307102 3410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TPX2Q9ULW0 FBXL16-201ENST00000324361 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TPX2Q9ULW0 EIF5-202ENST00000392715 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TPX2Q9ULW0 AC079447.1-201ENST00000424491 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TPX2Q9ULW0 EML4-201ENST00000318522 5549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TPX2Q9ULW0 IRAK4-212ENST00000551736 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TPX2Q9ULW0 FDPS-202ENST00000368356 1431 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TPX2Q9ULW0 CLEC16A-203ENST00000409790 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TPX2Q9ULW0 HTR7-203ENST00000371719 3033 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TPX2Q9ULW0 BVES-201ENST00000314641 5567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TPX2Q9ULW0 USP37-202ENST00000338465 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TPX2Q9ULW0 PPM1F-202ENST00000397495 1778 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TPX2Q9ULW0 MYOZ1-201ENST00000359322 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TPX2Q9ULW0 ISCA1-201ENST00000311534 813 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TPX2Q9ULW0 RPSAP31-202ENST00000445165 716 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TPX2Q9ULW0 BMP7-AS1-201ENST00000445956 436 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TPX2Q9ULW0 AC079296.1-201ENST00000531592 560 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TPX2Q9ULW0 AC233702.7-201ENST00000536958 924 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TPX2Q9ULW0 CSF1R-209ENST00000543093 921 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TPX2Q9ULW0 TRAPPC6A-204ENST00000588062 695 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TPX2Q9ULW0 AC008494.3-201ENST00000606615 944 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
TPX2Q9ULW0 AL162274.1-201ENST00000617191 1098 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
TPX2Q9ULW0 CUL1-201ENST00000325222 3064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TPX2Q9ULW0 CNOT10-201ENST00000328834 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TPX2Q9ULW0 HTR3A-202ENST00000355556 2331 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TPX2Q9ULW0 NF2-205ENST00000361452 5884 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TPX2Q9ULW0 SF3B4-201ENST00000271628 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63 ms