Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJU5

FOXD3, Forkhead box protein D3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 478 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXD3Q9UJU5 AC128709.2-201ENST00000438408 558 ntTSL 4 BASIC13.49□□□□□ -0.25
FOXD3Q9UJU5 LRRC74B-201ENST00000442047 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
FOXD3Q9UJU5 AC078785.1-201ENST00000496389 734 ntTSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
FOXD3Q9UJU5 PFN2-215ENST00000497148 743 ntTSL 4 BASIC13.49□□□□□ -0.25
FOXD3Q9UJU5 AC104596.1-201ENST00000507826 579 ntTSL 4 BASIC13.49□□□□□ -0.25
FOXD3Q9UJU5 VASH1-AS1-201ENST00000554058 871 ntTSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
FOXD3Q9UJU5 EEF1DP1-201ENST00000585891 896 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
FOXD3Q9UJU5 CR381653.1-201ENST00000622961 812 ntTSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
FOXD3Q9UJU5 FP565260.5-201ENST00000623188 479 ntTSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
FOXD3Q9UJU5 AC244452.3-201ENST00000636814 210 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
FOXD3Q9UJU5 CMTM3-203ENST00000460097 1797 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
FOXD3Q9UJU5 SLC6A11-201ENST00000254488 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
FOXD3Q9UJU5 SLK-201ENST00000335753 7673 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
FOXD3Q9UJU5 NRIP1-203ENST00000400202 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
FOXD3Q9UJU5 RHOXF1P3-203ENST00000640298 2668 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
FOXD3Q9UJU5 RSPH3-201ENST00000252655 2175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
FOXD3Q9UJU5 CALD1-222ENST00000495522 2199 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
FOXD3Q9UJU5 MFSD4B-201ENST00000368847 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
FOXD3Q9UJU5 PES1-204ENST00000402284 2144 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
FOXD3Q9UJU5 LINC02212-201ENST00000515243 2130 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
FOXD3Q9UJU5 NEK5-204ENST00000617045 2127 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
FOXD3Q9UJU5 AC010327.3-201ENST00000591665 1643 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
FOXD3Q9UJU5 TBC1D3G-201ENST00000569055 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
FOXD3Q9UJU5 TBC1D3H-201ENST00000610350 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
FOXD3Q9UJU5 TBC1D3L-202ENST00000617678 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
FOXD3Q9UJU5 SLC22A7-203ENST00000372589 2549 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
FOXD3Q9UJU5 NMNAT3-201ENST00000296202 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
FOXD3Q9UJU5 ATP6V1H-202ENST00000359530 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
FOXD3Q9UJU5 AZGP1-202ENST00000411734 2027 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
FOXD3Q9UJU5 STRA6-218ENST00000574278 2455 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
FOXD3Q9UJU5 ATG4B-205ENST00000404914 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
FOXD3Q9UJU5 DHODH-201ENST00000219240 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
FOXD3Q9UJU5 CRAMP1-201ENST00000293925 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
FOXD3Q9UJU5 GNB2-202ENST00000393924 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
FOXD3Q9UJU5 LRRC59-203ENST00000576448 1531 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
FOXD3Q9UJU5 EYA4-205ENST00000430974 2364 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
FOXD3Q9UJU5 RCOR1-201ENST00000262241 5754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
FOXD3Q9UJU5 VWA2-202ENST00000392982 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
FOXD3Q9UJU5 EHF-210ENST00000531794 1481 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
FOXD3Q9UJU5 SULT1C4-201ENST00000272452 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
FOXD3Q9UJU5 HARS2-202ENST00000448069 1426 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
FOXD3Q9UJU5 HNRNPA1-202ENST00000340913 1842 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
FOXD3Q9UJU5 TGFB1I1-201ENST00000361773 1773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
FOXD3Q9UJU5 IFT52-201ENST00000373030 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
FOXD3Q9UJU5 PPM1F-202ENST00000397495 1778 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
FOXD3Q9UJU5 MBD1-217ENST00000588937 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
FOXD3Q9UJU5 RBFOX3-211ENST00000583458 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
FOXD3Q9UJU5 SLC30A5-202ENST00000396591 4360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
FOXD3Q9UJU5 TEX264-205ENST00000416589 1313 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
FOXD3Q9UJU5 CLCN2-202ENST00000344937 3187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
FOXD3Q9UJU5 TEX29-201ENST00000283547 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
FOXD3Q9UJU5 ZNF746-201ENST00000340622 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
FOXD3Q9UJU5 PRDX5-203ENST00000352435 596 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
FOXD3Q9UJU5 MIR326-201ENST00000362220 95 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
FOXD3Q9UJU5 AGER-203ENST00000375065 665 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
FOXD3Q9UJU5 OLR1-203ENST00000432556 950 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
FOXD3Q9UJU5 MACROD2-AS1-202ENST00000455291 663 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
FOXD3Q9UJU5 GLYCTK-203ENST00000461183 889 ntTSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
FOXD3Q9UJU5 APOA2-204ENST00000464492 530 ntTSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
FOXD3Q9UJU5 SELENOW-201ENST00000509570 881 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
FOXD3Q9UJU5 AAMDC-206ENST00000526415 579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
FOXD3Q9UJU5 AF111167.2-202ENST00000558267 599 ntTSL 4 BASIC13.48□□□□□ -0.25
FOXD3Q9UJU5 AL031600.1-201ENST00000563610 570 ntTSL 4 BASIC13.48□□□□□ -0.25
FOXD3Q9UJU5 ETV2-208ENST00000621247 941 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
FOXD3Q9UJU5 ARID1B-222ENST00000637003 1290 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
FOXD3Q9UJU5 TMEM263-201ENST00000280756 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
FOXD3Q9UJU5 TEAD3-201ENST00000338863 2983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
FOXD3Q9UJU5 NPHP3-AS1-201ENST00000489343 2957 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
FOXD3Q9UJU5 SUCO-204ENST00000608151 5790 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
FOXD3Q9UJU5 PAXBP1-202ENST00000331923 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
FOXD3Q9UJU5 HNRNPUL1-220ENST00000602130 2932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
FOXD3Q9UJU5 CLDN22-201ENST00000323319 2581 ntAPPRIS P1 BASIC13.48□□□□□ -0.25
FOXD3Q9UJU5 IL12A-201ENST00000305579 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
FOXD3Q9UJU5 MAX-205ENST00000358664 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
FOXD3Q9UJU5 UBE3B-212ENST00000540230 1541 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
FOXD3Q9UJU5 AC015818.8-201ENST00000587907 1519 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
FOXD3Q9UJU5 FASTKD5-201ENST00000380266 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
FOXD3Q9UJU5 LEF1-216ENST00000510624 1472 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
FOXD3Q9UJU5 AC007743.1-201ENST00000596663 3075 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
FOXD3Q9UJU5 AL009178.2-201ENST00000597278 2719 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
FOXD3Q9UJU5 SULT2B1-202ENST00000323090 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
FOXD3Q9UJU5 BRF1-203ENST00000379937 3314 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
FOXD3Q9UJU5 ST7L-207ENST00000369669 1743 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
FOXD3Q9UJU5 CBX3-203ENST00000409747 1717 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
FOXD3Q9UJU5 FGF7P3-202ENST00000640245 1707 ntTSL 4 BASIC13.47□□□□□ -0.25
FOXD3Q9UJU5 RGS6-218ENST00000556437 1689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
FOXD3Q9UJU5 RPTOR-203ENST00000570891 2286 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
FOXD3Q9UJU5 GOLGA2P7-202ENST00000400817 2850 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
FOXD3Q9UJU5 RPS23-201ENST00000296674 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
FOXD3Q9UJU5 RHD-206ENST00000423810 1637 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
FOXD3Q9UJU5 FXYD3-202ENST00000346446 1320 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
FOXD3Q9UJU5 NRBF2-201ENST00000277746 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
FOXD3Q9UJU5 GOLGA8M-201ENST00000563027 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
FOXD3Q9UJU5 LINC00937-207ENST00000544461 3033 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
FOXD3Q9UJU5 HIST3H3-201ENST00000366696 481 ntAPPRIS P1 BASIC13.47□□□□□ -0.25
FOXD3Q9UJU5 RBAK-RBAKDN-201ENST00000396904 766 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC13.47□□□□□ -0.25
FOXD3Q9UJU5 SMIM11A-203ENST00000399299 1033 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
FOXD3Q9UJU5 MPV17-205ENST00000402310 906 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
FOXD3Q9UJU5 RBAK-RBAKDN-202ENST00000407184 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
FOXD3Q9UJU5 LSM5-207ENST00000410044 687 ntTSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.7 ms