Protein–RNA interactions for Protein: Q9UIA0

CYTH4, Cytohesin-4, humanhuman

Predictions only

Length 394 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYTH4Q9UIA0 P2RX5-207ENST00000551178 1863 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CYTH4Q9UIA0 RAI1-207ENST00000640861 5172 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CYTH4Q9UIA0 TRAPPC8-210ENST00000582513 3205 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CYTH4Q9UIA0 CYB561-203ENST00000392976 3151 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CYTH4Q9UIA0 PGBD5-202ENST00000525115 1569 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CYTH4Q9UIA0 LINC00937-207ENST00000544461 3033 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CYTH4Q9UIA0 KHDRBS1-202ENST00000327300 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CYTH4Q9UIA0 CHPF2-204ENST00000495645 2709 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CYTH4Q9UIA0 PIANP-202ENST00000534837 2695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CYTH4Q9UIA0 FKBP4P6-201ENST00000457486 1332 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
CYTH4Q9UIA0 WDR45-224ENST00000485908 1301 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CYTH4Q9UIA0 ZSCAN30-212ENST00000639929 1305 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CYTH4Q9UIA0 DYNLRB2-201ENST00000305904 497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CYTH4Q9UIA0 TPM3P8-201ENST00000330554 643 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
CYTH4Q9UIA0 WDR54-201ENST00000348227 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CYTH4Q9UIA0 PLAC9-201ENST00000372263 785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CYTH4Q9UIA0 ITPA-201ENST00000380113 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CYTH4Q9UIA0 IFT20-203ENST00000395418 825 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CYTH4Q9UIA0 C15orf48-202ENST00000396650 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CYTH4Q9UIA0 ITPA-202ENST00000399838 897 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CYTH4Q9UIA0 SERF2-209ENST00000409646 559 ntTSL 4 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CYTH4Q9UIA0 COPS6-202ENST00000418625 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CYTH4Q9UIA0 AL583835.2-202ENST00000421363 1104 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CYTH4Q9UIA0 KCNQ1-AS1-201ENST00000440887 1084 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CYTH4Q9UIA0 DMKN-216ENST00000458071 510 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CYTH4Q9UIA0 ACA64.2-201ENST00000459014 129 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
CYTH4Q9UIA0 IP6K1-203ENST00000460540 1260 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CYTH4Q9UIA0 LIMS3-203ENST00000480744 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CYTH4Q9UIA0 LINC02279-201ENST00000553435 737 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CYTH4Q9UIA0 AC004637.1-201ENST00000586675 482 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CYTH4Q9UIA0 IFT20-216ENST00000588477 774 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CYTH4Q9UIA0 RAB34-222ENST00000625712 994 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CYTH4Q9UIA0 GGT6-201ENST00000301395 2534 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CYTH4Q9UIA0 YME1L1-202ENST00000375972 2517 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CYTH4Q9UIA0 LIMS2-205ENST00000409455 2500 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CYTH4Q9UIA0 ZNF7-202ENST00000446747 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CYTH4Q9UIA0 TMPRSS6-202ENST00000381792 3260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CYTH4Q9UIA0 ACBD5-202ENST00000375897 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CYTH4Q9UIA0 CLIC5-208ENST00000544153 2051 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CYTH4Q9UIA0 MAPK7-203ENST00000395602 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CYTH4Q9UIA0 BLCAP-205ENST00000397137 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CYTH4Q9UIA0 TARS2-203ENST00000369054 1998 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CYTH4Q9UIA0 PFKFB4-201ENST00000232375 3586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CYTH4Q9UIA0 DEPDC7-201ENST00000241051 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CYTH4Q9UIA0 RUFY1-204ENST00000437570 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CYTH4Q9UIA0 ZNF385A-205ENST00000546970 2494 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CYTH4Q9UIA0 NMUR1-201ENST00000305141 3298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CYTH4Q9UIA0 MPPE1-201ENST00000309976 1636 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CYTH4Q9UIA0 GCNT7-201ENST00000243913 2064 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CYTH4Q9UIA0 TPM3-208ENST00000341485 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CYTH4Q9UIA0 SERINC2-206ENST00000536859 2072 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CYTH4Q9UIA0 SLC25A37-206ENST00000519973 4823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CYTH4Q9UIA0 PXN-207ENST00000536957 4112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CYTH4Q9UIA0 CDK16-211ENST00000518022 2022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CYTH4Q9UIA0 CHST10-203ENST00000409701 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CYTH4Q9UIA0 ADAD1-201ENST00000296513 1961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CYTH4Q9UIA0 SEPT9-244ENST00000592420 2588 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CYTH4Q9UIA0 TNKS1BP1-201ENST00000358252 5795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CYTH4Q9UIA0 RUBCNL-212ENST00000631139 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CYTH4Q9UIA0 SLK-201ENST00000335753 7673 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CYTH4Q9UIA0 RETN-201ENST00000221515 520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CYTH4Q9UIA0 TEX12-201ENST00000280358 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CYTH4Q9UIA0 AC006001.1-201ENST00000325130 474 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
CYTH4Q9UIA0 IGHV3-7-201ENST00000390598 430 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CYTH4Q9UIA0 MPV17-205ENST00000402310 906 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CYTH4Q9UIA0 AC007405.2-202ENST00000418106 540 ntTSL 4 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CYTH4Q9UIA0 TLE1P1-201ENST00000422965 589 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
CYTH4Q9UIA0 RFPL4A-201ENST00000434937 1035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CYTH4Q9UIA0 AC007274.1-201ENST00000439805 662 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
CYTH4Q9UIA0 RHOXF1P1-201ENST00000454625 772 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CYTH4Q9UIA0 FTLP10-202ENST00000505798 471 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
CYTH4Q9UIA0 FAM153B-214ENST00000512862 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CYTH4Q9UIA0 AC131206.1-201ENST00000538078 1211 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
CYTH4Q9UIA0 AP000812.2-201ENST00000538934 718 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
CYTH4Q9UIA0 RPL28-206ENST00000558752 671 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CYTH4Q9UIA0 LARP4-220ENST00000615080 856 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CYTH4Q9UIA0 ANXA2R-202ENST00000616064 1265 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CYTH4Q9UIA0 AC138951.2-201ENST00000623455 1161 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
CYTH4Q9UIA0 TIMP2-201ENST00000262768 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CYTH4Q9UIA0 PPM1B-205ENST00000409432 3025 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CYTH4Q9UIA0 XPO5-201ENST00000265351 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CYTH4Q9UIA0 USP43-201ENST00000285199 4169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CYTH4Q9UIA0 BACE2-203ENST00000347667 8764 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CYTH4Q9UIA0 CYB561D1-205ENST00000430195 5077 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CYTH4Q9UIA0 TK1-201ENST00000301634 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CYTH4Q9UIA0 MIER1-209ENST00000401042 1648 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CYTH4Q9UIA0 GAS2L2-203ENST00000618498 2655 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CYTH4Q9UIA0 HTR3E-202ENST00000415389 2139 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CYTH4Q9UIA0 DCUN1D2-201ENST00000332592 2626 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CYTH4Q9UIA0 PCDHGB1-202ENST00000611598 2592 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CYTH4Q9UIA0 UGGT2-204ENST00000397618 1547 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CYTH4Q9UIA0 MAGED4B-202ENST00000360134 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CYTH4Q9UIA0 FAM189A2-201ENST00000257515 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CYTH4Q9UIA0 BIRC5-203ENST00000374948 2446 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CYTH4Q9UIA0 EDEM2-202ENST00000374492 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CYTH4Q9UIA0 FAM153A-220ENST00000513554 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CYTH4Q9UIA0 ATP2A3-205ENST00000397041 4675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CYTH4Q9UIA0 CYP4F3-203ENST00000586182 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CYTH4Q9UIA0 CTBP1-AS2-205ENST00000578730 2757 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CYTH4Q9UIA0 PTPN5-202ENST00000396166 2299 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.4 ms