Protein–RNA interactions for Protein: Q9UGL1

KDM5B, Lysine-specific demethylase 5B, humanhuman

Predictions only

Length 1,544 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KDM5BQ9UGL1 GMPR2-231ENST00000620807 1910 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
KDM5BQ9UGL1 LYPD5-202ENST00000414615 2137 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
KDM5BQ9UGL1 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
KDM5BQ9UGL1 BABAM2-204ENST00000379624 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
KDM5BQ9UGL1 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
KDM5BQ9UGL1 AL663074.1-201ENST00000436642 299 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
KDM5BQ9UGL1 AL132801.1-201ENST00000559675 567 ntTSL 4 BASIC22.76■■□□□ 1.23
KDM5BQ9UGL1 AC124068.2-202ENST00000562356 612 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
KDM5BQ9UGL1 AC124068.2-201ENST00000569473 1109 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
KDM5BQ9UGL1 AC004528.1-201ENST00000588380 641 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
KDM5BQ9UGL1 AC010976.2-201ENST00000609697 852 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
KDM5BQ9UGL1 KEAP1-201ENST00000171111 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
KDM5BQ9UGL1 NKX3-1-201ENST00000380871 3271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
KDM5BQ9UGL1 C12orf76-209ENST00000615315 1580 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
KDM5BQ9UGL1 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
KDM5BQ9UGL1 PLAGL1-211ENST00000625622 3216 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
KDM5BQ9UGL1 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
KDM5BQ9UGL1 DNMT3L-204ENST00000628202 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
KDM5BQ9UGL1 ATP6V0D1-201ENST00000290949 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
KDM5BQ9UGL1 AC010096.1-201ENST00000443897 1709 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
KDM5BQ9UGL1 CYP4F22-202ENST00000601005 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
KDM5BQ9UGL1 SBNO2-204ENST00000587024 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
KDM5BQ9UGL1 TNF-208ENST00000449264 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
KDM5BQ9UGL1 HDAC11-214ENST00000446613 2875 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
KDM5BQ9UGL1 AP000704.1-201ENST00000637940 2182 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
KDM5BQ9UGL1 LILRA2-203ENST00000391737 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
KDM5BQ9UGL1 IQCJ-201ENST00000397832 1460 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
KDM5BQ9UGL1 RNVU1-8-201ENST00000364272 125 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
KDM5BQ9UGL1 MDS2-201ENST00000374555 1029 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
KDM5BQ9UGL1 ZNRD1-203ENST00000376782 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
KDM5BQ9UGL1 HNRNPA1P58-201ENST00000403629 610 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
KDM5BQ9UGL1 AC112721.1-201ENST00000409162 588 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
KDM5BQ9UGL1 ACTG2-204ENST00000409918 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
KDM5BQ9UGL1 AL391415.1-201ENST00000439844 400 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
KDM5BQ9UGL1 CISD2-202ENST00000503643 808 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
KDM5BQ9UGL1 LINC01485-202ENST00000520324 566 ntTSL 4 BASIC22.75■■□□□ 1.23
KDM5BQ9UGL1 FAM60A-207ENST00000542983 738 ntTSL 4 BASIC22.75■■□□□ 1.23
KDM5BQ9UGL1 HELLS-212ENST00000630929 400 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
KDM5BQ9UGL1 SLC46A2-201ENST00000374228 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
KDM5BQ9UGL1 SLC25A3-216ENST00000551917 1359 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
KDM5BQ9UGL1 ENDOU-203ENST00000545824 1513 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
KDM5BQ9UGL1 LINC00339-208ENST00000634934 1518 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
KDM5BQ9UGL1 TXNDC11-201ENST00000283033 3140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
KDM5BQ9UGL1 CDK11B-207ENST00000626918 2457 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
KDM5BQ9UGL1 CDK11B-208ENST00000629289 2490 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
KDM5BQ9UGL1 SLC8B1-202ENST00000546737 1656 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
KDM5BQ9UGL1 MAX-204ENST00000358402 1973 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
KDM5BQ9UGL1 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
KDM5BQ9UGL1 CSK-210ENST00000567571 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
KDM5BQ9UGL1 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
KDM5BQ9UGL1 KYAT1-202ENST00000320665 1623 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
KDM5BQ9UGL1 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
KDM5BQ9UGL1 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
KDM5BQ9UGL1 GSAP-201ENST00000257626 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
KDM5BQ9UGL1 GLS2-201ENST00000311966 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
KDM5BQ9UGL1 MAPK13-202ENST00000373759 1036 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
KDM5BQ9UGL1 DIO1-203ENST00000388876 606 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
KDM5BQ9UGL1 ACTG1P19-201ENST00000418987 1116 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
KDM5BQ9UGL1 AC083801.1-201ENST00000491689 358 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
KDM5BQ9UGL1 DIO1-204ENST00000524406 626 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
KDM5BQ9UGL1 DIO1-213ENST00000532493 406 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
KDM5BQ9UGL1 LINC02285-201ENST00000557121 943 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
KDM5BQ9UGL1 AC010504.1-201ENST00000591311 585 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
KDM5BQ9UGL1 AC003006.1-202ENST00000594684 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
KDM5BQ9UGL1 BRF1-206ENST00000446501 2858 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
KDM5BQ9UGL1 CNPY4-201ENST00000262932 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
KDM5BQ9UGL1 TUBA3C-202ENST00000618094 1386 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
KDM5BQ9UGL1 TRPV4-204ENST00000536838 2514 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
KDM5BQ9UGL1 C16orf58-211ENST00000570164 2783 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
KDM5BQ9UGL1 TPD52L2-204ENST00000351424 2302 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
KDM5BQ9UGL1 BSDC1-203ENST00000419121 1473 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
KDM5BQ9UGL1 ZNF77-201ENST00000314531 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
KDM5BQ9UGL1 FAM86B1-216ENST00000533852 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
KDM5BQ9UGL1 VIPR1-217ENST00000543411 2681 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
KDM5BQ9UGL1 ATF4-202ENST00000396680 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
KDM5BQ9UGL1 VEGFA-201ENST00000230480 993 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
KDM5BQ9UGL1 ATP5S-203ENST00000358473 801 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
KDM5BQ9UGL1 UROS-201ENST00000368774 744 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
KDM5BQ9UGL1 CACNG7-202ENST00000391766 631 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
KDM5BQ9UGL1 LINC01022-201ENST00000415652 394 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
KDM5BQ9UGL1 NACA-221ENST00000552540 1074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
KDM5BQ9UGL1 AF111169.2-201ENST00000553758 721 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
KDM5BQ9UGL1 NAA38-205ENST00000575771 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
KDM5BQ9UGL1 AC103808.3-201ENST00000579714 598 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
KDM5BQ9UGL1 AP005212.2-201ENST00000584979 510 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
KDM5BQ9UGL1 CNTNAP2-225ENST00000639247 2064 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
KDM5BQ9UGL1 RALGPS1-203ENST00000373434 2466 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
KDM5BQ9UGL1 SHMT2-232ENST00000557487 1918 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
KDM5BQ9UGL1 STOX1-201ENST00000298596 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
KDM5BQ9UGL1 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
KDM5BQ9UGL1 FGD4-203ENST00000472289 1629 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
KDM5BQ9UGL1 HNRNPLL-212ENST00000608859 3035 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
KDM5BQ9UGL1 TMEM198B-203ENST00000482378 2230 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
KDM5BQ9UGL1 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
KDM5BQ9UGL1 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
KDM5BQ9UGL1 PAF1-201ENST00000221265 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
KDM5BQ9UGL1 CCDC43-203ENST00000588210 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
KDM5BQ9UGL1 CPSF7-202ENST00000394888 3650 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
KDM5BQ9UGL1 RFK-201ENST00000376736 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
KDM5BQ9UGL1 CYP11A1-201ENST00000268053 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.6 ms