Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0V3

SH3BP4, SH3 domain-binding protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 963 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP4Q9P0V3 SNX14-202ENST00000346348 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
SH3BP4Q9P0V3 DRD5P1-201ENST00000456605 1438 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
SH3BP4Q9P0V3 DARS-AS1-209ENST00000594219 1420 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
SH3BP4Q9P0V3 ACOT7-210ENST00000608083 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
SH3BP4Q9P0V3 MAGED2-201ENST00000218439 1958 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
SH3BP4Q9P0V3 DLX6-202ENST00000518156 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
SH3BP4Q9P0V3 CACTIN-203ENST00000429344 3612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
SH3BP4Q9P0V3 LDLRAD4-205ENST00000585931 2118 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
SH3BP4Q9P0V3 TRIM3-215ENST00000639856 2137 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
SH3BP4Q9P0V3 HIPK4-201ENST00000291823 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
SH3BP4Q9P0V3 ABCB8-201ENST00000297504 2487 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
SH3BP4Q9P0V3 FAM174A-201ENST00000312637 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
SH3BP4Q9P0V3 GPANK1-203ENST00000375896 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
SH3BP4Q9P0V3 EIF4G1-218ENST00000434061 5026 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
SH3BP4Q9P0V3 ACAN-209ENST00000617301 8669 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
SH3BP4Q9P0V3 DDX21-202ENST00000620315 4829 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
SH3BP4Q9P0V3 EID1-201ENST00000530028 2298 ntAPPRIS P1 BASIC14.46□□□□□ -0.09
SH3BP4Q9P0V3 MAPK4-201ENST00000400384 4770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
SH3BP4Q9P0V3 ADPRHL1-202ENST00000375418 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
SH3BP4Q9P0V3 GCFC2-211ENST00000541687 4318 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
SH3BP4Q9P0V3 CKM-201ENST00000221476 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
SH3BP4Q9P0V3 ACVR1B-206ENST00000542485 2362 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
SH3BP4Q9P0V3 CA12-202ENST00000344366 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
SH3BP4Q9P0V3 SUGP2-215ENST00000601879 5546 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
SH3BP4Q9P0V3 CDH16-207ENST00000568632 2526 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
SH3BP4Q9P0V3 EGOT-201ENST00000414938 1464 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
SH3BP4Q9P0V3 CLN3-229ENST00000567963 1452 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
SH3BP4Q9P0V3 PLEKHO2-201ENST00000323544 3720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
SH3BP4Q9P0V3 COL25A1-201ENST00000399126 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
SH3BP4Q9P0V3 MPDU1-201ENST00000250124 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
SH3BP4Q9P0V3 CSF2RB-202ENST00000403662 4863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
SH3BP4Q9P0V3 CSPG4P12-202ENST00000559989 7790 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
SH3BP4Q9P0V3 ACSL1-201ENST00000281455 3832 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
SH3BP4Q9P0V3 CIDEA-201ENST00000320477 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
SH3BP4Q9P0V3 SNX2-201ENST00000379516 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
SH3BP4Q9P0V3 PDGFB-202ENST00000381551 1125 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
SH3BP4Q9P0V3 INF2-203ENST00000392634 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
SH3BP4Q9P0V3 RABL2A-203ENST00000393166 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
SH3BP4Q9P0V3 CYSRT1-201ENST00000409414 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
SH3BP4Q9P0V3 FAM197Y5-201ENST00000423213 765 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
SH3BP4Q9P0V3 MNX1-AS2-201ENST00000429228 374 ntTSL 3 BASIC14.46□□□□□ -0.09
SH3BP4Q9P0V3 AL606760.1-201ENST00000458151 1181 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
SH3BP4Q9P0V3 SLC35B4-204ENST00000470969 1033 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
SH3BP4Q9P0V3 RN7SL399P-201ENST00000471648 279 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
SH3BP4Q9P0V3 GAPDHP40-201ENST00000505218 1006 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
SH3BP4Q9P0V3 UBE2V2-201ENST00000517630 612 ntTSL 4 BASIC14.46□□□□□ -0.09
SH3BP4Q9P0V3 CDK2AP2-205ENST00000531506 634 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
SH3BP4Q9P0V3 TMEM63A-209ENST00000537914 1018 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
SH3BP4Q9P0V3 AC023310.3-201ENST00000557027 670 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
SH3BP4Q9P0V3 AC090825.1-203ENST00000558188 582 ntTSL 3 BASIC14.46□□□□□ -0.09
SH3BP4Q9P0V3 AC100756.1-201ENST00000562736 682 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
SH3BP4Q9P0V3 AC138749.3-201ENST00000567691 622 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
SH3BP4Q9P0V3 AL049840.4-201ENST00000602422 811 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
SH3BP4Q9P0V3 AL390955.2-201ENST00000603032 514 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
SH3BP4Q9P0V3 SWI5-206ENST00000608796 906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
SH3BP4Q9P0V3 AC116165.1-201ENST00000611806 668 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
SH3BP4Q9P0V3 AC092506.1-204ENST00000634888 1066 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
SH3BP4Q9P0V3 CLN3-246ENST00000636228 1224 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
SH3BP4Q9P0V3 LAMB2-202ENST00000418109 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
SH3BP4Q9P0V3 ADCYAP1R1-204ENST00000409489 1761 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
SH3BP4Q9P0V3 MCM3AP-AS1-203ENST00000421927 2280 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
SH3BP4Q9P0V3 STIP1-207ENST00000538945 1900 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
SH3BP4Q9P0V3 PRPF3-201ENST00000324862 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
SH3BP4Q9P0V3 ADRB2-201ENST00000305988 3443 ntAPPRIS P1 BASIC14.46□□□□□ -0.09
SH3BP4Q9P0V3 APCDD1L-201ENST00000371149 3426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
SH3BP4Q9P0V3 MAOB-201ENST00000378069 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
SH3BP4Q9P0V3 SCYL1-208ENST00000527009 2586 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
SH3BP4Q9P0V3 RPL15-201ENST00000307839 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
SH3BP4Q9P0V3 IMPDH1-201ENST00000338791 2881 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.1
SH3BP4Q9P0V3 LRRC6-205ENST00000519595 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
SH3BP4Q9P0V3 IMPDH1-217ENST00000626419 2862 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.1
SH3BP4Q9P0V3 HSDL1-201ENST00000219439 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
SH3BP4Q9P0V3 DNAJA1-201ENST00000330899 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
SH3BP4Q9P0V3 PRKD2-206ENST00000595515 3012 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.1
SH3BP4Q9P0V3 RIC8B-202ENST00000392837 5135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.1
SH3BP4Q9P0V3 ALG1-204ENST00000588623 2671 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
SH3BP4Q9P0V3 GAS2L2-203ENST00000618498 2655 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
SH3BP4Q9P0V3 SLC4A7-210ENST00000440156 4120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
SH3BP4Q9P0V3 AIFM1-209ENST00000535724 2468 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
SH3BP4Q9P0V3 AL138799.1-201ENST00000448213 1675 ntBASIC14.46□□□□□ -0.1
SH3BP4Q9P0V3 SYNGR1-203ENST00000328933 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
SH3BP4Q9P0V3 DUSP27-201ENST00000271385 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
SH3BP4Q9P0V3 NPFFR1-201ENST00000277942 8921 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
SH3BP4Q9P0V3 ASTN2-206ENST00000361477 4001 ntTSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
SH3BP4Q9P0V3 AC092384.2-204ENST00000565053 2566 ntTSL 2 BASIC14.45□□□□□ -0.1
SH3BP4Q9P0V3 RAPGEF4-201ENST00000397081 4299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
SH3BP4Q9P0V3 NEDD4L-238ENST00000635997 4402 ntTSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
SH3BP4Q9P0V3 OIT3-202ENST00000622652 1602 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
SH3BP4Q9P0V3 SOGA3-201ENST00000465909 3756 ntTSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
SH3BP4Q9P0V3 IKZF1-205ENST00000357364 5925 ntTSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
SH3BP4Q9P0V3 LINC00116-201ENST00000414416 2051 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
SH3BP4Q9P0V3 ITGBL1-207ENST00000622834 2369 ntTSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
SH3BP4Q9P0V3 EVC2-201ENST00000310917 4828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
SH3BP4Q9P0V3 UBE2G2-202ENST00000345496 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
SH3BP4Q9P0V3 AC126335.2-201ENST00000623362 4637 ntBASIC14.45□□□□□ -0.1
SH3BP4Q9P0V3 GCLC-201ENST00000229416 3813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
SH3BP4Q9P0V3 F2RL1-201ENST00000296677 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
SH3BP4Q9P0V3 SPDYE19P-201ENST00000338590 713 ntBASIC14.45□□□□□ -0.1
SH3BP4Q9P0V3 S100A16-202ENST00000368704 1146 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.45□□□□□ -0.1
SH3BP4Q9P0V3 DSCR3-204ENST00000399001 821 ntTSL 2 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.7 ms