Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRW1

RAB6B, Ras-related protein Rab-6B, humanhuman

Predictions only

Length 208 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB6BQ9NRW1 AC002116.1-201ENST00000473572 1130 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RAB6BQ9NRW1 UBE2V2-201ENST00000517630 612 ntTSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RAB6BQ9NRW1 AC009902.2-201ENST00000518880 620 ntTSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RAB6BQ9NRW1 MIR210HG-203ENST00000533920 816 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RAB6BQ9NRW1 RNF24-204ENST00000545616 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RAB6BQ9NRW1 LINC01220-201ENST00000558575 715 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RAB6BQ9NRW1 DUT-210ENST00000559935 569 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RAB6BQ9NRW1 IGHV3OR16-8-201ENST00000565407 349 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RAB6BQ9NRW1 KIF22-208ENST00000569382 2020 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RAB6BQ9NRW1 LINC01975-201ENST00000571890 549 ntTSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RAB6BQ9NRW1 AC005498.2-205ENST00000593218 784 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
RAB6BQ9NRW1 UNQ6494-202ENST00000617436 2163 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RAB6BQ9NRW1 HAND2-AS1-202ENST00000502896 5278 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RAB6BQ9NRW1 BRD1-205ENST00000457780 4997 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RAB6BQ9NRW1 ZNF785-202ENST00000470110 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RAB6BQ9NRW1 ALDOA-203ENST00000395248 2447 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RAB6BQ9NRW1 AMOTL2-201ENST00000249883 4488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RAB6BQ9NRW1 IL12A-201ENST00000305579 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RAB6BQ9NRW1 NDUFV1-202ENST00000415352 1512 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RAB6BQ9NRW1 RNF123-202ENST00000432042 2670 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RAB6BQ9NRW1 AC023632.2-201ENST00000523011 1789 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RAB6BQ9NRW1 ARHGEF3-212ENST00000495373 2024 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RAB6BQ9NRW1 INHBA-205ENST00000638023 2002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RAB6BQ9NRW1 AC004706.4-201ENST00000634965 3537 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RAB6BQ9NRW1 MEF2D-201ENST00000348159 5965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RAB6BQ9NRW1 LINC01225-202ENST00000562339 2113 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RAB6BQ9NRW1 NMNAT3-201ENST00000296202 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RAB6BQ9NRW1 FAM103A1-201ENST00000304191 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RAB6BQ9NRW1 KIF7-201ENST00000394412 4551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RAB6BQ9NRW1 CSGALNACT1-211ENST00000522854 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RAB6BQ9NRW1 PCDHB14-201ENST00000239449 4828 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RAB6BQ9NRW1 FKBP6-204ENST00000431982 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RAB6BQ9NRW1 BORCS8-MEF2B-203ENST00000514819 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RAB6BQ9NRW1 PPP1R27-202ENST00000570394 1443 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RAB6BQ9NRW1 VCAN-211ENST00000513984 1825 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RAB6BQ9NRW1 NIN-202ENST00000324330 4364 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RAB6BQ9NRW1 GCLM-204ENST00000615724 3008 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RAB6BQ9NRW1 CDK5RAP2-202ENST00000360190 5985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RAB6BQ9NRW1 DCD-201ENST00000293371 645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RAB6BQ9NRW1 OSM-203ENST00000403463 464 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RAB6BQ9NRW1 SHBG-204ENST00000441599 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RAB6BQ9NRW1 AL033519.3-201ENST00000450618 595 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RAB6BQ9NRW1 AC019103.1-201ENST00000503095 272 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RAB6BQ9NRW1 LSM1-203ENST00000520755 975 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RAB6BQ9NRW1 AC100818.1-201ENST00000524167 563 ntTSL 4 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RAB6BQ9NRW1 AC138304.1-201ENST00000563841 424 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RAB6BQ9NRW1 AC005306.1-201ENST00000587498 661 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RAB6BQ9NRW1 BRI3BPP1-201ENST00000594224 787 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
RAB6BQ9NRW1 LINC01515-215ENST00000608678 854 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RAB6BQ9NRW1 PRMT7-203ENST00000449359 2091 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RAB6BQ9NRW1 STK17B-201ENST00000263955 5287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RAB6BQ9NRW1 CHRDL1-205ENST00000482160 1537 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RAB6BQ9NRW1 WARS2-202ENST00000369426 2811 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RAB6BQ9NRW1 SFMBT1-201ENST00000394752 4548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RAB6BQ9NRW1 SEC13-201ENST00000337354 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RAB6BQ9NRW1 SPRY4-202ENST00000434127 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
RAB6BQ9NRW1 TMEM230-201ENST00000202834 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
RAB6BQ9NRW1 C1orf43-206ENST00000368521 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
RAB6BQ9NRW1 ARMC5-202ENST00000408912 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RAB6BQ9NRW1 CAMLG-201ENST00000297156 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RAB6BQ9NRW1 AC004754.1-201ENST00000600536 2242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RAB6BQ9NRW1 AC027601.5-201ENST00000624065 2482 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
RAB6BQ9NRW1 SLC16A1-207ENST00000538576 4374 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RAB6BQ9NRW1 ACY3-201ENST00000255082 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RAB6BQ9NRW1 PSMD13-215ENST00000621534 1572 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RAB6BQ9NRW1 MAPT-206ENST00000415613 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RAB6BQ9NRW1 MROH1-209ENST00000534366 5092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RAB6BQ9NRW1 SLC44A2-201ENST00000335757 3671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RAB6BQ9NRW1 CLASP2-204ENST00000399362 7282 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RAB6BQ9NRW1 NFYA-202ENST00000353205 1660 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RAB6BQ9NRW1 MAGIX-208ENST00000616266 3295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RAB6BQ9NRW1 TRAPPC8-201ENST00000283351 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RAB6BQ9NRW1 RAD51D-203ENST00000394589 2287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RAB6BQ9NRW1 KRT32-201ENST00000225899 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RAB6BQ9NRW1 TPM3-205ENST00000328159 1771 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RAB6BQ9NRW1 FANCG-201ENST00000378643 2631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RAB6BQ9NRW1 ECSIT-201ENST00000252440 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RAB6BQ9NRW1 C12orf42-201ENST00000378113 1513 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RAB6BQ9NRW1 RDM1-224ENST00000619262 1535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RAB6BQ9NRW1 H2BFWT-201ENST00000217926 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RAB6BQ9NRW1 COX6A1-201ENST00000229379 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RAB6BQ9NRW1 C10orf62-201ENST00000370640 1208 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RAB6BQ9NRW1 DERL3-204ENST00000406855 1063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RAB6BQ9NRW1 NUS1P3-201ENST00000423502 862 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
RAB6BQ9NRW1 AC004522.2-201ENST00000456499 680 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RAB6BQ9NRW1 CD81-207ENST00000481687 890 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RAB6BQ9NRW1 SWI5-205ENST00000495313 466 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RAB6BQ9NRW1 AL356805.1-201ENST00000556383 341 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RAB6BQ9NRW1 AL390726.5-201ENST00000562942 871 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RAB6BQ9NRW1 RRP7BP-205ENST00000566851 833 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
RAB6BQ9NRW1 BX539320.1-201ENST00000623759 877 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
RAB6BQ9NRW1 TDRD12-202ENST00000444215 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RAB6BQ9NRW1 AC108134.1-201ENST00000382225 3061 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RAB6BQ9NRW1 GABPB1-202ENST00000359031 1633 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RAB6BQ9NRW1 DRC3-216ENST00000584166 1953 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RAB6BQ9NRW1 PUDP-202ENST00000412827 1376 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RAB6BQ9NRW1 ELFN2-207ENST00000613079 8360 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RAB6BQ9NRW1 LINC01010-201ENST00000431422 2069 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RAB6BQ9NRW1 FBP1-203ENST00000415431 1487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RAB6BQ9NRW1 YWHAE-208ENST00000571732 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.5 ms