Protein–RNA interactions for Protein: Q9HDB9

ERVK-5, Endogenous retrovirus group K member 5 Gag polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 667 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVK-5Q9HDB9 CTNNBIP1-202ENST00000377258 852 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ERVK-5Q9HDB9 C9orf24-203ENST00000379126 496 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ERVK-5Q9HDB9 RHOG-203ENST00000396979 1289 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ERVK-5Q9HDB9 C9orf116-205ENST00000429260 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ERVK-5Q9HDB9 AC016723.1-201ENST00000430546 633 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ERVK-5Q9HDB9 AL139420.1-201ENST00000439394 653 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ERVK-5Q9HDB9 RPL35A-205ENST00000448864 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ERVK-5Q9HDB9 AC026434.2-201ENST00000506094 1078 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
ERVK-5Q9HDB9 AC090735.1-201ENST00000523881 488 ntTSL 4 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ERVK-5Q9HDB9 RHOG-204ENST00000533217 886 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ERVK-5Q9HDB9 AC009093.8-202ENST00000562902 677 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ERVK-5Q9HDB9 AC022903.1-201ENST00000579327 469 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ERVK-5Q9HDB9 AC020914.3-201ENST00000594712 304 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
ERVK-5Q9HDB9 RPS5-209ENST00000601521 1203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ERVK-5Q9HDB9 AP001002.3-201ENST00000623482 206 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
ERVK-5Q9HDB9 AGT-201ENST00000366667 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ERVK-5Q9HDB9 TMEM92-201ENST00000300433 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ERVK-5Q9HDB9 YTHDC1-202ENST00000355665 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ERVK-5Q9HDB9 CYB561-203ENST00000392976 3151 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ERVK-5Q9HDB9 CCNE1-203ENST00000444983 1680 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ERVK-5Q9HDB9 TMEM169-204ENST00000437356 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ERVK-5Q9HDB9 SLC17A5-201ENST00000355773 3455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ERVK-5Q9HDB9 ITFG1-201ENST00000320640 3400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ERVK-5Q9HDB9 RPA3-201ENST00000223129 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ERVK-5Q9HDB9 WDTC1-202ENST00000361771 4275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ERVK-5Q9HDB9 MRFAP1-202ENST00000382581 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ERVK-5Q9HDB9 ACTL7B-201ENST00000374667 2379 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ERVK-5Q9HDB9 VAT1-201ENST00000355653 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ERVK-5Q9HDB9 ARHGAP27P1-BPTFP1-KPNA2P3-201ENST00000578492 2732 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ERVK-5Q9HDB9 EPB41L3-206ENST00000544123 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ERVK-5Q9HDB9 SYP-207ENST00000479808 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ERVK-5Q9HDB9 USP43-202ENST00000570475 3500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ERVK-5Q9HDB9 ESRRB-207ENST00000556177 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ERVK-5Q9HDB9 ARHGAP35-201ENST00000404338 8889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ERVK-5Q9HDB9 KAT7-210ENST00000509773 1774 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ERVK-5Q9HDB9 AK4-207ENST00000545314 6887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ERVK-5Q9HDB9 LINC00926-201ENST00000501726 2530 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ERVK-5Q9HDB9 ARMC5-203ENST00000457010 4844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ERVK-5Q9HDB9 ZNF385A-205ENST00000546970 2494 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ERVK-5Q9HDB9 PRRT2-207ENST00000572820 2403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ERVK-5Q9HDB9 CDC42BPG-201ENST00000342711 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ERVK-5Q9HDB9 CSH2-201ENST00000336844 1173 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ERVK-5Q9HDB9 CSH2-202ENST00000345366 598 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ERVK-5Q9HDB9 SMS-201ENST00000379404 1174 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ERVK-5Q9HDB9 ADAMTSL1-210ENST00000431052 824 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ERVK-5Q9HDB9 FGF13-204ENST00000436198 1165 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ERVK-5Q9HDB9 IGHJ2P-201ENST00000454480 60 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
ERVK-5Q9HDB9 ZNF527-203ENST00000483919 1142 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ERVK-5Q9HDB9 HIST2H2BC-201ENST00000498492 580 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
ERVK-5Q9HDB9 AC100850.1-201ENST00000506768 649 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
ERVK-5Q9HDB9 SPATA24-205ENST00000509959 641 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ERVK-5Q9HDB9 PAX5-211ENST00000522003 1019 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ERVK-5Q9HDB9 NEU3-202ENST00000526068 431 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ERVK-5Q9HDB9 SMIM24-203ENST00000587847 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ERVK-5Q9HDB9 AC008537.4-201ENST00000595728 1103 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ERVK-5Q9HDB9 PSMD14-201ENST00000409682 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ERVK-5Q9HDB9 SLC9A6-203ENST00000370701 4755 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ERVK-5Q9HDB9 ARIH2-205ENST00000449376 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ERVK-5Q9HDB9 LINC00917-207ENST00000601556 2618 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ERVK-5Q9HDB9 SPTBN4-212ENST00000598249 8070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ERVK-5Q9HDB9 RSPH3-201ENST00000252655 2175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ERVK-5Q9HDB9 KCNG4-202ENST00000568181 2199 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ERVK-5Q9HDB9 TMEM117-201ENST00000266534 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ERVK-5Q9HDB9 ZFPM2-201ENST00000407775 4700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ERVK-5Q9HDB9 FER1L4-210ENST00000615531 5998 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
ERVK-5Q9HDB9 MOCS1-201ENST00000340692 2747 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ERVK-5Q9HDB9 ZNF84-201ENST00000327668 7162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ERVK-5Q9HDB9 SLC26A10-201ENST00000320442 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ERVK-5Q9HDB9 NEDD4L-202ENST00000356462 3335 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ERVK-5Q9HDB9 TMEM139-201ENST00000359333 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ERVK-5Q9HDB9 CAP2-206ENST00000489374 1430 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ERVK-5Q9HDB9 ZNF30-202ENST00000439785 2651 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ERVK-5Q9HDB9 STMN1-203ENST00000399728 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ERVK-5Q9HDB9 TNIP1-219ENST00000524280 1716 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ERVK-5Q9HDB9 CCDC40-202ENST00000374876 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ERVK-5Q9HDB9 AZGP1-202ENST00000411734 2027 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ERVK-5Q9HDB9 AL157414.3-201ENST00000624276 1954 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
ERVK-5Q9HDB9 PIDD1-202ENST00000411829 2886 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ERVK-5Q9HDB9 IL9R-201ENST00000244174 1944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ERVK-5Q9HDB9 F11R-206ENST00000621309 4770 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ERVK-5Q9HDB9 ANKRD42-208ENST00000531895 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ERVK-5Q9HDB9 SLC18A2-201ENST00000298472 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ERVK-5Q9HDB9 POLD4-201ENST00000312419 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ERVK-5Q9HDB9 FAM24B-202ENST00000368898 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ERVK-5Q9HDB9 AL136309.1-201ENST00000403917 691 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
ERVK-5Q9HDB9 SLC25A24P2-201ENST00000415059 510 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
ERVK-5Q9HDB9 GHSR-202ENST00000427970 912 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
ERVK-5Q9HDB9 AC005077.2-201ENST00000449786 690 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
ERVK-5Q9HDB9 AC007406.3-201ENST00000537295 1063 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ERVK-5Q9HDB9 PPP1R32-205ENST00000538185 1107 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ERVK-5Q9HDB9 NDUFC1-210ENST00000539387 725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ERVK-5Q9HDB9 AC005865.1-202ENST00000543036 641 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ERVK-5Q9HDB9 AC007663.3-201ENST00000609632 465 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
ERVK-5Q9HDB9 STPG3-204ENST00000611378 1015 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ERVK-5Q9HDB9 AL021578.1-201ENST00000613646 709 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
ERVK-5Q9HDB9 CNBP-208ENST00000504813 1549 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ERVK-5Q9HDB9 FMR1-203ENST00000370470 1774 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ERVK-5Q9HDB9 ABHD18-206ENST00000611882 1493 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ERVK-5Q9HDB9 ATP2A3-205ENST00000397041 4675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ERVK-5Q9HDB9 TAOK3-201ENST00000392533 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.3 ms