Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0F1

CEP44, Centrosomal protein of 44 kDa, humanhuman

Predictions only

Length 390 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CEP44Q9C0F1 AC025048.1-201ENST00000592317 542 ntTSL 4 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CEP44Q9C0F1 SELPLG-201ENST00000228463 1704 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CEP44Q9C0F1 NEURL1-201ENST00000369780 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CEP44Q9C0F1 POMP-201ENST00000380842 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CEP44Q9C0F1 HTR4-209ENST00000521530 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CEP44Q9C0F1 C19orf68-203ENST00000614654 3588 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CEP44Q9C0F1 ZNF516-201ENST00000443185 8118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CEP44Q9C0F1 KRT71-201ENST00000267119 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CEP44Q9C0F1 SLC6A2-204ENST00000561820 2268 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CEP44Q9C0F1 PCBP2-202ENST00000359462 1814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CEP44Q9C0F1 CRCP-201ENST00000338592 1393 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CEP44Q9C0F1 MPP1-204ENST00000393531 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CEP44Q9C0F1 ATP6V0A1-204ENST00000537728 2774 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CEP44Q9C0F1 ACOX3-202ENST00000413009 2374 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CEP44Q9C0F1 FBXL5-201ENST00000341285 3385 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CEP44Q9C0F1 ARFGAP2-202ENST00000426335 2937 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CEP44Q9C0F1 NCKIPSD-201ENST00000294129 2989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CEP44Q9C0F1 LINC00937-207ENST00000544461 3033 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CEP44Q9C0F1 SPATA33-210ENST00000611218 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CEP44Q9C0F1 PTBP1-202ENST00000350092 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CEP44Q9C0F1 APBB1-219ENST00000608704 2095 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CEP44Q9C0F1 MAGEA8-204ENST00000535454 2112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CEP44Q9C0F1 MLF1-216ENST00000618075 2116 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CEP44Q9C0F1 NOTO-201ENST00000398468 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CEP44Q9C0F1 KCNJ2-202ENST00000535240 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CEP44Q9C0F1 FADS1-201ENST00000350997 4525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CEP44Q9C0F1 TPD52L2-205ENST00000352482 2339 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CEP44Q9C0F1 TPD52L2-210ENST00000615907 2310 ntTSL 4 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CEP44Q9C0F1 OPCML-IT1-201ENST00000533859 2936 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CEP44Q9C0F1 TLE3-215ENST00000559048 2918 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CEP44Q9C0F1 FAM219A-204ENST00000379081 3543 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CEP44Q9C0F1 ZMYND10-202ENST00000360165 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CEP44Q9C0F1 ITSN1-205ENST00000381291 5437 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CEP44Q9C0F1 ANKRD42-208ENST00000531895 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CEP44Q9C0F1 RASAL1-207ENST00000548055 2502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CEP44Q9C0F1 AC005899.8-201ENST00000625127 3153 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CEP44Q9C0F1 IGLV2-23-201ENST00000390306 502 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CEP44Q9C0F1 GPR17-202ENST00000393018 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CEP44Q9C0F1 MIR1202-201ENST00000408529 83 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
CEP44Q9C0F1 FAM8A4P-201ENST00000435433 1213 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
CEP44Q9C0F1 AC113608.2-201ENST00000448379 487 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CEP44Q9C0F1 PRPS2-205ENST00000489404 763 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CEP44Q9C0F1 PFN2-215ENST00000497148 743 ntTSL 4 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CEP44Q9C0F1 FTLP10-202ENST00000505798 471 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
CEP44Q9C0F1 AL583810.1-201ENST00000553344 1045 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
CEP44Q9C0F1 XRCC3-210ENST00000554974 575 ntTSL 4 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CEP44Q9C0F1 GLIS2-AS1-201ENST00000576080 340 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CEP44Q9C0F1 TECR-207ENST00000596073 1170 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CEP44Q9C0F1 TECR-220ENST00000600083 1204 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CEP44Q9C0F1 PSMD14-201ENST00000409682 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CEP44Q9C0F1 TUBB1P2-201ENST00000422712 1306 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
CEP44Q9C0F1 AC099850.1-201ENST00000451775 1338 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CEP44Q9C0F1 TUBB1P1-201ENST00000503144 1300 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
CEP44Q9C0F1 EIF2S2-201ENST00000374980 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CEP44Q9C0F1 AC138035.3-201ENST00000622706 2791 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
CEP44Q9C0F1 RPP40-202ENST00000380051 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CEP44Q9C0F1 INPP5D-201ENST00000359570 5274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CEP44Q9C0F1 CNPY1-203ENST00000636372 2259 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CEP44Q9C0F1 CPT2-201ENST00000371486 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CEP44Q9C0F1 MAPK7-204ENST00000395604 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CEP44Q9C0F1 DSE-202ENST00000359564 4037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CEP44Q9C0F1 HLA-DQB1-205ENST00000434651 1642 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CEP44Q9C0F1 MARCKS-201ENST00000612661 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CEP44Q9C0F1 ATP6V1B2-201ENST00000276390 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CEP44Q9C0F1 RNASEH2B-202ENST00000422660 4830 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CEP44Q9C0F1 C9orf139-202ENST00000623196 4990 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CEP44Q9C0F1 EFCAB2-202ENST00000366522 6167 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CEP44Q9C0F1 UNC13B-201ENST00000378495 6303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CEP44Q9C0F1 CUX1-211ENST00000546411 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CEP44Q9C0F1 PDP1-201ENST00000297598 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CEP44Q9C0F1 JPH4-201ENST00000356300 4278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CEP44Q9C0F1 OSBP2-201ENST00000332585 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CEP44Q9C0F1 SPEG-205ENST00000396698 3379 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CEP44Q9C0F1 SBF1P1-201ENST00000444527 5631 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
CEP44Q9C0F1 USP19-203ENST00000398892 4622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CEP44Q9C0F1 PLXDC1-201ENST00000315392 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CEP44Q9C0F1 SPDYE7P-201ENST00000355920 1064 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CEP44Q9C0F1 ROPN1-202ENST00000405845 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CEP44Q9C0F1 ZNF815P-202ENST00000422825 805 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CEP44Q9C0F1 ADAMTSL1-210ENST00000431052 824 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CEP44Q9C0F1 AC007274.1-201ENST00000439805 662 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
CEP44Q9C0F1 DERL3-208ENST00000476077 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CEP44Q9C0F1 AP001790.1-201ENST00000511947 570 ntTSL 4 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CEP44Q9C0F1 MAP1LC3B2-202ENST00000556529 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CEP44Q9C0F1 AC135178.3-201ENST00000583963 531 ntTSL 4 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CEP44Q9C0F1 SLC35G4-201ENST00000588001 1017 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CEP44Q9C0F1 AC138466.3-201ENST00000619983 221 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
CEP44Q9C0F1 HAND2-AS1-202ENST00000502896 5278 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CEP44Q9C0F1 CLUHP2-201ENST00000426660 1303 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
CEP44Q9C0F1 PRG2-202ENST00000525955 1367 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CEP44Q9C0F1 ANKMY1-207ENST00000403283 2874 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CEP44Q9C0F1 LEF1-216ENST00000510624 1472 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CEP44Q9C0F1 LINC00593-202ENST00000560853 1483 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CEP44Q9C0F1 PPP2R5D-206ENST00000472118 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CEP44Q9C0F1 TVP23C-210ENST00000584811 2989 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CEP44Q9C0F1 ABLIM3-206ENST00000506113 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CEP44Q9C0F1 MAPK13-203ENST00000373766 6196 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CEP44Q9C0F1 PLPP3-201ENST00000371250 3292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CEP44Q9C0F1 VRK3-207ENST00000594092 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CEP44Q9C0F1 GCLC-201ENST00000229416 3813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.4 ms