Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0C6

CIPC, CLOCK-interacting pacemaker, humanhuman

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Length 399 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CIPCQ9C0C6 AL162457.2-202ENST00000442888 679 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CIPCQ9C0C6 FTLP10-202ENST00000505798 471 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
CIPCQ9C0C6 KCNK16-205ENST00000507712 889 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CIPCQ9C0C6 AC090735.1-201ENST00000523881 488 ntTSL 4 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CIPCQ9C0C6 CHRNA5-203ENST00000559554 1051 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CIPCQ9C0C6 DUX4L47-201ENST00000566374 394 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
CIPCQ9C0C6 AC129510.1-201ENST00000579979 555 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CIPCQ9C0C6 MIR3615-201ENST00000581999 87 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
CIPCQ9C0C6 AC103810.3-201ENST00000583567 96 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
CIPCQ9C0C6 AC008403.1-201ENST00000595676 443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CIPCQ9C0C6 OCEL1-213ENST00000601529 942 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CIPCQ9C0C6 AL096828.3-201ENST00000615354 462 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
CIPCQ9C0C6 ASAH1-221ENST00000636128 1608 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CIPCQ9C0C6 TLE3-223ENST00000560939 3021 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CIPCQ9C0C6 GUCD1-206ENST00000435822 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CIPCQ9C0C6 PLPP3-201ENST00000371250 3292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CIPCQ9C0C6 CNDP1-201ENST00000358821 2215 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CIPCQ9C0C6 AQP6-204ENST00000615425 2245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CIPCQ9C0C6 HSD17B6-206ENST00000555159 1525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CIPCQ9C0C6 COL11A2-203ENST00000374708 6209 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CIPCQ9C0C6 PXN-201ENST00000228307 3785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CIPCQ9C0C6 SUPT20H-201ENST00000350612 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CIPCQ9C0C6 MRPS7-201ENST00000245539 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CIPCQ9C0C6 DMTN-204ENST00000415253 2394 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CIPCQ9C0C6 SLC12A8-207ENST00000469902 2989 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CIPCQ9C0C6 ABCG5-202ENST00000405322 2896 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CIPCQ9C0C6 FURIN-207ENST00000618099 4345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CIPCQ9C0C6 AC010642.2-201ENST00000634676 2413 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CIPCQ9C0C6 PLEKHB2-207ENST00000438882 1460 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CIPCQ9C0C6 LINGO1-201ENST00000355300 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CIPCQ9C0C6 TNIP1-219ENST00000524280 1716 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CIPCQ9C0C6 MAGI1-216ENST00000497477 3555 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CIPCQ9C0C6 DRC3-216ENST00000584166 1953 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CIPCQ9C0C6 SPIN3-224ENST00000639583 2245 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CIPCQ9C0C6 EPS8L2-218ENST00000530636 2469 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CIPCQ9C0C6 DCBLD1-202ENST00000338728 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CIPCQ9C0C6 SPN-201ENST00000360121 6894 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CIPCQ9C0C6 PAK1-210ENST00000528203 1878 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CIPCQ9C0C6 CCDC68-204ENST00000591504 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CIPCQ9C0C6 HOXA3-202ENST00000396352 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CIPCQ9C0C6 CMTM3-203ENST00000460097 1797 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CIPCQ9C0C6 CHTF18-205ENST00000455171 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CIPCQ9C0C6 TBX10-201ENST00000335385 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CIPCQ9C0C6 HNRNPK-204ENST00000376263 2942 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CIPCQ9C0C6 NEU2-201ENST00000233840 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CIPCQ9C0C6 MUC1-202ENST00000338684 1107 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CIPCQ9C0C6 PSTK-202ENST00000405485 1047 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CIPCQ9C0C6 TISP43-201ENST00000409793 538 ntTSL 4 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CIPCQ9C0C6 GPAA1P2-201ENST00000417923 928 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
CIPCQ9C0C6 PRKG1-AS1-201ENST00000420193 971 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CIPCQ9C0C6 AC079178.1-201ENST00000420915 656 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
CIPCQ9C0C6 LINC01694-201ENST00000424569 821 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CIPCQ9C0C6 AL451065.1-201ENST00000428958 238 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CIPCQ9C0C6 C9orf116-205ENST00000429260 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CIPCQ9C0C6 AL355994.3-201ENST00000437156 466 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CIPCQ9C0C6 AC004471.1-201ENST00000456035 582 ntTSL 4 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CIPCQ9C0C6 MUC1-218ENST00000471283 635 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CIPCQ9C0C6 AC100818.1-201ENST00000524167 563 ntTSL 4 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CIPCQ9C0C6 AP001258.2-201ENST00000529891 490 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
CIPCQ9C0C6 CCKBR-204ENST00000531712 463 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CIPCQ9C0C6 AC007342.4-201ENST00000566383 584 ntTSL 4 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CIPCQ9C0C6 AC073413.1-201ENST00000603927 732 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
CIPCQ9C0C6 AC138466.3-201ENST00000619983 221 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
CIPCQ9C0C6 FUT3-209ENST00000589918 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CIPCQ9C0C6 GRID2IP-201ENST00000435185 3215 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CIPCQ9C0C6 SEMA3B-212ENST00000616701 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CIPCQ9C0C6 INPP5B-202ENST00000373023 4694 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CIPCQ9C0C6 ECE1-204ENST00000415912 5099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CIPCQ9C0C6 RNF182-206ENST00000537388 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CIPCQ9C0C6 IL6ST-209ENST00000502326 3007 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CIPCQ9C0C6 SLC26A10-201ENST00000320442 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CIPCQ9C0C6 GRN-222ENST00000639447 1314 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CIPCQ9C0C6 MDFIC-202ENST00000393486 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CIPCQ9C0C6 MAGEA8-204ENST00000535454 2112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CIPCQ9C0C6 LINC01270-201ENST00000371639 2281 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CIPCQ9C0C6 MKNK2-201ENST00000250896 3774 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CIPCQ9C0C6 RPA3-201ENST00000223129 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CIPCQ9C0C6 OIT3-202ENST00000622652 1602 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CIPCQ9C0C6 EGLN3-201ENST00000250457 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CIPCQ9C0C6 TDRP-205ENST00000613071 3421 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CIPCQ9C0C6 SPHK2-202ENST00000340932 2492 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CIPCQ9C0C6 PPL-201ENST00000345988 6238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CIPCQ9C0C6 AC126365.1-201ENST00000578585 1514 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
CIPCQ9C0C6 RBPJ-205ENST00000355476 5990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CIPCQ9C0C6 PAK6-203ENST00000542403 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CIPCQ9C0C6 EIF4EBP3-201ENST00000310331 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CIPCQ9C0C6 NOSIP-201ENST00000339093 1000 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CIPCQ9C0C6 CFLAR-203ENST00000341222 1283 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CIPCQ9C0C6 RHOC-206ENST00000369637 888 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CIPCQ9C0C6 NDUFAB1P1-201ENST00000404262 460 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
CIPCQ9C0C6 MCFD2-204ENST00000409207 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CIPCQ9C0C6 IQCF3-203ENST00000444293 450 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CIPCQ9C0C6 RPL23A-206ENST00000496182 636 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CIPCQ9C0C6 SELENOW-201ENST00000509570 881 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CIPCQ9C0C6 AURKB-202ENST00000534871 1167 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CIPCQ9C0C6 AL021546.1-201ENST00000551806 552 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CIPCQ9C0C6 AC106820.3-201ENST00000561653 397 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
CIPCQ9C0C6 AP005329.1-201ENST00000578800 1035 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CIPCQ9C0C6 PRCD-204ENST00000586148 630 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CIPCQ9C0C6 ZACNP1-201ENST00000612259 710 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
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