Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZS1

FOXP3, Forkhead box protein P3, humanhuman

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Length 431 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXP3Q9BZS1 TP73-209ENST00000603362 1668 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
FOXP3Q9BZS1 PHAX-201ENST00000297540 4288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
FOXP3Q9BZS1 CIART-203ENST00000369095 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
FOXP3Q9BZS1 GAL3ST4-202ENST00000411994 1404 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
FOXP3Q9BZS1 ZNF398-205ENST00000491174 2232 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
FOXP3Q9BZS1 STUM-202ENST00000366789 4093 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
FOXP3Q9BZS1 ENAH-203ENST00000366843 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
FOXP3Q9BZS1 PLTP-201ENST00000354050 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
FOXP3Q9BZS1 BAIAP2-220ENST00000575712 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
FOXP3Q9BZS1 APOLD1-201ENST00000326765 4724 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
FOXP3Q9BZS1 SLC13A5-203ENST00000433363 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
FOXP3Q9BZS1 ADI1-201ENST00000327435 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
FOXP3Q9BZS1 DNAJA1-201ENST00000330899 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
FOXP3Q9BZS1 AMT-202ENST00000395338 1831 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
FOXP3Q9BZS1 SRPX-206ENST00000544439 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
FOXP3Q9BZS1 NCKAP5L-201ENST00000335999 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
FOXP3Q9BZS1 ABTB2-201ENST00000435224 4902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
FOXP3Q9BZS1 RUNDC1-201ENST00000361677 3828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
FOXP3Q9BZS1 AC098614.1-201ENST00000368528 745 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
FOXP3Q9BZS1 CCL25-203ENST00000390669 924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
FOXP3Q9BZS1 AC087499.6-201ENST00000411576 835 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
FOXP3Q9BZS1 AP006294.1-201ENST00000415407 339 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
FOXP3Q9BZS1 ARSEP1-201ENST00000420443 635 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
FOXP3Q9BZS1 TEX48-201ENST00000436752 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
FOXP3Q9BZS1 RN7SL752P-201ENST00000463779 287 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
FOXP3Q9BZS1 MRNIP-212ENST00000520698 902 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
FOXP3Q9BZS1 FAM92A-214ENST00000522324 1072 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
FOXP3Q9BZS1 CSF1R-209ENST00000543093 921 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
FOXP3Q9BZS1 ATP6V0A2-207ENST00000544833 1013 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
FOXP3Q9BZS1 AC000095.1-201ENST00000603208 874 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
FOXP3Q9BZS1 GNRHR2-204ENST00000604273 1078 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
FOXP3Q9BZS1 TEX48-202ENST00000612244 662 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
FOXP3Q9BZS1 EBAG9-209ENST00000614147 1179 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
FOXP3Q9BZS1 IGHV3-72-202ENST00000621503 303 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
FOXP3Q9BZS1 AC007431.3-201ENST00000623221 587 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
FOXP3Q9BZS1 AC105277.1-203ENST00000635492 1293 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
FOXP3Q9BZS1 C11orf53-203ENST00000637637 1049 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
FOXP3Q9BZS1 USP10-201ENST00000219473 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
FOXP3Q9BZS1 ACE-201ENST00000290863 2479 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
FOXP3Q9BZS1 CLCNKA-201ENST00000331433 2475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
FOXP3Q9BZS1 LINC01301-205ENST00000531654 1347 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
FOXP3Q9BZS1 MAPT-215ENST00000574436 1326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
FOXP3Q9BZS1 OIT3-202ENST00000622652 1602 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
FOXP3Q9BZS1 TNIP1-214ENST00000522226 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
FOXP3Q9BZS1 LINC01138-206ENST00000622328 2212 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
FOXP3Q9BZS1 MICAL1-201ENST00000358577 3142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
FOXP3Q9BZS1 PPP1R13L-202ENST00000418234 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
FOXP3Q9BZS1 AC018665.1-201ENST00000622927 1362 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
FOXP3Q9BZS1 FAM186B-201ENST00000257894 2944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
FOXP3Q9BZS1 MPP6-201ENST00000222644 8452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
FOXP3Q9BZS1 GLIPR1L2-204ENST00000550916 2609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
FOXP3Q9BZS1 SLC4A8-204ENST00000514353 3041 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
FOXP3Q9BZS1 PRMT7-203ENST00000449359 2091 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
FOXP3Q9BZS1 AKAP12-201ENST00000253332 6597 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
FOXP3Q9BZS1 RNF166-210ENST00000568683 1768 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
FOXP3Q9BZS1 ICA1-207ENST00000406470 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
FOXP3Q9BZS1 CUX1-214ENST00000550008 4350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
FOXP3Q9BZS1 TMCC2-202ENST00000330675 2780 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
FOXP3Q9BZS1 OSBPL5-202ENST00000348039 2798 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
FOXP3Q9BZS1 AKAP2-203ENST00000434623 4400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
FOXP3Q9BZS1 OSBPL7-211ENST00000613735 2836 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
FOXP3Q9BZS1 KIF1BP-214ENST00000638119 2537 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
FOXP3Q9BZS1 NUP50-201ENST00000347635 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
FOXP3Q9BZS1 SIGLECL1-208ENST00000614422 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
FOXP3Q9BZS1 NATD1-201ENST00000611551 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
FOXP3Q9BZS1 MSI2-202ENST00000322684 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
FOXP3Q9BZS1 C20orf166-AS1-203ENST00000475015 2585 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
FOXP3Q9BZS1 NCK1-201ENST00000288986 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
FOXP3Q9BZS1 RADIL-201ENST00000399583 3689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
FOXP3Q9BZS1 TCEAL4-209ENST00000472745 1571 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
FOXP3Q9BZS1 ERLIN2-205ENST00000518586 2623 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
FOXP3Q9BZS1 RNF123-202ENST00000432042 2670 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
FOXP3Q9BZS1 RPS5-201ENST00000196551 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
FOXP3Q9BZS1 PQLC2L-201ENST00000312275 1201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
FOXP3Q9BZS1 ZDHHC12-201ENST00000372663 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
FOXP3Q9BZS1 CD164L2-203ENST00000374030 993 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
FOXP3Q9BZS1 RAC2-203ENST00000405484 842 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
FOXP3Q9BZS1 VAT1-202ENST00000420567 1069 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
FOXP3Q9BZS1 AL669970.3-201ENST00000435284 428 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
FOXP3Q9BZS1 AC124944.1-201ENST00000448113 625 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
FOXP3Q9BZS1 CD81-207ENST00000481687 890 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
FOXP3Q9BZS1 GIMAP3P-201ENST00000495150 836 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
FOXP3Q9BZS1 AC113383.1-201ENST00000514696 582 ntTSL 4 BASIC15.59■□□□□ 0.09
FOXP3Q9BZS1 MRNIP-220ENST00000523084 1096 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
FOXP3Q9BZS1 AP001107.3-201ENST00000534065 544 ntTSL 4 BASIC15.59■□□□□ 0.09
FOXP3Q9BZS1 ZSCAN2-213ENST00000541040 965 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
FOXP3Q9BZS1 HILS1-202ENST00000545329 423 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
FOXP3Q9BZS1 POLE2-203ENST00000553805 496 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
FOXP3Q9BZS1 TRAPPC2L-206ENST00000564365 1060 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
FOXP3Q9BZS1 AC016727.1-204ENST00000578974 420 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
FOXP3Q9BZS1 AC132938.2-201ENST00000579188 680 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
FOXP3Q9BZS1 KLK15-203ENST00000596931 692 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
FOXP3Q9BZS1 AC074044.1-201ENST00000609673 707 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
FOXP3Q9BZS1 AL591163.1-201ENST00000641757 987 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
FOXP3Q9BZS1 SLC39A9-209ENST00000556605 2065 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
FOXP3Q9BZS1 ATG4B-206ENST00000405546 3294 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
FOXP3Q9BZS1 AC023632.2-201ENST00000523011 1789 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
FOXP3Q9BZS1 PKN1-202ENST00000342216 2960 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
FOXP3Q9BZS1 PIGT-202ENST00000279036 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
FOXP3Q9BZS1 ECHDC1-220ENST00000528402 1449 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
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