Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYR4

KRTAP4-3, Keratin-associated protein 4-3, humanhuman

Predictions only

Length 195 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP4-3Q9BYR4 ATXN7-213ENST00000538065 6842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
KRTAP4-3Q9BYR4 LILRP1-201ENST00000444199 1370 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
KRTAP4-3Q9BYR4 PSMC3-212ENST00000602866 1373 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
KRTAP4-3Q9BYR4 ZNF286A-204ENST00000464847 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
KRTAP4-3Q9BYR4 MRPS7-201ENST00000245539 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
KRTAP4-3Q9BYR4 SLC25A32-201ENST00000297578 2891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
KRTAP4-3Q9BYR4 ZNF7-207ENST00000528372 2905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
KRTAP4-3Q9BYR4 RIMS1-213ENST00000517960 4428 ntTSL 5 BASIC5.11□□□□□ -1.59
KRTAP4-3Q9BYR4 RIMS1-215ENST00000520567 4442 ntTSL 5 BASIC5.11□□□□□ -1.59
KRTAP4-3Q9BYR4 EPB41L4A-AS1-201ENST00000413221 2969 ntTSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
KRTAP4-3Q9BYR4 PERM1-201ENST00000341290 3035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.11□□□□□ -1.59
KRTAP4-3Q9BYR4 PDHB-206ENST00000474765 1503 ntTSL 5 BASIC5.11□□□□□ -1.59
KRTAP4-3Q9BYR4 AC015818.8-201ENST00000587907 1519 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
KRTAP4-3Q9BYR4 AC018529.2-202ENST00000611482 3087 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
KRTAP4-3Q9BYR4 HNRNPU-201ENST00000283179 3120 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.11□□□□□ -1.59
KRTAP4-3Q9BYR4 LYAR-201ENST00000343470 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
KRTAP4-3Q9BYR4 KCNT1-202ENST00000371757 4717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
KRTAP4-3Q9BYR4 PTBP1-204ENST00000394601 3185 ntTSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
KRTAP4-3Q9BYR4 TMPRSS6-204ENST00000406856 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
KRTAP4-3Q9BYR4 AC027796.3-201ENST00000572919 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.11□□□□□ -1.59
KRTAP4-3Q9BYR4 TMPRSS4-214ENST00000523251 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.11□□□□□ -1.59
KRTAP4-3Q9BYR4 SLC35A1-202ENST00000369556 1720 ntTSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
KRTAP4-3Q9BYR4 GLG1-203ENST00000447066 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.11□□□□□ -1.59
KRTAP4-3Q9BYR4 CYP11A1-201ENST00000268053 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
KRTAP4-3Q9BYR4 C11orf16-201ENST00000326053 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
KRTAP4-3Q9BYR4 ACTL6A-202ENST00000429709 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
KRTAP4-3Q9BYR4 SHMT2-232ENST00000557487 1918 ntTSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
KRTAP4-3Q9BYR4 APBB1-217ENST00000608645 1925 ntTSL 5 BASIC5.11□□□□□ -1.59
KRTAP4-3Q9BYR4 SATB1-201ENST00000338745 7810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
KRTAP4-3Q9BYR4 CDC25C-207ENST00000513970 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.11□□□□□ -1.59
KRTAP4-3Q9BYR4 DRC3-216ENST00000584166 1953 ntTSL 5 BASIC5.11□□□□□ -1.59
KRTAP4-3Q9BYR4 IQCF5-AS1-201ENST00000440723 2000 ntTSL 2 BASIC5.11□□□□□ -1.59
KRTAP4-3Q9BYR4 RTKN-202ENST00000272430 2142 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
KRTAP4-3Q9BYR4 NAALADL1-203ENST00000356632 2118 ntTSL 5 BASIC5.11□□□□□ -1.59
KRTAP4-3Q9BYR4 LYPD5-202ENST00000414615 2137 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC5.11□□□□□ -1.59
KRTAP4-3Q9BYR4 SLC29A1-209ENST00000427851 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
KRTAP4-3Q9BYR4 PNPLA5-204ENST00000593866 2197 ntTSL 2 BASIC5.11□□□□□ -1.59
KRTAP4-3Q9BYR4 HEY1-202ENST00000354724 2293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
KRTAP4-3Q9BYR4 EID1-201ENST00000530028 2298 ntAPPRIS P1 BASIC5.11□□□□□ -1.59
KRTAP4-3Q9BYR4 OGFOD2-202ENST00000397389 2308 ntTSL 2 BASIC5.11□□□□□ -1.59
KRTAP4-3Q9BYR4 PLCB1-201ENST00000338037 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
KRTAP4-3Q9BYR4 DHODH-201ENST00000219240 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
KRTAP4-3Q9BYR4 FAM189A2-201ENST00000257515 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
KRTAP4-3Q9BYR4 NDUFA11-202ENST00000418389 2406 ntTSL 2 BASIC5.11□□□□□ -1.59
KRTAP4-3Q9BYR4 ITGA3-202ENST00000320031 4888 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
KRTAP4-3Q9BYR4 ADGRB2-206ENST00000398556 4879 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.11□□□□□ -1.59
KRTAP4-3Q9BYR4 ORAOV1-201ENST00000279147 2478 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
KRTAP4-3Q9BYR4 ACSL1-208ENST00000507295 2490 ntTSL 2 BASIC5.11□□□□□ -1.59
KRTAP4-3Q9BYR4 ANXA6-215ENST00000523714 2451 ntTSL 2 BASIC5.11□□□□□ -1.59
KRTAP4-3Q9BYR4 AC092384.2-204ENST00000565053 2566 ntTSL 2 BASIC5.1□□□□□ -1.59
KRTAP4-3Q9BYR4 RCOR2-201ENST00000301459 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.1□□□□□ -1.59
KRTAP4-3Q9BYR4 ZNF354B-201ENST00000322434 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.1□□□□□ -1.59
KRTAP4-3Q9BYR4 EP400-203ENST00000333577 3092 ntTSL 1 (best) BASIC5.1□□□□□ -1.59
KRTAP4-3Q9BYR4 ZBTB7B-207ENST00000535420 3777 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.1□□□□□ -1.59
KRTAP4-3Q9BYR4 TMTC1-207ENST00000552618 3915 ntTSL 5 BASIC5.1□□□□□ -1.59
KRTAP4-3Q9BYR4 TP53INP2-201ENST00000374809 4018 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.1□□□□□ -1.59
KRTAP4-3Q9BYR4 RAD23B-201ENST00000358015 4119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.1□□□□□ -1.59
KRTAP4-3Q9BYR4 IPPK-201ENST00000287996 4401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.1□□□□□ -1.59
KRTAP4-3Q9BYR4 SMIM13-202ENST00000416247 4688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.1□□□□□ -1.59
KRTAP4-3Q9BYR4 AP3D1-201ENST00000345016 4870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.1□□□□□ -1.59
KRTAP4-3Q9BYR4 TBC1D9B-201ENST00000355235 5119 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.1□□□□□ -1.59
KRTAP4-3Q9BYR4 KAZN-203ENST00000376030 6030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.1□□□□□ -1.59
KRTAP4-3Q9BYR4 ASNS-201ENST00000175506 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.1□□□□□ -1.59
KRTAP4-3Q9BYR4 GCLC-201ENST00000229416 3813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.1□□□□□ -1.59
KRTAP4-3Q9BYR4 CARD10-201ENST00000251973 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.1□□□□□ -1.59
KRTAP4-3Q9BYR4 EIF3G-201ENST00000253108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.1□□□□□ -1.59
KRTAP4-3Q9BYR4 RIPK1-201ENST00000259808 4160 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.1□□□□□ -1.59
KRTAP4-3Q9BYR4 TRPV4-201ENST00000261740 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.1□□□□□ -1.59
KRTAP4-3Q9BYR4 TMEM115-201ENST00000266025 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.1□□□□□ -1.59
KRTAP4-3Q9BYR4 TNFRSF11A-201ENST00000269485 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.1□□□□□ -1.59
KRTAP4-3Q9BYR4 ADM-201ENST00000278175 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.1□□□□□ -1.59
KRTAP4-3Q9BYR4 COX11-201ENST00000299335 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.1□□□□□ -1.59
KRTAP4-3Q9BYR4 SDHAF2-201ENST00000301761 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.1□□□□□ -1.59
KRTAP4-3Q9BYR4 CCDC88B-201ENST00000301897 870 ntTSL 1 (best) BASIC5.1□□□□□ -1.59
KRTAP4-3Q9BYR4 BRD3-201ENST00000303407 5652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.1□□□□□ -1.59
KRTAP4-3Q9BYR4 GOLGA6L2-201ENST00000312015 1379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.1□□□□□ -1.59
KRTAP4-3Q9BYR4 PGA5-201ENST00000312403 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.1□□□□□ -1.59
KRTAP4-3Q9BYR4 PPP1CA-201ENST00000312989 1389 ntTSL 1 (best) BASIC5.1□□□□□ -1.59
KRTAP4-3Q9BYR4 LSM10-201ENST00000315732 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.1□□□□□ -1.59
KRTAP4-3Q9BYR4 SDCCAG3P2-201ENST00000326105 1023 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
KRTAP4-3Q9BYR4 CNOT10-201ENST00000328834 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.1□□□□□ -1.59
KRTAP4-3Q9BYR4 C6orf120-201ENST00000332290 2667 ntAPPRIS P1 BASIC5.1□□□□□ -1.59
KRTAP4-3Q9BYR4 YIPF7-201ENST00000332990 937 ntTSL 5 BASIC5.1□□□□□ -1.59
KRTAP4-3Q9BYR4 TAS1R1-201ENST00000333172 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.1□□□□□ -1.59
KRTAP4-3Q9BYR4 B4GALNT1-201ENST00000341156 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.1□□□□□ -1.59
KRTAP4-3Q9BYR4 FXYD3-202ENST00000346446 1320 ntTSL 2 BASIC5.1□□□□□ -1.59
KRTAP4-3Q9BYR4 ANAPC11-202ENST00000357385 881 ntTSL 1 (best) BASIC5.1□□□□□ -1.59
KRTAP4-3Q9BYR4 C17orf80-203ENST00000359042 3645 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.1□□□□□ -1.59
KRTAP4-3Q9BYR4 CXorf40A-201ENST00000359293 974 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC5.1□□□□□ -1.59
KRTAP4-3Q9BYR4 WDR3-202ENST00000369441 1035 ntTSL 1 (best) BASIC5.1□□□□□ -1.59
KRTAP4-3Q9BYR4 APCDD1L-201ENST00000371149 3426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.1□□□□□ -1.59
KRTAP4-3Q9BYR4 PODN-202ENST00000371500 3287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.1□□□□□ -1.59
KRTAP4-3Q9BYR4 UBXN11-207ENST00000374223 1312 ntTSL 1 (best) BASIC5.1□□□□□ -1.59
KRTAP4-3Q9BYR4 AGPAT1-202ENST00000375104 2017 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.1□□□□□ -1.59
KRTAP4-3Q9BYR4 FGD1-201ENST00000375135 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.1□□□□□ -1.59
KRTAP4-3Q9BYR4 MBTD1-201ENST00000376381 1420 ntTSL 1 (best) BASIC5.1□□□□□ -1.59
KRTAP4-3Q9BYR4 TMEM52-203ENST00000378602 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.1□□□□□ -1.59
KRTAP4-3Q9BYR4 SMS-201ENST00000379404 1174 ntTSL 3 BASIC5.1□□□□□ -1.59
KRTAP4-3Q9BYR4 VCX3B-201ENST00000381029 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.1□□□□□ -1.59
KRTAP4-3Q9BYR4 METTL6-201ENST00000383789 1413 ntTSL 2 BASIC5.1□□□□□ -1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.2 ms