Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYE7

PCGF6, Polycomb group RING finger protein 6, humanhuman

Predictions only

Length 350 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCGF6Q9BYE7 SEC24B-AS1-201ENST00000499359 957 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PCGF6Q9BYE7 SEC24B-AS1-204ENST00000510971 554 ntTSL 4 BASIC23.39■■□□□ 1.33
PCGF6Q9BYE7 AC009567.1-201ENST00000515071 525 ntTSL 4 BASIC23.39■■□□□ 1.33
PCGF6Q9BYE7 PCDHGC3-204ENST00000617222 731 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
PCGF6Q9BYE7 DHX16-202ENST00000376442 3445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PCGF6Q9BYE7 KRT74-203ENST00000549343 2858 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
PCGF6Q9BYE7 MKRN3-201ENST00000314520 2337 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.33
PCGF6Q9BYE7 JRK-210ENST00000614134 8932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PCGF6Q9BYE7 TGFB1I1-201ENST00000361773 1773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PCGF6Q9BYE7 AC023632.2-201ENST00000523011 1789 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
PCGF6Q9BYE7 TC2N-206ENST00000556018 1770 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
PCGF6Q9BYE7 ATE1-201ENST00000224652 4930 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PCGF6Q9BYE7 TM4SF19-203ENST00000446879 1582 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PCGF6Q9BYE7 IRF4-201ENST00000380956 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PCGF6Q9BYE7 PLAT-205ENST00000519510 2030 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PCGF6Q9BYE7 PRNP-203ENST00000430350 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PCGF6Q9BYE7 SNHG20-204ENST00000566583 1338 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PCGF6Q9BYE7 SLC4A7-214ENST00000455077 3775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PCGF6Q9BYE7 FARP2-201ENST00000264042 4051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PCGF6Q9BYE7 STRADA-243ENST00000640086 1925 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PCGF6Q9BYE7 CALCB-203ENST00000533448 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PCGF6Q9BYE7 DSCR3-204ENST00000399001 821 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PCGF6Q9BYE7 AC005281.1-201ENST00000433040 911 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PCGF6Q9BYE7 AP000347.1-202ENST00000435868 847 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
PCGF6Q9BYE7 C11orf74-203ENST00000446510 1062 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PCGF6Q9BYE7 KRT18P43-201ENST00000469825 1281 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
PCGF6Q9BYE7 AP002748.3-201ENST00000527092 828 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PCGF6Q9BYE7 AL589739.1-201ENST00000607720 493 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
PCGF6Q9BYE7 AL513210.1-201ENST00000629608 234 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
PCGF6Q9BYE7 CATSPERE-201ENST00000366531 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PCGF6Q9BYE7 GAL3ST4-202ENST00000411994 1404 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PCGF6Q9BYE7 KCNK9-203ENST00000520439 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PCGF6Q9BYE7 MVK-214ENST00000629016 1591 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PCGF6Q9BYE7 LINC00479-201ENST00000412102 2033 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PCGF6Q9BYE7 UNC13B-203ENST00000396787 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PCGF6Q9BYE7 PLXDC1-201ENST00000315392 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PCGF6Q9BYE7 CKM-201ENST00000221476 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PCGF6Q9BYE7 SAFB-211ENST00000592224 3014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PCGF6Q9BYE7 FAM129B-202ENST00000373314 3760 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PCGF6Q9BYE7 PADI2-202ENST00000375486 4345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PCGF6Q9BYE7 NLRP7-209ENST00000592784 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PCGF6Q9BYE7 ELAC1-201ENST00000269466 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PCGF6Q9BYE7 AC007603.1-201ENST00000563124 2085 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PCGF6Q9BYE7 SPOCK3-226ENST00000541354 2797 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PCGF6Q9BYE7 OPA1-208ENST00000392438 6340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PCGF6Q9BYE7 TSPEAR-AS2-202ENST00000354333 2422 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PCGF6Q9BYE7 TTC6-206ENST00000553443 5833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PCGF6Q9BYE7 NMU-201ENST00000264218 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PCGF6Q9BYE7 CABP2-201ENST00000294288 925 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PCGF6Q9BYE7 ASMT-201ENST00000381229 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PCGF6Q9BYE7 APCDD1L-AS1-201ENST00000420279 555 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PCGF6Q9BYE7 AC012184.2-203ENST00000443119 2110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PCGF6Q9BYE7 METTL6-204ENST00000450816 1221 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PCGF6Q9BYE7 CR559946.1-201ENST00000453835 531 ntTSL 4 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PCGF6Q9BYE7 AL390334.1-205ENST00000555797 411 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PCGF6Q9BYE7 LINC01128-208ENST00000608189 824 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PCGF6Q9BYE7 AC012366.1-201ENST00000615411 473 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PCGF6Q9BYE7 MCCC2-209ENST00000629193 1128 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PCGF6Q9BYE7 LRRFIP2-202ENST00000354379 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PCGF6Q9BYE7 PSIP1-204ENST00000380738 3364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PCGF6Q9BYE7 SUOX-208ENST00000548274 2352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PCGF6Q9BYE7 CNN1-202ENST00000535659 1527 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PCGF6Q9BYE7 AL035456.1-201ENST00000456064 1369 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
PCGF6Q9BYE7 ASNA1-204ENST00000591090 1368 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PCGF6Q9BYE7 IL11RA-215ENST00000602473 1388 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PCGF6Q9BYE7 PPM1F-203ENST00000407142 5587 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PCGF6Q9BYE7 ATG13-215ENST00000529655 2566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PCGF6Q9BYE7 IL20RA-207ENST00000541547 3382 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PCGF6Q9BYE7 ADGRE2-208ENST00000595839 2046 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PCGF6Q9BYE7 WNT7A-201ENST00000285018 4041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PCGF6Q9BYE7 CCDC47-201ENST00000225726 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PCGF6Q9BYE7 STAG3L2-201ENST00000426587 2130 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PCGF6Q9BYE7 B3GNT3-202ENST00000595387 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PCGF6Q9BYE7 TARS2-203ENST00000369054 1998 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PCGF6Q9BYE7 NAA60-203ENST00000414063 2619 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PCGF6Q9BYE7 ZNF619-201ENST00000314686 2233 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PCGF6Q9BYE7 SBF1P1-201ENST00000444527 5631 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
PCGF6Q9BYE7 MYD88-201ENST00000396334 2850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PCGF6Q9BYE7 CENPBD1-201ENST00000314994 2744 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PCGF6Q9BYE7 CIART-203ENST00000369095 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PCGF6Q9BYE7 GAK-214ENST00000511163 4280 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PCGF6Q9BYE7 CYP2E1-201ENST00000252945 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PCGF6Q9BYE7 CLCNKA-202ENST00000375692 2581 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PCGF6Q9BYE7 TMEM132E-203ENST00000631683 4379 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PCGF6Q9BYE7 RPL37AP1-201ENST00000412502 279 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
PCGF6Q9BYE7 TOMM22P5-201ENST00000416399 439 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
PCGF6Q9BYE7 SNHG17-203ENST00000417578 880 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PCGF6Q9BYE7 GRTP1-AS1-201ENST00000419199 867 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PCGF6Q9BYE7 AC108047.1-201ENST00000457407 404 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PCGF6Q9BYE7 AC009720.1-201ENST00000511867 586 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PCGF6Q9BYE7 WASHC3-213ENST00000545679 865 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PCGF6Q9BYE7 SDR39U1-212ENST00000555365 976 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PCGF6Q9BYE7 PLA2G15-209ENST00000566188 1203 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PCGF6Q9BYE7 GPR39-203ENST00000622084 900 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PCGF6Q9BYE7 GRM7-203ENST00000389336 2901 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PCGF6Q9BYE7 ECSIT-201ENST00000252440 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PCGF6Q9BYE7 FBLIM1-206ENST00000441801 1543 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PCGF6Q9BYE7 SLC22A20-202ENST00000525437 3196 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PCGF6Q9BYE7 DLL4-201ENST00000249749 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PCGF6Q9BYE7 JPH1-201ENST00000342232 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.8 ms