Protein–RNA interactions for Protein: Q9BY12

SCAPER, S phase cyclin A-associated protein in the endoplasmic reticulum, humanhuman

Predictions only

Length 1,400 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCAPERQ9BY12 AL136040.2-201ENST00000618431 1130 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SCAPERQ9BY12 LINC00969-294ENST00000627609 992 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SCAPERQ9BY12 SLC12A5-219ENST00000628272 401 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SCAPERQ9BY12 TTC23L-209ENST00000638320 1185 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SCAPERQ9BY12 AC079325.2-201ENST00000641710 606 ntAPPRIS P5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SCAPERQ9BY12 CNPPD1-201ENST00000360507 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SCAPERQ9BY12 CDK11B-207ENST00000626918 2457 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SCAPERQ9BY12 CDK11B-208ENST00000629289 2490 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SCAPERQ9BY12 PAK4-202ENST00000358301 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SCAPERQ9BY12 KCTD6-202ENST00000404589 1533 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SCAPERQ9BY12 AC021305.1-201ENST00000520656 1514 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
SCAPERQ9BY12 SLC25A45-201ENST00000294187 2196 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SCAPERQ9BY12 CD5L-201ENST00000368174 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SCAPERQ9BY12 UBAC2-AS1-201ENST00000426037 1771 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SCAPERQ9BY12 HHIP-202ENST00000434550 1770 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SCAPERQ9BY12 AC004834.1-201ENST00000640784 2412 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SCAPERQ9BY12 SERPINB6-206ENST00000380546 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SCAPERQ9BY12 AL513315.1-201ENST00000640756 1370 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SCAPERQ9BY12 ATG13-216ENST00000530500 2030 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SCAPERQ9BY12 GLS2-216ENST00000610413 2296 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SCAPERQ9BY12 CNOT8-201ENST00000285896 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SCAPERQ9BY12 ZNF586-202ENST00000396150 1977 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SCAPERQ9BY12 ZNF821-203ENST00000446827 1822 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SCAPERQ9BY12 ACSM2B-207ENST00000565232 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SCAPERQ9BY12 LMF2-202ENST00000474879 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SCAPERQ9BY12 NSFL1C-206ENST00000476071 2800 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SCAPERQ9BY12 EPHA10-203ENST00000427468 3167 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SCAPERQ9BY12 SGCA-201ENST00000262018 1432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SCAPERQ9BY12 TMEM176B-204ENST00000447204 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SCAPERQ9BY12 HRAT92-201ENST00000452622 3506 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SCAPERQ9BY12 INSIG1-201ENST00000340368 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SCAPERQ9BY12 TRMT44-201ENST00000389737 2799 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SCAPERQ9BY12 CDKN1A-203ENST00000405375 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SCAPERQ9BY12 ZNF77-201ENST00000314531 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SCAPERQ9BY12 TPBG-203ENST00000543496 2881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SCAPERQ9BY12 ADGRA1-AS1-201ENST00000366099 3236 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
SCAPERQ9BY12 LIMS1-201ENST00000332345 1235 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SCAPERQ9BY12 GSTT2B-202ENST00000404172 819 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SCAPERQ9BY12 AC108734.2-201ENST00000420887 1069 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
SCAPERQ9BY12 RASA3-IT1-201ENST00000454005 380 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SCAPERQ9BY12 AC244197.1-201ENST00000456494 951 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
SCAPERQ9BY12 AC027139.1-201ENST00000565286 951 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
SCAPERQ9BY12 RN7SL665P-201ENST00000578793 300 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
SCAPERQ9BY12 AC025048.2-201ENST00000590744 786 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SCAPERQ9BY12 ZBTB11-AS1-201ENST00000609682 2743 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
SCAPERQ9BY12 LAIR1-209ENST00000434277 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SCAPERQ9BY12 STK25-201ENST00000316586 4619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SCAPERQ9BY12 UBL4B-201ENST00000334179 1478 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SCAPERQ9BY12 POC1B-202ENST00000393179 3096 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SCAPERQ9BY12 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SCAPERQ9BY12 TRAK1-208ENST00000484786 2008 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SCAPERQ9BY12 ACTG1P17-202ENST00000560958 1662 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SCAPERQ9BY12 APTX-211ENST00000463596 1345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SCAPERQ9BY12 MRPL37P1-201ENST00000592451 1337 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
SCAPERQ9BY12 ANO1-201ENST00000316296 2118 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SCAPERQ9BY12 LTF-202ENST00000417439 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SCAPERQ9BY12 PSME3-202ENST00000441946 2944 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SCAPERQ9BY12 MIR3936HG-204ENST00000621103 1793 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SCAPERQ9BY12 EDN3-205ENST00000395654 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SCAPERQ9BY12 AC006372.4-201ENST00000624122 1543 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
SCAPERQ9BY12 GK-204ENST00000378945 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SCAPERQ9BY12 EVPL-202ENST00000586740 6223 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SCAPERQ9BY12 AL121758.1-201ENST00000488788 2714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SCAPERQ9BY12 C11orf49-203ENST00000378618 1166 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SCAPERQ9BY12 PTTG1IP-202ENST00000397886 755 ntTSL 4 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SCAPERQ9BY12 AL354892.2-201ENST00000413088 403 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SCAPERQ9BY12 RN7SL494P-201ENST00000461517 304 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
SCAPERQ9BY12 MSC-AS1-204ENST00000518916 864 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SCAPERQ9BY12 ATP6V0A2-207ENST00000544833 1013 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SCAPERQ9BY12 NACA-221ENST00000552540 1074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SCAPERQ9BY12 SNHG21-204ENST00000559366 674 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SCAPERQ9BY12 SIGLEC22P-201ENST00000599104 714 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
SCAPERQ9BY12 RAB3IP-204ENST00000378815 2386 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SCAPERQ9BY12 ZNF32-AS3-201ENST00000458063 1932 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SCAPERQ9BY12 GALNT17-201ENST00000333538 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SCAPERQ9BY12 ZMYND15-201ENST00000269289 2448 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SCAPERQ9BY12 RIMS4-201ENST00000372851 5203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SCAPERQ9BY12 CD24-204ENST00000619133 2513 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SCAPERQ9BY12 AC087481.3-201ENST00000602886 1894 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
SCAPERQ9BY12 AL136309.2-201ENST00000427049 2277 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SCAPERQ9BY12 IQCA1L-203ENST00000615129 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SCAPERQ9BY12 MLLT6-210ENST00000620609 2714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SCAPERQ9BY12 NLE1-203ENST00000586869 5286 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SCAPERQ9BY12 SSBP1-201ENST00000265304 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SCAPERQ9BY12 PYY2-201ENST00000315776 282 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
SCAPERQ9BY12 COX14-201ENST00000317943 708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SCAPERQ9BY12 MAPK13-202ENST00000373759 1036 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SCAPERQ9BY12 AC092580.1-201ENST00000433998 658 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
SCAPERQ9BY12 AC018638.5-201ENST00000450885 754 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
SCAPERQ9BY12 AL355803.1-201ENST00000455524 188 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SCAPERQ9BY12 AL365275.1-201ENST00000518570 471 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SCAPERQ9BY12 FXYD6-FXYD2-201ENST00000532984 670 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SCAPERQ9BY12 AP003390.1-201ENST00000533253 523 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SCAPERQ9BY12 HMGB1P24-201ENST00000611897 328 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
SCAPERQ9BY12 PORCN-204ENST00000361988 1672 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SCAPERQ9BY12 ARMC6-206ENST00000535612 2488 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SCAPERQ9BY12 AL731569.1-201ENST00000428940 3058 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SCAPERQ9BY12 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SCAPERQ9BY12 ZNF454-201ENST00000320129 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.11
SCAPERQ9BY12 A1BG-AS1-204ENST00000595302 2130 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 103.5 ms